| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,903,692 | 0 | C | A | 45.2% | 110.3 / 70.1 | 84 | intergenic (+318/+1055) | ygcE/queE | putative kinase/7‑carboxy‑7‑deazaguanine synthase; queosine biosynthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/44); new base A (38/0); total (40/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-22 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 | |||||||||||
GTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGA > NC_000913/2903542‑2903842 | gTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAc < 1:546755/151‑1 (MQ=255) tttACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAACa > 2:901117/1‑150 (MQ=255) aCAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTc < 1:1181176/150‑1 (MQ=255) cAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCAt < 1:301197/151‑1 (MQ=255) aaGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAACAAATCAtt > 1:1295106/1‑151 (MQ=255) aaGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCAtt < 2:309246/151‑1 (MQ=255) aGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTa < 2:629994/151‑1 (MQ=255) ggAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAACACTCATTa > 1:976878/1‑150 (MQ=255) gAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTGTTAAAAAACCCATTaac > 1:576107/1‑149 (MQ=255) ttAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTTAAAAAACTCATTAACCT‑Ca > 2:88271/1‑150 (MQ=255) tAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAACACCCCTTAACCT‑cca > 1:1115829/1‑148 (MQ=255) aaCTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑Caaa < 1:478617/150‑1 (MQ=255) tACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTTAAAACAAACATTTATCT‑Caaaaaa > 2:417806/1‑148 (MQ=255) acacTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAACACACATTATCCT‑CAaaaaaa > 1:791970/1‑150 (MQ=255) acTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGa < 1:1174818/151‑1 (MQ=255) cGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGAc < 2:1300261/149‑1 (MQ=255) cGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACaa < 2:995541/151‑1 (MQ=255) aTGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAACACACATTAACCT‑Caaaaaaaaaaaaaa > 1:1082695/1‑150 (MQ=255) tGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAACAACCCTTAACCT‑CCAaaaaaaaaaaaaa > 1:936876/1‑149 (MQ=255) gTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAACACCCATTTTCCT‑Caaaaaaaaaaaaaaaat > 1:288670/1‑148 (MQ=255) gTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACt < 1:1135864/150‑1 (MQ=255) gTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATACATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACt < 2:818437/150‑1 (MQ=255) aGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTTAAAACAATCAATATAAT‑CAAAAAAAAAAAAAAACTCC‑aca > 2:1073623/1‑148 (MQ=255) aaTAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAACACTCATTATCCT‑CAAAAAAAAAAAAAAATTTC‑AGAttt > 2:47996/1‑151 (MQ=255) aTAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAAAACCCATTATCCT‑CCAAAAAAAAAAAAAAATCC‑AAAtttt > 2:1051186/1‑150 (MQ=255) aTAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATtta < 1:865203/151‑1 (MQ=255) tAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTTAAAACACTCAATATACT‑CCAAAAAAAAAAAAAAATCC‑AGAttttt > 1:1172223/1‑149 (MQ=255) tAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAACACACATTTACCT‑CCAAAAAAAAAAAAAAATTC‑ACATttat > 2:20064/1‑151 (MQ=255) tAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAAAAATCATTATTCT‑CAAAAAAAAAAAAAAAATAC‑AGATttat > 2:636498/1‑151 (MQ=255) aCAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTa < 1:831372/151‑1 (MQ=255) cAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTTAAAACAAACATTTTCCC‑CAAAAAAAAAAAAAAAATCC‑CAATTTTTTAt‑ttt > 2:795234/1‑149 (MQ=255) cAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAACACTCATTAACCC‑CCAAAAAAAAAAAAAAATCC‑AGAAttttttattt > 1:270406/1‑145 (MQ=255) tACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAACAATCATTATCCT‑CAAAAAAAAAAAAAAATTCCTAAATTTtttat‑ttacc > 2:522302/1‑148 (MQ=255) aCGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCa < 1:1004630/150‑1 (MQ=255) aCGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAACACCCATTAACCT‑CAAAAAAAAAAAAAAATTCC‑AGATTTTTTTT‑TTAACCa > 1:904210/1‑150 (MQ=255) aaTCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTTAAAAAACACATTATCCT‑CCAAAAAAAAAAAAAAATTC‑AGATTTATTAT‑TTTAACAAta > 2:1069684/1‑149 (MQ=255) aaTCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAACGa < 2:744645/151‑1 (MQ=255) aTCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGaa < 1:734572/151‑1 (MQ=255) tCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAAAACTCATTAACCT‑CAAAAAAAAAAAAAAATTTC‑ACAtttttttttttaacaataaa > 2:661900/1‑136 (MQ=255) ttATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACaa < 1:145902/149‑1 (MQ=255) ttATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACaa < 1:315273/149‑1 (MQ=255) ttATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAg < 2:58358/150‑1 (MQ=255) ttATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAg < 1:1125323/150‑1 (MQ=255) aTCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCtt < 2:621979/151‑1 (MQ=255) tCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAAAACTCATTTTCCT‑CAAAAAAAAAAAAAAAATTC‑AGATTTTTTAT‑TTTACaaaaaaaaaaaaaaact > 2:830156/1‑136 (MQ=255) cAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTaa < 2:1358324/151‑1 (MQ=255) aaTTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTGTAAAAACACTCATTAGACT‑CAAAAAAAAAAAAAACTTTC‑CGATTTTTTTT‑TTTAACAAAGAAT‑AAAAAACTTaa > 1:1195341/1‑150 (MQ=255) tttCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTaaaaa < 2:397446/150‑1 (MQ=255) tCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAACACTCCTTAACCTCCAAAAAAAAAAAAAACTT‑C‑AGATTTTTTTT‑TTTACCCAATAAA‑AAAAAACTTaaaaaaa > 1:524029/1‑149 (MQ=255) cACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAACACACATTATCCT‑CCAAAAAAAAAAAAAATTTC‑CGATTTTTTAT‑TTTAACAAAGAAA‑AAAAAAATTaaaaaaaa > 2:594009/1‑148 (MQ=255) cACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAAAACTCATTATCCT‑CAAAAAAAAAAAAAAAATCC‑AGATTTATTTA‑TTTAACAAAGAAA‑AAAAAAAATaaaaaaaa > 2:963317/1‑148 (MQ=255) cACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAata < 1:88274/150‑1 (MQ=255) tAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAAAACTCCTTATCCT‑CAAAAAAAAAAAAAAAATCC‑CGAATTTTTTT‑TTTACAAAAAAAA‑AAAAAACATAAAAAAaataatt > 2:524523/1‑148 (MQ=255) aGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTa < 1:672327/151‑1 (MQ=255) tATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTGTAAAAACACTCATTAACCT‑CAAAAAAAAAACAAAAATCC‑AAATTTTTTTCTTTAACAAAGAAAA‑AAAAAACTTAAAAAA‑ATAATGTtttt > 1:876966/1‑151 (MQ=255) tGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTTAAAAAACCCATTATTCT‑CCAAAAAAAAACAAAATTCC‑CAATTTTTTTT‑TTTAACAACTAAT‑AAAAAACTTAAAAAAaataattttttttt > 1:27247/1‑141 (MQ=255) aCTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAGTGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTaaa < 1:1035058/151‑1 (MQ=255) aCTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTaaa < 2:1316996/151‑1 (MQ=255) tGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAAAACTCCTTTACCT‑CCAAAAAAAAAAAAAAATCC‑ACAATTTTTAA‑TTTACCCAATAAA‑AACAAAATTAAAAAAAAAAATTTTAtttttaaa > 2:1132104/1‑144 (MQ=255) ggATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGa < 1:714521/150‑1 (MQ=255) ggATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGa < 2:162014/150‑1 (MQ=255) ggATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGa < 2:1256875/150‑1 (MQ=255) atatCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAACACTCATTAACCC‑CCAAAAAAAAAAAAAAATCC‑CGATTTATTAC‑TTAAACAAAGAAA‑AAAAAACTTAAAAAAAAAAATGTTTTTTTTaaaaaa > 1:1188852/1‑150 (MQ=255) ttATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAAt < 2:1015812/148‑1 (MQ=255) ttCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTTTAAAAACACCCATTATCCT‑CAAAAAAAAAAAAAAAATCC‑AGATTTATTAC‑TTTACCAATGAAT‑AAAAAACTTAAAAAAAAAAATGTTATTTTTAAAAAAAAAATaaaa > 2:408045/1‑148 (MQ=255) cATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAgg < 1:806755/150‑1 (MQ=255) cATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGCGTTTTAAAAACAATCTTTATCCT‑CAAAAAAAAAACAAACTTAC‑AGGTTTATTACTTTAACCCAT‑AAA‑AAAAAAAATAAAAAAAATAAAGTTTTTTTTAATAAAAAAATaaaaagc > 2:177994/1‑146 (MQ=255) tAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTAAAAAAACCCACTAGCCT‑CCAAAAAAAAAAAAACTTTC‑AGCTTTTTTTC‑TTAAACAATTAATAAAAAAACTTAAAAAA‑ATAATTTTTTTTTAAAAAAAAAAATAACCGCCAt > 1:1018920/1‑151 (MQ=255) aGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTTTGTGCAAACCCACCTTATTCA‑CAAAAAAAAAACAAACCTTC‑CCATTTATTTC‑TTTAACAAAGAAT‑AAAAAACCTTAAAAAAATATTGTTTTTCTTAAGAAAAAAATaaaaaggatt > 1:338703/1‑142 (MQ=255) aCTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAAtt < 2:1089924/151‑1 (MQ=255) aTTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTc < 1:64575/149‑1 (MQ=255) aTTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCaa < 2:711150/151‑1 (MQ=255) atcaACAGCGTATAGAGGCGGTTATTTTAAAACCCTCATTAACCC‑CAAAAAAAAAAAAAAAATTC‑CGATTTTTTTT‑TTTAACAAAAAAA‑AAAAAAATTAAAAAAAATAATTTTTTTTTTAAAAAAAAAATAAAAAGCATTAAATCAAAAtt > 1:969473/1‑151 (MQ=255) atcaACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATAtt < 2:1298090/151‑1 (MQ=255) caACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTaa < 1:268500/151‑1 (MQ=255) cAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTaaaaa < 2:559114/151‑1 (MQ=255) cAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAAACACCCATTAGCCT‑CCAAAAAAAAAAAAAATTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAAAGAAA‑AAAAAACTTAAAAAAAATAATGTTATTTTAAAGAAAAAAATAAAAAGCATTAATTTAATATTaaaa > 1:1326920/1‑150 (MQ=255) agGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGAt < 1:430148/151‑1 (MQ=255) agGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGAt < 2:119088/151‑1 (MQ=255) gTTATGTAAAACGACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTaaa > 2:787721/1‑150 (MQ=255) aTGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAAttt < 1:1363605/151‑1 (MQ=255) aTGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAAttt < 1:267981/151‑1 (MQ=255) aaaaCCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCtt < 1:540608/150‑1 (MQ=255) aaaaCCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCtt < 1:1216811/150‑1 (MQ=255) aaaaCCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCtt < 2:529314/150‑1 (MQ=255) ccACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGa < 1:289048/151‑1 (MQ=255) | GTTTTTACAAGGAATATTAACTACACTCGATGTCTTTAGAATAAAAGACAATACGAATCGCACTTTATCAATTTTCACTTAAAGTATGAACTGGATATCTTTATTCATAAGAACTATTCATCAACAGCGTATAGAGGCGGTTATGTAAAACCACTCATTAGCCT‑CAAAACAAAGACAAACTTCC‑AGATTTATTAC‑TTAACCAATGAAT‑AACAAGCTTAAAAAATATACTGTTATTCTAAAGAAAAAATTAACAGGCATTAATTCAATATTAAAAAAATAATAGATTAAAATTTCTTAACGA > NC_000913/2903542‑2903842 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |