| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_KO_pgi | 2219625 = | NA (NA) | 5 (0.100) | 5/272 | 6.7 | 6.7% | noncoding (1/34 nt) | REP152 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP152 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913_3_KO_pgi | 3114542 = | 70 (1.450) | noncoding (165/168 nt) | REP219 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 3 REP sequences | REP219 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 3 REP sequences | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGACTGGCTCACACCGCCCTCGAAGCTCATCTCGCTCGCCCC > NC_000913_3_KO_pgi/3114394‑3114687 | aaCGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATAGCGACATTCCCAGTATGTAGGGCCGATAAGCAAGGGCATCGGGCAAATTTGGTAACCCGGTGCGCCTTCTTTCCTGCCAGATGACGGCGACAAC‑CCTTATCCCGcc > 2:264670/1‑149 (MQ=255) aCGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCTGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCt > 1:765979/1‑149 (MQ=255) ttATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGAGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGCTG‑CGGCGCGCGCGCCTTATCCGTCCTACggg > 2:392028/1‑149 (MQ=255) tATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGc < 2:407782/149‑1 (MQ=255) tCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCtt > 1:466062/1‑149 (MQ=255) ccGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTa < 2:448366/149‑1 (MQ=255) gTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCATTAGTTCATGCCTGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACt > 1:748800/1‑149 (MQ=255) tACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCGCGTAAGAAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTCCTGGGc > 2:829419/1‑149 (MQ=39) tACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGc > 1:600697/1‑149 (MQ=255) aCGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCa < 2:508311/149‑1 (MQ=255) ggTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGAc < 2:659993/149‑1 (MQ=255) ggTGTCTGCCAGCCCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGAc < 2:661848/149‑1 (MQ=255) ggTGTCTGCAAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGTGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGAc < 1:182839/149‑1 (MQ=255) gtgtCTGCCAGCGCAAATGATCGCGGCTTTGCGCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCGTCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTCCGGGCTTACCGGGCAGACa > 2:135198/1‑149 (MQ=39) gtgtCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACa > 2:706457/1‑149 (MQ=255) tccgcgcAAAACATCGCGGTGTGCCTCGGCGGAAGGCCCGAACAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCAGGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTAGCCGGTCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATg < 2:289508/146‑1 (MQ=255) gcAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATg < 1:235178/148‑1 (MQ=255) aGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCt > 1:122333/1‑149 (MQ=255) cgcAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCg < 1:560355/149‑1 (MQ=255) ataatCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTGACCCGGTGCGCCTGATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAAc > 2:501833/1‑149 (MQ=255) tCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGa < 1:499449/149‑1 (MQ=255) ggCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTaa < 1:747107/149‑1 (MQ=255) gCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAAt > 1:652399/1‑149 (MQ=255) gCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAAt < 1:743414/149‑1 (MQ=255) cTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCTCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGAGATCTTGTGCTCGGTAATCTGATTAATg < 2:308257/149‑1 (MQ=255) tttCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATgg > 2:602043/1‑149 (MQ=255) cccGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTc > 2:747140/1‑149 (MQ=255) cGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCg > 1:366486/1‑149 (MQ=255) cGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCg < 2:600697/149‑1 (MQ=255) tCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGt < 2:773210/149‑1 (MQ=255) gcagacgCCCGAGAAGCATGCGCATCGGGCAAATGTGTTAATCCGGTGCCCCTTATTGCATGCCCGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGCGCTTACTCGGCAGACATCGTACGCTCGGTAACCTGATTAATGGCTTCCGGTc < 2:567980/143‑1 (MQ=255) cTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTc < 2:567367/149‑1 (MQ=255) cTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTc < 2:342485/149‑1 (MQ=255) tGTCGGCCCGATAAGTCGGCGCATGGAGGCAATGTGTTCACACTGTCATCCTTATTTGATGCCGGATG‑ATGTGCGTGCGCGTTATCCTGTCCACTGTCTTACTTGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTcc < 2:666707/149‑1 (MQ=255) tGTAGGCCCGATAAGCAGGGGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCTTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTcc < 2:277834/149‑1 (MQ=255) cccGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTc < 1:378467/149‑1 (MQ=255) ccagtAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTGAGCCCGGGGCGCCTTATTCCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTCGCCGGCCTACGGGCTTTCTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTAAGTAATGGTTTCCGGTCCCTCTTcc < 2:60554/145‑1 (MQ=255) cGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTCTCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCg < 1:404801/149‑1 (MQ=255) aGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTc > 1:738893/1‑149 (MQ=255) gCAGGAGCATCGGACAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCGGGTTTCg > 2:786838/1‑149 (MQ=255) ggCGCATGGGGCCAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCa < 2:171939/149‑1 (MQ=255) cgcATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGa < 2:102850/149‑1 (MQ=255) cATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATc < 1:755818/149‑1 (MQ=255) gggCAAATGTGTGACCCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGCGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGTTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGt < 2:315738/149‑1 (MQ=255) ggCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGAGG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTATTCGGCAGACATCTTATGCTCGATAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGGTTACGTAGATCAAGTg > 2:24603/1‑149 (MQ=38) aaTGGGTTAACCCGGGGCGCGTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTGAGCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGCTCGCTGGTTCGGTGTCGGCAGAGCGAGTGAcgc < 2:103946/149‑1 (MQ=255) tAACCCGGTGGTGCATATTGCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCGTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCgtg < 2:365162/149‑1 (MQ=39) tAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCgtg < 1:901300/149‑1 (MQ=255) ccccGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGtgtt < 1:380649/148‑1 (MQ=255) aCCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGGCATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGCTCTGATGACGCCAGCGtgtt > 2:140144/1‑149 (MQ=39) aCCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGtgtt < 1:459103/149‑1 (MQ=255) ggggtgcCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAGCCTGATTAATGGTTTCCGGTCAATGTTCCGGTCTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTaa < 1:706457/144‑1 (MQ=39) ggTGCTCCTTATTTCATACCGGGTG‑CGCCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTaa < 1:842280/149‑1 (MQ=255) ggTGCGCCTCATTTCATGCCGGGTG‑CGGCGCGGGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACAACCTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTaa < 2:164992/149‑1 (MQ=255) tGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGc < 2:466062/149‑1 (MQ=255) cgcCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCg > 1:13312/1‑149 (MQ=255) cTTATTTCATGCCGGGTG‑CGGCGCGAGAGCCTTATCCGGCCTAGGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAGCCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTTCGGTTTCGGCAGCTCGAGTATCGCGAGCGTGTTGTTCGTCGACt > 2:429443/1‑149 (MQ=255) cTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGa < 2:582068/131‑1 (MQ=255) cTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGa > 1:582068/1‑131 (MQ=255) tATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATACGGCCTACGGGCTTACTTGGCAGACATCTTATGCTCTGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGACTgg < 2:351733/149‑1 (MQ=255) aTTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATGCGGCCTACGCCCTTACCCAAAAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGACTGGc < 1:345044/149‑1 (MQ=255) aTTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGt < 1:183379/106‑1 (MQ=255) aTTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGt > 2:183379/1‑106 (MQ=255) tcgtGCCGGATG‑CGGCGGGAGGGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTGGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGACTGGCTca < 2:155545/146‑1 (MQ=255) aTGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGtgttg > 1:197683/1‑131 (MQ=255) aTGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGtgttg < 2:197683/131‑1 (MQ=255) cGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGCCTGGCTCACACCGc > 1:60507/1‑149 (MQ=255) g‑cggcgCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGACTGGCTCACACCGCCCTCg < 1:648221/149‑1 (MQ=255) ggcgCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGACTGGCTCACACCGCCCGCGaa > 1:636121/1‑149 (MQ=255) gcgcCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGACTGGCTCACACCGCCCTCGAAGCTCAtc < 2:13312/149‑1 (MQ=255) caTCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTCAGCCGTCCTGCGGTCACCGCCCTCGAAGCTCATctcgctc < 1:441821/148‑1 (MQ=255) tCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGACTGGCTCACACCGCCCTCGAAGCTCATCtcgctcgc > 2:64061/1‑149 (MQ=255) ggCCGACGGGCTTACTCGTCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGACTGGCTCACACCGCCCTCGAAGCTCATCTCGCTCGtccc < 2:608647/149‑1 (MQ=255) | AACGCCTTATCCGTCCTACGGGTGTCTGCCAGCGCAAATAATCGCGGCTTTCCCCGTCTGTAGGCCCGATAAGCAGGCGCATCGGGCAAATGTGTTAACCCGGTGCGCCTTATTTCATGCCGGATG‑CGGCGCGAGCGCCTTATCCGGCCTACGGGCTTACTCGGCAGACATCTTATGCTCGGTAACCTGATTAATGGTTTCCGGTCCCTGTTCCGGTTTCGGCAGATCGAGTGACGCGAGCGTGTTGTAAGCCGACTGGCTCACACCGCCCTCGAAGCTCATCTCGCTCGCCCC > NC_000913_3_KO_pgi/3114394‑3114687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |