| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913_3_pae_tpiA | 1,978,503 | Δ776 bp | insB1–insA | insB1, insA | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913_3_pae_tpiA | 1978503–1979270 | 1979278 | 9–776 | 133 [0] | [0] 134 | insB1–insA | insB1,insA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913_3_pae_tpiA | = 1978502 | 0 (0.000) | 125 (1.130) | 83/264 | 0.2 | 100% | intergenic (‑305/+16) | flhD/insB1 | flagellar class II regulon transcriptional activator, with FlhC/IS1 transposase B |
| ? | NC_000913_3_pae_tpiA | 1979279 = | 0 (0.000) | intergenic (‑64/‑474) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein | |||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
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ataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTT‑TGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCta > 1:1766847‑M2/8‑149 (MQ=255) ataaatgTATAAGTCATACTTTTGTTT‑TGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCta < 2:151204‑M2/142‑1 (MQ=255) atgTATAAGTCATACTTTTGTTT‑TGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTataaa < 2:156759‑M2/146‑1 (MQ=255) gTATAAGTCATACTTTTGTTT‑TGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTctaaata > 1:331079‑M2/2‑149 (MQ=255) gTATAAGTCATACTTTTGTTT‑TGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTataaata > 1:1866420‑M2/2‑149 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |