| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 165247 | 971 (0.850) | 134 (0.120) | 39/252 | 21.1 | 12.0% | intergenic (+211/‑331) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser |
| ? | CP016816 | 165251 = | 987 (0.870) | intergenic (+215/‑327) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1076 total aligned reads displayed.
TTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTAAAAGAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAAT‑AGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTTAATGTTAATTAAAA > CP016816/165120‑165376 | ttGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATa > 1:1374851/1‑128 (MQ=255) aataTTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGA‑‑‑ttt > 1:2453331/1‑128 (MQ=255) aataTTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTAAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑ttt > 1:2227132/1‑128 (MQ=255) tatTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑ttttt > 1:2022576/1‑128 (MQ=255) atTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGATCTTGTAAAAAATAGA‑‑‑tttttt > 1:1089559/1‑128 (MQ=255) atTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑tttttt > 1:2072760/1‑128 (MQ=255) tattttAATTATTTTATAGCAATTTTATTAATTATTAATAAAATAAAAATATTATCTTTTTTTATATTTTTTTTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAAATTTTAAAAAATAGC‑‑‑ttttttttt < 2:354706/125‑1 (MQ=255) tAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑ttttttttt > 1:2290012/1‑128 (MQ=255) tAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑ttttttttt > 1:59572/1‑128 (MQ=255) tAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑ttttttttt > 2:770178/1‑128 (MQ=255) tAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑ttttttttt > 2:64813/1‑128 (MQ=255) tAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAAATAGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑tttattttt > 2:395424/1‑128 (MQ=255) tAGATTAATTAATTTATAGCACTTGTATGAATTATTAACAAAATAAAAATATTATCTTTTTAGATATTTTTTTTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAAATTGAACTTGTAAAAAAAAGC‑‑‑ttttttttt < 1:1800715/128‑1 (MQ=255) attttCAATAAATTATCGCACTTGTATGAATTATTAATAAACTAAAAATATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATTCAAATTTTTAAAAAAATAATTTGAACTTGTAAAAAAAAGC‑‑‑tttttttttt < 1:212975/126‑1 (MQ=255) gTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATATC‑‑‑ttttttttttt > 2:2286797/1‑128 (MQ=255) tttGATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACAAAAACTATTATCTTTTTAGATATTATTTGTATATGCAAATTTTATAAAAATTAATTTTAAATTGT‑AAAAATAGA‑‑‑ttttttttttttt > 2:2151273/1‑128 (MQ=255) tttCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑tttttttttttt > 2:1236736/1‑128 (MQ=255) tttCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑tttttttttttt > 1:1431684/1‑128 (MQ=255) tttCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑tttttttttttt > 2:209137/1‑128 (MQ=255) tttCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑tttttatttttt > 2:140958/1‑128 (MQ=255) tCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑tttttttttttttt > 1:460787/1‑128 (MQ=255) aTTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATACAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATATC‑‑‑tatttttttttttatt > 2:1583366/1‑128 (MQ=255) ttAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑ttttttttatttttttt > 2:2421029/1‑128 (MQ=255) tttATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑tttttttttttttttataatg > 2:1626423/1‑122 (MQ=255) tttATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑ttttttttatttttttttaaa > 2:515107/1‑125 (MQ=255) tttATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTtataa > 1:2345393/1‑127 (MQ=255) attcctattttattaattattaatAAAAAAAAAATATTTTATTTTTTTATATTTTTTTTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAAATTTTAAAAAATAGC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTATAATg < 1:913902/118‑1 (MQ=255) cGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTACAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑TTTTTTTTATTTTTTTTTtaataaat > 1:1571439/1‑122 (MQ=255) 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aTGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTATAATTTAAATAAAAAt > 1:736876/1‑128 (MQ=255) tgtaTTTGTAACAAAAAAAAAATTTAATATTTTTTTATATTTTTTGTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTTTAAAAAAAAGC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAAtt < 2:2254834/125‑1 (MQ=255) aTTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTATTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATAAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑‑ATTTTATTTTTTTTTTTTATAATGTAAATAAATAATTTa > 1:82094/1‑128 (MQ=255) tAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGCTT‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTTATAATTAAAATAAAATtttt > 1:296113/1‑128 (MQ=255) tAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTTAAAAAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTTATAATTGAAATATAAATTTTattt > 1:169576/1‑125 (MQ=255) tttaacatactaaaacttATATCTTTTTTTATATTTTTTGTATATTCAAATTTTTAAAAAATTAATTTTAACTTGTAAAAAATATC‑‑‑‑CTTTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGt < 1:775011/120‑1 (MQ=255) 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TTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTAAAAGAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTTATAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCTAAGTATCTAAAAAAAT‑AGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTTAATGTTAATTAAAA > CP016816/165120‑165376 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |