| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_KO_pgi | 1086010 = | 68 (1.340) | 6 (0.130) | 6/268 | 6.1 | 8.2% | coding (1019/1065 nt) | phoH | ATP‑binding protein; putative PhoH family P‑loop ATPase |
| ? | NC_000913_3_KO_pgi | 1086040 = | 71 (1.490) | coding (1049/1065 nt) | phoH | ATP‑binding protein; putative PhoH family P‑loop ATPase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGTGATATCACGCAATGCGATTTGCCTCGCGGCGTGTGCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTATTTGCCCCTGGCTGGTGAAGTGTACGCTCATCCTGTGGCTT > NC_000913_3_KO_pgi/1085895‑1086187 | ggTGATATCACGCAATGCGATTTGCCTCGCGGGGTGTGCTCTGGATTAAGGTGCTCGCTGGAACTTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGTGGACTGCGTACTTTCGGCTCTTTGCCAACGTACGCTgta < 2:109925/149‑3 (MQ=255) gTGATATCACGCACTGCGCTGTGCCTTGCGGCGTGTGCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGCAGCCCTTTGGACCATCAGCTGGCAGT‑ATTTGGACTGCGTACGTTCCGCACTTTGCCAACGTACGCTGCAt < 1:666168/149‑1 (MQ=255) atCACGCAATGCGATTTGCCTCGCGGCGTGTGCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCCCTTAGCCCGCGTACGCTGCATGCCTa > 2:224166/1‑149 (MQ=255) atCACGCAATGCGATTTGCCTCGCGGCGTGTGCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTa > 1:243440/1‑149 (MQ=255) tCACGCAATGCGATTTGCCTCGCGGCGTGTGCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGGCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTAc > 1:243589/1‑149 (MQ=255) cACGCAATGCGATTTGCCTCGCGGCGTGTGCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGCTCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTAGGTTAGGCACTTTGCCAACGGTCGCTGCGTGCCTACa > 2:127150/1‑149 (MQ=255) aCGCAATGCGATTTGCCTCGCGGCGTGTGCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCCACGTACGCTGCATGCCTACAg > 2:885871/1‑149 (MQ=255) cGCAATGCGATTTGCCTCGCGGCGTGTGCTCCGGCTTCAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCGGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGt > 2:418134/1‑149 (MQ=255) cGCAATGCGATTTGCCTCGCGGCGTGTGCTCCGGAAACCGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGt > 2:418123/1‑149 (MQ=255) aaTGCGATTTGCCTCGCGGCGTGTGCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTaa > 1:249592/1‑149 (MQ=255) gCCTCGCGGCGTGTGCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATc > 2:80002/1‑149 (MQ=255) ccTCGCGGCGTGTGCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCg < 2:601887/149‑1 (MQ=255) cTCGCGGCGTGTGCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTTCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTATTATCgg > 2:863356/1‑149 (MQ=255) tCGCGGCGTGTGCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGt > 2:67976/1‑149 (MQ=255) tgCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCg > 2:677860/1‑149 (MQ=255) gCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCgg > 1:581459/1‑149 (MQ=255) cTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCggg < 1:168742/149‑1 (MQ=255) cTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGACGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCggg > 1:793008/1‑149 (MQ=255) tCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGTCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGc > 2:512643/1‑149 (MQ=255) tCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGc > 1:49940/1‑149 (MQ=255) ccGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCg > 1:480023/1‑149 (MQ=255) tGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGGCCTGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGAGCGAAACgggagt > 1:714785/1‑146 (MQ=255) gACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCttt < 1:677860/149‑1 (MQ=255) aCGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTACGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGCACCGTGCGTTg > 2:831657/1‑149 (MQ=255) cgcgCTGGAACGTCTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGt < 1:604825/149‑1 (MQ=255) cgcTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGttt < 1:80002/149‑1 (MQ=255) gcTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGtttt < 1:224166/149‑1 (MQ=255) cGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGtt < 1:289135/149‑1 (MQ=255) ttCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTTGGTGTTTAt > 1:105405/1‑149 (MQ=255) agaagaTGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCg < 1:513546/149‑1 (MQ=255) agaagaTGAAACGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCg < 2:552331/149‑1 (MQ=255) gaagaTGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGt > 1:418076/1‑103 (MQ=255) gaagaTGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGt < 2:418076/103‑1 (MQ=255) gaagaTGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCgg > 1:469799/1‑149 (MQ=255) aagaTGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGACGAGCCCCGGGGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGa > 1:390893/1‑149 (MQ=255) agaTGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTACAGAGGACTGCGTACGGTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTACGTGGCTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTCGGTTTTGGGGGTTTATGCCCGGAc > 2:457609/1‑149 (MQ=255) gaTGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCg > 1:124343/1‑145 (MQ=255) gaTGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCg < 2:124343/145‑1 (MQ=255) gaTGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACt > 2:810705/1‑149 (MQ=255) cggAAAGGGGTGGGATGGTCCGGT‑TCGGCAAACAACGCTGCTGGTGGCGGTCAGTTTTCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTGAGTGTGTTAGCGGTGCAGGGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTa < 2:868063/147‑1 (MQ=255) aTGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTa < 1:810705/149‑1 (MQ=255) aTGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTATTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTa < 1:785109/149‑1 (MQ=255) gAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAgc < 1:652877/149‑1 (MQ=255) aTGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAgtgt < 2:700364/85‑1 (MQ=255) aTGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAgtgt > 1:700364/1‑85 (MQ=255) ttGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCttttt > 2:599150/1‑149 (MQ=255) gATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTgg > 2:537651/1‑148 (MQ=255) gATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGa > 2:241084/1‑149 (MQ=255) cGTCCGGT‑GCGGGAAAGAGGACTGCGGACGTTCGGCACTTTGCCAACGTAAGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAaac < 1:107728/149‑1 (MQ=255) tCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAaacaa < 1:599150/149‑1 (MQ=255) gT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATg > 1:610257/1‑118 (MQ=255) gT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATg < 2:610257/118‑1 (MQ=255) gT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCAt < 2:560639/149‑1 (MQ=255) t‑tCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGCTAAGGGTGGTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTGTGCCCGGGCTGGCGCTTGTTCTGAAACAACCAta > 1:302875/1‑148 (MQ=255) cGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTCAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCTAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCAtttt < 2:788653/149‑1 (MQ=255) gTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCg < 2:458921/91‑1 (MQ=255) gTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCg > 1:458921/1‑91 (MQ=255) tAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTGGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCATAGCCCGGGCGAACCGGGCTTGGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAACCAACCATTTTTAt < 2:422698/149‑1 (MQ=255) gagGTCTGCGTACGTTCGGCTCTTTGCCAACGTTCGCTGCAGGTCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCTCGGGCGAACCGGGTTTTGTTTTGGGTGTTTTTGCCCGGACTTGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTACTTGc < 2:899044/149‑1 (MQ=255) gACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTCTTTGcccc > 2:455353/1‑149 (MQ=255) gCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTATTTGCCCctggc > 1:25178/1‑149 (MQ=255) ttCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGtttt < 2:275993/83‑1 (MQ=255) ttCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGtttt > 1:275993/1‑83 (MQ=255) ttCGGCACGTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTATTTGCCCCTGGCTGGTGaa < 1:98046/149‑1 (MQ=255) ggCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTATTTGCCCCTGGCTGGTGAAgtg > 1:853666/1‑149 (MQ=255) cACTTTGCGAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTATTTGCCCCTGGCTGGTGAAGTGTa < 2:136397/149‑1 (MQ=255) cACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTATTTGCCCCTGGCTGGTGAAGTGTa < 2:853666/149‑1 (MQ=255) cACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTATTTGCCCCTGGCTGGCGGAGTGTa > 1:532787/1‑149 (MQ=255) cAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGCGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTATTTGCCCCTGGCTGGTGAAGTGTACGCTCATc > 2:594555/1‑149 (MQ=255) cAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTATTTGCCCCTGGCTGGTGAAGTGTACGCTCATc < 2:49940/149‑1 (MQ=255) cAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTATTTGACCATGGCGGGTGAAGTGTACGCTCagc > 1:842556/1‑147 (MQ=255) cGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTATTTGCCCCTGGCTGGTGAAGTGTACGCTCATCCtg < 1:763218/149‑1 (MQ=255) cTGCATGCCTACAGTTACGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTGTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCCGTCACAAGCATTTTTTTTTGCCCCTGTTTGGTGACGTTTACGCCAATCCTGTGGcct > 2:164395/1‑147 (MQ=255) cTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTATTTGCCCCTGGCTGGTGAAGTGTACGCTCATCCTGTGGCtt < 1:75077/149‑1 (MQ=255) | GGTGATATCACGCAATGCGATTTGCCTCGCGGCGTGTGCTCCGGATTAAGTGACGCGCTGGAACGTTTCGAAGAAGATGAAATGGTTGGGATCGTCCGGT‑TCGGTAAAGAGGACTGCGTACGTTCGGCACTTTGCCAACGTACGCTGCATGCCTACAGTTAAGTGTGTTATCGGTGCAGAGCCCGGGCGAACCGGGCTTTGTTTTGGGTGTTTATGCCCGGACTAGCGCTTTTTCTGAAACAACCATTTTTATTTGCCCCTGGCTGGTGAAGTGTACGCTCATCCTGTGGCTT > NC_000913_3_KO_pgi/1085895‑1086187 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |