Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP016816105,3390TG56.4% 1024.0 / inf 986intergenic (+834/+92)JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (81/334);  new base G (399/137);  total (513/473)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 0.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1162 total aligned reads displayed.

TTGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCT‑TGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGT  >  CP016816/105212‑105468
                                                                                                                               |                                                                                                                                       
  gattaacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGAATTTATTAGAATTTATTATTATAATTATACTTTTAATAtaattaa                                                                                                                                       >  1:3431160/7‑128 (MQ=255)
  gTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGATAAGTATTTATTAGTATTGATTATTTTATTTATACTTTTAATAtaatcaa                                                                                                                                       >  1:2020005/1‑128 (MQ=255)
     taacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATaatgaatt                                                                                                                                     <  1:2531298/124‑1 (MQ=255)
      aacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTATGATTTATTATTTTATTTATCATTTTAATATAAttaattta                                                                                                                                   >  2:2178025/3‑128 (MQ=255)
      aacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaattta                                                                                                                                   >  2:427075/3‑128 (MQ=255)
       acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTATTATTTATTATATTATTTAAAATTTTAATAtaattaaataaa                                                                                                                                  >  2:2620049/2‑123 (MQ=255)
       acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAATTATTAATTAGTATTGATTAGTTTATTTATACTTTTAATATAAtgaatataa                                                                                                                                  >  2:2407614/2‑128 (MQ=255)
       acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATAAGTATTGATTATATTATTTATACTTTTAATAAAAttaatttaa                                                                                                                                  >  2:2513094/2‑128 (MQ=255)
        cAAGCCTTTTTTAATTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAATTAATAAAGATTAATGTTATTATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaat                                                                                                                                 <  2:2044458/128‑1 (MQ=255)
         aagatttttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATgaatttaatt                                                                                                                                <  2:2248615/123‑1 (MQ=255)
          aGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATttaatta                                                                                                                               <  2:2771356/128‑1 (MQ=255)
            ccTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATaaaa                                                                                                                             >  2:1971107/1‑128 (MQ=255)
            ccTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTaaa                                                                                                                             <  2:1261297/128‑1 (MQ=255)
            ccTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTaaa                                                                                                                             <  2:50223/128‑1 (MQ=255)
             cTTTTTTATTTGTTAATTCACTTATTATAGTATGAACTAATTAAGATTAATGTTAATATAAAATATCTAAGTATTTATTAGGATTTATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTaaaa                                                                                                                            <  1:1716629/128‑1 (MQ=255)
             cTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTaaaa                                                                                                                            <  1:695006/128‑1 (MQ=255)
                ttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAata‑t                                                                                                                        >  2:3396112/1‑128 (MQ=255)
                ttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGATAATTATTTATTATTATTTATTATTTAATTTATAATTTTAATATAATAAATTTAATTAAAata‑t                                                                                                                        >  1:973158/1‑128 (MQ=255)
                       tGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTt‑‑aat‑‑a                                                                                                             >  2:3140498/1‑128 (MQ=255)
                          aaaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTTATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATAAATTTAATT‑AAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaaa                                                                                                         >  2:6049/1‑128 (MQ=255)
                          aaaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaa                                                                                                          >  2:2550270/1‑128 (MQ=255)
                           aaaTCACTTATTATAGTATGAAAAAATAAAGATTAATGTTAATATAAAATAGCTAATTATTAATAAAAAATGATTAAATTATTAATACATTAAAAATAATTAAATTAATTAAAATA‑TAAT‑‑aaa‑‑aaaaa                                                                                                         >  2:699646/1‑128 (MQ=255)
                            aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTATTATTGATTAATTTATTTATACTTTTAATATAATAAATTTAATTAAAATA‑TATT‑‑AAT‑‑aaaaaa                                                                                                        >  2:1723450/1‑128 (MQ=255)
                            aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTATTTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTAT‑‑AAT‑‑aaaaaa                                                                                                        >  2:1823930/1‑128 (MQ=255)
                            aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TATT‑‑AAT‑‑aaaaaa                                                                                                        >  1:397106/1‑128 (MQ=255)
                              tCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑ataaaaaa                                                                                                      >  1:3265902/1‑128 (MQ=255)
                               cACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaa                                                                                                     >  1:3334191/1‑128 (MQ=255)
                               cACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGATAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTATACTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaa                                                                                                     >  1:3855474/1‑128 (MQ=255)
                                atttttttttgTATTAAATTATTAATATTAATGTTATTATAAATTTTCTAATTTTTTATTATGTTTTTTTTTTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaa                                                                                                    <  1:1962205/118‑1 (MQ=255)
                                aCTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaa                                                                                                    >  2:1410613/1‑128 (MQ=255)
                                aCTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTATAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaa                                                                                                    >  2:368800/1‑128 (MQ=255)
                                   tattttATTATGAAATAATTAAGATTAATTTTAATATAAATTATATAATTTTTTATTAGTATTTATTATTTTATTTATCCTTTTAAAATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaa                                                                                                 <  1:1789139/128‑1 (MQ=255)
                                   tattatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaa                                                                                                 >  1:938001/1‑128 (MQ=255)
                                    attattttttttaataatAAATATTAATTTTAATTTAAATTAGCTAATTATTTATTAGGATTTATTAGTTTATTTATCCATTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaaa                                                                                                <  1:2838766/116‑1 (MQ=255)
                                    attatAGAATGAAATAATAAATATTTATGTTAATATAAATTAACTAAGTAATTATTAATATTGAATATTTTAATAATACTTTTAATATAATAAATTTAATTAAAATA‑TTTa‑‑aaa‑‑aaaaaaaaaaaaaa                                                                                                >  2:2703277/1‑128 (MQ=255)
                                     ttatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaaaa                                                                                               >  2:3176680/1‑128 (MQ=255)
                                     ttatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAAGAATTTAATTAAAATA‑TATT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaaaa                                                                                               >  2:1495357/1‑128 (MQ=255)
                                      tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                              >  1:3555006/1‑128 (MQ=255)
                                      tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                              >  1:3769380/1‑128 (MQ=255)
                                       ataGTATTAAATAATAAATATTAATTTAAATAAAAATTATCTAATTATTTATTATGTTTTATTATTTTATTTATACTTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAAAA‑TTTT‑‑AAT‑‑aaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                             <  1:795085/128‑1 (MQ=255)
                                            aTGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                        >  2:959242/1‑127 (MQ=255)
                                              gAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                      >  1:1003205/1‑125 (MQ=255)
                                               aaaaaaTAAAAATAAATTTTAAAAAAAATAACATAATTAATTAAAATGAATTATTACATTATTTAACATTTAAATATAATGAATTTAATTAAAAAA‑TTTT‑‑AA‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCt                                                                                    <  1:851000/128‑1 (MQ=255)
                                                aaaaaaaaaTATTTATGTTAATATAAATTAGCTAATTATTTTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATT‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCt                                                                                    <  2:3071267/122‑1 (MQ=255)
                                                   aataaataTTAATTTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTAGTATTTATTATTTTAATTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAata                                                                                <  1:317797/128‑1 (MQ=255)
                                                    ataaAGATTAATGTTAATACAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑Aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaataaaaaata                                                                                >  1:3467313/1‑119 (MQ=255)
                                                     taaAGTTTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTTTTTATTTCGATTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGt                                                                            <  1:3097612/128‑1 (MQ=255)
                                                       aataTTAATTTTAATATAAATTATATAATTTTTTATTATTATTTATTATTTTAATTATCAATTTAATATAATTAATTTAAATAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTg                                                                             <  1:2658767/125‑1 (MQ=255)
                                                        aGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAcaaaaaattta                                                                            >  2:3346294/1‑118 (MQ=255)
                                                         taTTAATGTTAATATAAATTATCAAATTATTTATTATGATTGATTTGTTTATTTTTCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGtt                                                                           <  2:3532301/127‑1 (MQ=255)
                                                          aTTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AATA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAACTAATAtttta                                                                           >  2:855363/1‑125 (MQ=255)
                                                           tttaTGTTAATATAAATTATCTAATTATTTTTTATGATTTTTTATTTTATTTATACTTTTAATATAAATAATTTAATTAAAAAT‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTaa                                                                         <  1:3379102/125‑1 (MQ=255)
                                                            tAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTATGATTGATTATTTTATTTATCATTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAAAA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTaaa                                                                        <  1:537691/128‑1 (MQ=255)
                                                             aaTTTTAATATAAATTATATAATTATTTATTAGTATTGTTTATTTTATTTATACATTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTaaaa                                                                       <  1:1897900/128‑1 (MQ=255)
                                                               tttttaaataAATTATCTAAGTATTTATTATGATTGATTATTTTAATTATCCTTTTAATAAAATTAAATTAATTAAAAAA‑TTTT‑‑AAA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAAc                                                                     <  1:2312519/121‑1 (MQ=255)
                                                                 ttattaTAAATTAGTTTATTATTTTTTATGATTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTTAAAAAAATTTATTTAATTTAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaa                                                                   <  1:3639639/128‑1 (MQ=255)
                                                                      ataAATTTCTTAATTTTTTATTATTATTTATTTTTTTATTTATCATTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AA‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAC‑AGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                            <  1:1222101/128‑1 (MQ=255)
                                                                       taAATTATTTATGTTTTTATTATGTTTTTTTATTTTTTTTATAATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                            <  2:3295757/128‑1 (MQ=255)
                                                                        aaaTTATCTAATTATTTTTTATTTTTTTTTATTTTATTTAATCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAAAA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                            <  1:3678678/128‑1 (MQ=255)
                                                                           ttttttAATTATTTATTAGTATTTATTATTTTTTTTATACTTTTAATATAATTAATTTATTTAAAAAA‑TTTT‑‑AAA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGt                                                         <  2:3855474/123‑1 (MQ=255)
                                                                              gCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATAATATTTTTAAAAAAAAaaaattaaatatt                                                      >  1:2977598/1‑123 (MQ=255)
                                                                               cttaGTATTTTTTATGTTTTTTTATTTTTTTTAACAATTTTAAATAATTTATTTAATTTAAAAA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCT‑Tg                                                    <  1:2210967/125‑1 (MQ=255)
                                                                               cTAAGTTTTTTTTAGGATTGTTTATTTTATTTATACTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCT‑Tg                                                    <  2:3314533/128‑1 (MQ=255)
                                                                                tAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAATAATTTAAAAAAAaaataaaaaaaaataaa                                                    >  2:1084237/1‑117 (MQ=255)
                                                                                 aaGTATTTATTATGATTTATTAGTTTATTTATAATTTTAATAAAATTAATTTAAATAAAATA‑ATTT‑‑AATA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCT‑TGa                                                   <  1:3520419/128‑1 (MQ=255)
                                                                                  aGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAATATTATTAAAAAaaataaaatataaattaatt                                                  >  2:2466973/1‑118 (MQ=255)
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                                                                                                                           taatgaatTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAATTTTAAAAACAAATAAATAATAAT‑ATATTTTTTAAATATTTTTTTTAAAAAAATTTACAtttacaaaaat        >  2:3483333/1‑119 (MQ=255)
                                                                                                                           aaattaattTAATTATAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCT‑TGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAAt        <  1:1588/127‑1 (MQ=255)
                                                                                                                               |                                                                                                                                       
TTGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATA‑TTTT‑‑AAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCT‑TGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGT  >  CP016816/105212‑105468

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑