| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913_3_hsa_pgi | = 4237464 | 1044 (19.550) | 3 (0.060) | 3/260 | NT | 0.30% | coding (540/738 nt) | yjbG | extracellular polysaccharide export OMA protein |
| ? | NC_000913_3_hsa_pgi | = 4237500 | 1003 (19.510) | coding (576/738 nt) | yjbG | extracellular polysaccharide export OMA protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1187 total aligned reads displayed.
CGTTGCAGGGCAACTACACGCTGTGGGTCGGACCACCGCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATG > NC_000913_3_hsa_pgi/4237316‑4237612 | tggaaGGGCAACTCCAGGCTTTGGGTCGGTCCAGCGCCGTCCACGGTCCCGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGACATTCATTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGa < 2:409616/145‑1 (MQ=255) aGGGCAACTACACGCTGTGGGTCGGACCACCGCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGTAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGc < 2:204400/149‑1 (MQ=255) ggCAACTAAACGGTTTGGGTCGGATCACCGCTGTCCGCGGTCAGGTTGGTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAg < 1:311671/149‑1 (MQ=255) aaCTACACGCGGTGGGTCGGCCCACCGCCGTCCACGGCCACGTTGTTCGGGCTTAGCAGCCGTCCGGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTGGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTa < 1:58895/149‑1 (MQ=255) acGCTGTGGGTCGGACCACCGCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCgtg > 1:754561/1‑149 (MQ=255) cGCTGGGGGTCGGACCACCGCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCATGCAGCCATTCACTCCAGGGTTTGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCgtgg < 1:893838/149‑1 (MQ=255) gtgtgGGTCGGGCCACCGCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCACAGCTACGCgtgggt < 1:853751/148‑1 (MQ=255) tgtgGGTCGGAGCACCGCCGTCCGCGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCgtgggtg > 2:745041/1‑149 (MQ=255) gtgGGTCGGACCACCGCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCgtgggtgg < 1:940782/149‑1 (MQ=255) tgGGTCGGACCACTGCCGTCCACGGTCACGTGGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGACATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGggtggt < 1:155796/149‑1 (MQ=255) tgGGTCGGACCACCGCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGgggggt > 2:566755/1‑149 (MQ=255) gTCGGACCACGGCCGGCCAGGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTa < 2:184757/149‑1 (MQ=255) gcGGACCACCGCCGTCCACTTACACGTTGTTCGGGCTTGTCAGCCGTCCAGGCAGGCAGCCATTCACTCCCGCTAGCCACGTGGCGCGCTATCTCGCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGGGGAACGGAGCTACGCgtgggtgtgttcc > 2:136535/2‑143 (MQ=255) cGGACCACGGCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTAGCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTAcc < 2:390862/149‑1 (MQ=255) cGGACCACCGCCGTCCCCGGTCACGTTGTTTGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTAcc < 2:619661/149‑1 (MQ=255) cGGACCACCGCCGTCAACGGTTACGTTGTTCGGGCTAATCAGCCTTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTAcc < 2:449169/149‑1 (MQ=255) ggACCACCGCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTAccc < 2:783164/149‑1 (MQ=255) gcaccagcGCCGTCACCCGCCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTAGCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTAcac < 2:124780/147‑3 (MQ=255) 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tCACGTTGTTCGTGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGAGCCGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGTAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCaaaaa < 1:835733/149‑1 (MQ=255) tCACGTTGTTCGGGCTTATCATCCGTTCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTGGCGACGTGGCGAGCGATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCaaaaa < 1:562874/149‑1 (MQ=255) cACTTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGTCAAGCATCCATTCCCTTCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAg < 1:386099/149‑1 (MQ=255) ttgtgCGGGCTGATCAGCCGCCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGcc < 2:465972/149‑1 (MQ=255) ttCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAACCAGCGTTACGCGCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCggg > 1:241410/1‑148 (MQ=255) 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aGCTATCTCTCTG‑ACTAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTTGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCGGGCAGCATTATTTATGTTgg > 1:441992/1‑149 (MQ=255) gaactctctG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTGCTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCt < 2:1001901/146‑1 (MQ=255) aTCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATATTGGCCTc > 2:224905/1‑149 (MQ=255) tctctcTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTATCGTAGTGCCGATGCCCGACCGCATTATTTATGTTGGCCTcg > 1:778716/1‑149 (MQ=255) ctctcgT‑ACCAGAGCCTGCGCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTcgc < 1:219869/149‑1 (MQ=255) tctctG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTcgcg > 1:255607/1‑149 (MQ=255) tcgctG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTcgcg < 1:335089/146‑1 (MQ=255) tctG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTAccc > 1:620190/1‑56 (MQ=255) tctG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATCCCCGCCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGa > 2:550855/1‑149 (MQ=255) tG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACt < 2:327004/89‑1 (MQ=255) cccAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGCCGGACGCACGCAAAACGCGCCGGTGGCTTATTGGAACAAGCGTCACGTAAAGCCGATGCCCGGTAGCCTTATTTAAGTTGGCCTCGGGGACTcc > 1:36347/2‑149 (MQ=255) agagCCTGCTTAGGGGGGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTc < 1:718093/149‑1 (MQ=255) agagCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTc > 2:363152/1‑149 (MQ=255) actgCCTGCTGAGCGGTGGGGAGCGGAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGAAGAAAACAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTc < 2:500378/146‑1 (MQ=255) ccTGCCCAGCGGGTCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGa < 2:153453/149‑1 (MQ=255) cTCAGCGGTGCGGACTGATGCTACGCGTGGGTGGCCTCCCCAGACGGACTCATGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTAGTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTga < 2:962852/149‑1 (MQ=255) tCAGCGGTGGGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACGCGGACGGACGCACGAAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTgag < 1:394144/149‑1 (MQ=255) tCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTgag < 2:243446/149‑1 (MQ=255) cAGCGGGGGCGAGCGCAGTTACGCGGGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGTTGTCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTgaga < 2:813396/149‑1 (MQ=255) tgcctgcgtccgtccgggtaaaccacccacgcgtagctgcgatccgcaccgctgagcaggctctggtcagagagatagctcgccacgtcgcgacctggagtgaatggctgcttgccaggacggctgataagcccgaacaacgtgaccgt < 2:908368‑M1/145‑142 (MQ=255) gTGCGtccgtgcgggtaaaccacccacgcgtagctgcgatccgcaccgctgagcaggctctggtcagagagatagctcgccacgtcgcgacctggagtgaatggctgcttgccaggacggctgataagcccgaacaacgtgaccgtgga > 1:575974‑M1/1‑5 (MQ=255) gTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGAcgcaccgctgagcaggctctggtcagagagatagctcgccacgtcgcgacctggagtgaatggctgcttgccaggacggc > 1:105429‑M2/1‑41 (MQ=255) tGCGtccgtccgggtaaaccacccacgcgtagctgcgatccgcaccgctgagcaggctctggtcagggagatagctcgcctcgtcgcgacctggagtggatgactgcttgccaggacggctgatcagcctgaacaacgtgacggtggag > 1:207948‑M1/1‑4 (MQ=255) tGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTgg > 2:656612/1‑117 (MQ=255) gCGGATGGCAGCTAGGCGTGCGTGGTTTACCCGGACCGACGAACGCAACAATCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGTCTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGa < 1:461570/149‑1 (MQ=255) gCGGATCGCAACTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGa < 1:280095/149‑1 (MQ=255) gtccgtccgggtaaaccacccacgcgtagctgcgatccgcaccgctgagcaggctctggtcagagagatagctcgccacgtcgcgacctggagtgaatggctgcttgccaggacggctgataagcccgaacaacgtgaccgtggacggc > 2:48042‑M1/1‑1 (MQ=255) | CGTTGCAGGGCAACTACACGCTGTGGGTCGGACCACCGCCGTCCACGGTCACGTTGTTCGGGCTTATCAGCCGTCCTGGCAAGCAGCCATTCACTCCAGGTCGCGACGTGGCGAGCTATCTCTCTG‑ACCAGAGCCTGCTCAGCGGTGCGGATCGCAGCTACGCGTGGGTGGTTTACCCGGACGGACGCACGCAAAAAGCGCCGGTGGCTTACTGGAACAAGCGTCACGTAGAGCCGATGCCCGGCAGCATTATTTATGTTGGCCTCGCGGACTCCGTCTGGAGTGAGACGCCTGATG > NC_000913_3_hsa_pgi/4237316‑4237612 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |