| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 4094310 = | NA (NA) | 5 (0.090) +GCAATAGTTGTAG |
5/256 | 7.5 | NA | intergenic (‑38/+413) | rhaD/rhaA | rhamnulose‑1‑phosphate aldolase/L‑rhamnose isomerase |
| ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 4285325 = | NA (NA) | noncoding (42/77 nt) | REP320 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP320 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTATC > NC_000913_3_hsa_tpiA/4285177‑4285472 | gATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATg < 1:628807/149‑1 (MQ=255) aTAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGc < 1:495509/149‑1 (MQ=255) aTAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGc < 1:394786/149‑1 (MQ=255) aTAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGc < 1:23211/149‑1 (MQ=255) aTAAAGAGGGCTCTTCATCACAGAGTCTCCAGACGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTGATGGGAGAAGGTTAACGTTCGGGTAACCCTTGCCGAAGGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGc < 2:570007/149‑1 (MQ=38) tAGTGCCAATCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGAt < 1:259909/149‑1 (MQ=255) aGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATg < 2:913444/149‑1 (MQ=255) gTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGc < 2:422143/149‑1 (MQ=255) tGCCATTCATCACAGATTCTCCAGCGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTGTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCGGATGcc > 2:644060/1‑148 (MQ=255) ccATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCCCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGAc > 2:166532/1‑149 (MQ=255) cATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCt > 2:288813/1‑140 (MQ=255) cATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCt < 1:288813/140‑1 (MQ=255) catcaCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGt < 1:985767/149‑1 (MQ=255) tcaCAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTcg > 2:474357/1‑149 (MQ=255) acaGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTcgcg > 1:758003/1‑149 (MQ=255) acaGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTcgcg > 1:858333/1‑149 (MQ=255) acaGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTcgcg > 2:237046/1‑149 (MQ=255) caGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGt > 1:605446/1‑149 (MQ=255) aGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTc < 1:423538/149‑1 (MQ=255) ggttgtcCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGATGCGTCt < 2:899495/144‑1 (MQ=255) tctcCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTCTGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTAt > 2:209222/1‑149 (MQ=255) tctcCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTAt < 2:875610/149‑1 (MQ=255) ccAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCACCCTTATGGGGGAAGGTTAACGCTCGTGTAGCCCTTGCCGAGTTTAGGCCGGTTACGGCGTTTACCGCGACTGCGCCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTAtacg > 2:530471/1‑146 (MQ=37) agGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCt < 1:729461/149‑1 (MQ=255) agGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCCTTTACGCCGCCTCAGTGAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCt < 2:489784/149‑1 (MQ=38) ggTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTa < 1:186916/149‑1 (MQ=255) gTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGCCGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTAc > 1:10813/1‑149 (MQ=255) tgtggagATGGTTTTTATTCACACTCCGTTCTTGGACAAGGTTTACGCTCGGGTGACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAAc < 1:191363/143‑1 (MQ=18) gcgaggATTGTTTTCATTCCCCCTCCCCTACGGTAGTCGGTTAACGCTCGGGTATTTCTTGCCGAATGTAGGCCCGACAAGTTGTTTACGCCGCATCCGGCAATTAATGCCTGATGCGACGCTGTCTCGTTTTATCAG‑GCCTACAAAcc < 2:472896/145‑1 (MQ=18) gTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAAcc < 1:237046/149‑1 (MQ=255) aGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGt < 1:44043/149‑1 (MQ=255) gATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCTGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTAc < 1:858339/149‑1 (MQ=255) gATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTAc < 1:448120/149‑1 (MQ=255) gATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTAc < 2:768958/149‑1 (MQ=255) aTTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTAcc > 1:574075/1‑149 (MQ=255) tGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGa < 2:782542/149‑1 (MQ=255) tttAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTc > 1:959457/1‑149 (MQ=255) ttCCCGCTCCCTTATTGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTGTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATc > 2:861565/1‑149 (MQ=255) ttCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGGCGCATCCGGCAATCAATCCCTGCTGCGACGCTGTGGCGTCTTATCAG‑GCCTAACAACCGTTACCGACTCGCacc > 2:38743/1‑147 (MQ=38) ttCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTAc > 2:964574/1‑138 (MQ=255) ttCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTAc < 1:964574/138‑1 (MQ=255) cccGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGACAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGCCGCGGGCACGTCTTACCAC‑GCCTACAAACCGTTTGCGGCTCGCCTCgg > 2:491429/1‑149 (MQ=25) cGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGTTAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACGGCCTCGCGTCcggg > 2:480599/1‑148 (MQ=25) tCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAAt > 1:744021/1‑149 (MQ=255) cccTTAGGGGAGAAGGTTAACGGTGGGGTAACCCTTGCCGAATGCAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAAtt < 1:597900/149‑1 (MQ=255) ccTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCATTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTCCAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATtg > 1:730216/1‑149 (MQ=255) tATGGGAGAAGGTTAACGCTTGGGTAACCTTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTgg < 1:866764/149‑1 (MQ=255) tATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTgg < 1:50771/149‑1 (MQ=255) tATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTgg < 1:110064/149‑1 (MQ=255) gaTGGGAGAATGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCTGGCAATTGTgg < 1:661700/148‑1 (MQ=255) gagaAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCGGCTCCCGGCAAGCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTTCAGGCCGTTACCGAGTCGCATCGGGCAATTGGGGGTTAc > 1:91766/1‑149 (MQ=25) aaGGTTAAGGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGCAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGAt < 1:117072/149‑1 (MQ=255) aaCGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATc > 1:848026/1‑149 (MQ=255) cGCCCGGGTAACCGTTGCCGAATGTAGTGCGGATAATGCGTTTCAGCCGCATCCGGCAATTAATTCCGGATTCGACGCTGTCGCTTCGTATCAG‑GCCGACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATcgc < 2:324739/149‑1 (MQ=255) tCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGAt > 2:311032/1‑149 (MQ=255) cGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGTCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGCCTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATa < 1:45286/149‑1 (MQ=255) cGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATa < 2:858333/149‑1 (MQ=255) cGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATa < 1:299592/149‑1 (MQ=255) gggTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGAGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAg > 1:96578/1‑149 (MQ=255) gTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGCCTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGGTGGCATCGCGATAGcc > 1:136951/1‑149 (MQ=255) gTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATGGCGATAGcc > 1:334148/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGCGCCCA‑TATCCTATACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCtt > 1:245262/1‑149 (MQ=25) ttGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTtct > 1:903198/1‑149 (MQ=255) 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aTAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGa < 1:584083/149‑1 (MQ=255) aaGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACt > 2:366500/1‑149 (MQ=255) ccgcATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCg < 2:345825/149‑1 (MQ=255) cATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGACATTGTGGGTTACGATGTCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTGTCGACTACGCCAGGGTCggac > 2:612905/1‑147 (MQ=37) aTCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCaa < 2:91766/149‑1 (MQ=255) aTCCGGCAATCAATGCCCGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGCCTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCaa < 1:86549/149‑1 (MQ=255) gCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCCGCTTCTCGACTCCGCCCAGATCGGCCAGCGTc > 2:382879/1‑149 (MQ=38) gCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTCCGCCAGGGTCGGCAAGCgac > 2:900374/1‑147 (MQ=255) aatcaatGCCTGATGCGACGCTGTGGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCTACTCGCAGCGGGCAACTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCCAGCACCTTTTGGACGAAGCCAGGATCGGCAAGCGTCGa > 1:242011/1‑149 (MQ=37) tcaatGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAgg > 1:830648/1‑149 (MQ=255) tcaatGCCTGATGCGACGCTGCCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAgg > 2:924727/1‑149 (MQ=255) caatGCCTGATGCGACGCTGTCGTGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGt < 1:320402/149‑1 (MQ=255) aatGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGCGTACGCCCGGATCGGCAAGCGTCGACGtg > 2:211230/1‑148 (MQ=255) atGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCCCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTAt > 1:140123/1‑149 (MQ=255) tGCCTGATGTGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTATc < 1:790065/149‑1 (MQ=255) | GATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGAAGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAG‑GCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCCAGGATCGGCAAGCGTCGAGGTATC > NC_000913_3_hsa_tpiA/4285177‑4285472 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |