| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 76896 = | 661 (0.730) | 203 (0.250) | 112/224 | 14.3 | 26.7% | intergenic (‑145/+40) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein |
| ? | CP016816 | = 76892 | 525 (0.650) | intergenic (‑141/+44) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 855 total aligned reads displayed.
TATATATATTAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTGATCTTTACT > CP016816/76770‑77023 | tatatatTAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑ttttttt > 1:966600/1‑128 (MQ=255) atatTAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑tttttttttt > 1:276569/1‑128 (MQ=255) tatTAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑ttttttttttt > 1:245943/1‑128 (MQ=255) atTAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑tttatttttttt > 2:1524816/1‑128 (MQ=255) atTAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAA‑‑tttttttttttt > 1:1003099/1‑128 (MQ=255) atTAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATATTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑tttttttttttt > 2:747058/1‑128 (MQ=255) tAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑tttttttttttttt > 2:552152/1‑128 (MQ=255) gTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑tttttttttttttttg > 1:1572032/1‑127 (MQ=255) aaCTTAATGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGGACAACCCAAATTCCCCTTTAAAATCAAATAACATTATATAAATATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑tttttttttttttggaact < 1:921901/128‑7 (MQ=255) acatAAGGATTTAAAATAAAAATTAATAATAACTTTACAAACCAAATTCCCCTTTAAATTAAAATAAAATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑ttttttttttttttggaact < 1:1517139/125‑7 (MQ=255) aattAATGATTTATAATACAAATTAATAATAAATTTAAAACCCAAATTACACTTTAAATTAAAATAAAATTATATAAACATAAATTTTTTAAATA‑AAAATATT‑AA‑AAC‑‑ttttttttttttttggaact < 2:456755/126‑7 (MQ=255) aCTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCACCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTAATAAATA‑AAAATATT‑AC‑ATC‑‑tattttttatattttgtaag > 2:1203664/1‑123 (MQ=255) aCTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAAAAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAAAATTATAAAAAGATAAATTTTTTAAATA‑AAAATATT‑AA‑AAC‑‑tatattttttttttattaaa > 1:1456497/1‑122 (MQ=255) ttAATGATTTATAATAAAAAATAATAATAAATGTAAAACCCAAAATACCCTTTAAATTCAAAAAAAATTATATAAAGATAAATTTTTTAAATA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTa < 2:1892345/128‑1 (MQ=255) tAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTATTTTTATTTTTGTAAATa > 2:90239/1‑128 (MQ=255) aaGTATGTATAATACAAAATAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACa < 2:1390662/128‑1 (MQ=255) aaGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTaa > 1:1780011/1‑128 (MQ=255) aGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑tttttttttttttttttaaaaaaaa > 1:633416/1‑119 (MQ=255) gATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑tttt > 1:1830267/1‑105 (MQ=255) aTGTTTTATACAAATTACTAATAACTGTACAAACCAAATTACTCTTTAAAATAAAATAACATTTTATAAAGATAAATTTTTTAAAGT‑AAAATATT‑AA‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACatat < 2:1478627/128‑1 (MQ=255) aTGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AA‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACAtata < 1:1662915/128‑1 (MQ=255) tGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTTGaaaataaaaaa > 2:229113/1‑119 (MQ=255) tGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATaa > 2:1370636/1‑128 (MQ=255) tttaataaAAATTAAAAATAAATTTACAACCCAAATACACATTTAAATTAAAATAAAATTATAATATTTTTAATTTTTTAAATA‑AAAATATT‑TA‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATaa < 2:1821794/126‑1 (MQ=255) tataATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑TTATTTTTTTTTTTTGTAACTAAAATATAAt > 2:1270743/1‑128 (MQ=255) ataataCAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTT‑TAACTAACATATAAtt > 2:276215/1‑128 (MQ=255) aataAAAATTAATAATAAATTTTCAAACCAAAATCCCATTTAAAATCAAATAAAATTATATAAATATAAATTTTTTAAATA‑AAAAAATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAAtttt < 2:52725/128‑1 (MQ=255) ataCAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAAAAAATTTAAtttt > 1:308953/1‑128 (MQ=255) taCAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAAGTAAAATTTAATTTTAc > 1:204213/1‑128 (MQ=255) aaTTAATAATAACATTACAAACAAAATTCACATTTAAATTAAAATAACATTATATTAATATTAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAatt < 1:1545292/128‑1 (MQ=255) aTTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGTAACTACCATATAATTATACAAatta > 1:1392019/1‑128 (MQ=255) aTTAATAAAAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAAGAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AA‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTT‑GAACTAAAAAAAAATTTTA‑CAatta > 1:494247/1‑128 (MQ=255) ttAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAATA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAAAtaaaataaaaatataaaaaaa > 1:1859295/1‑117 (MQ=255) ttAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCACTTTAAATTCAAATAACATTATATGAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTT‑‑GAAAAAAAATAAAATTTTACAAattat > 1:211814/1‑128 (MQ=255) aataataaCTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTAACAAttatta > 2:1318584/1‑128 (MQ=255) taaCTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTT‑TAAAAAAAATATAATTTTACCAATTTTTAAaat > 2:1016108/1‑128 (MQ=255) taaCTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGTAAATAACATATAATTTTACAAATTATTAGaatt > 2:1598512/1‑128 (MQ=255) aaCTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AACTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAAATAACATATAATTTTACAAAttattata > 2:1169114/1‑126 (MQ=255) aaCTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAAAATATAATTTTACCAATTATTAGaata > 2:198859/1‑127 (MQ=255) aCTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTT‑‑GAAAAAAAATTTAATTTTACAAATTAATATaattta > 2:1859642/1‑127 (MQ=255) atGTAAAACCCAAATTACACTTTAAATTAAAATAAAATTATATAAATATAAATTTTTTAAATA‑AAAATATTAAA‑AAT‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGaatt < 1:401154/127‑1 (MQ=255) taaaaaacAAATTCCCCTTTAAATTAAAATAAAATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑TC‑AA‑‑‑‑ATTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGaatttcaatt < 1:1324534/121‑1 (MQ=255) tACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AACT‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAAAATATAATTTAACAAATTATTATaatttaa > 2:1665068/1‑126 (MQ=255) tACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAAAAAAAATATAATTTTACCAATTATTAAaatttaaat > 2:931239/1‑128 (MQ=255) tACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAAATAAAATATAATTTTACCAATTATAAGaatttcaatt > 1:893996/1‑128 (MQ=255) cAACCCATATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAAATAACATATAATTTTACAAATTATTTGaatataaatta > 2:1575808/1‑127 (MQ=255) aaaCTCAAATTTACATTTTAATTTAAATTAAATTATATAAATTTAAATTTTTTAATTA‑AAAATATT‑AC‑AA‑‑‑‑ATTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGaatttcaatttc < 1:37700/127‑1 (MQ=255) aaCCAAAATTCCCCATTAAATTAAAATAACATTATATAAATAAAAATTTTTTAAATA‑AAAATATT‑AA‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGaatttcaatttc < 2:1702698/128‑1 (MQ=255) aCCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAATTATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAAAAAACATATAATTTTAACATTTATTTAAattaaaatttcaa > 1:769710/1‑127 (MQ=255) aatttctattttAAATT‑AAATAAATATATAATAATATTAATTTTTTAAATT‑AAAA‑ATT‑TT‑AAA‑‑AATTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGAt < 1:60850/119‑1 (MQ=255) aaTTCACCTTTAAATTAAAATAAAATTATATAAAAATAAATTTTTTAAATA‑AAAATATT‑A‑‑AAA‑‑ATTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGAt < 1:1936804/128‑1 (MQ=255) ttacccTTTAAATACAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAATA‑AAAATATT‑AA‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGa < 2:436320/125‑1 (MQ=255) tCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAAATAAAATATAATTTTACAAATTATTAAAATTTAAATTTCACAAATTaa > 2:70847/1‑128 (MQ=255) ccccTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAAAAAAT‑TAATTTTACCAATTTTTAAAATTTAAATTTAAAAAATGAAt > 1:1688362/1‑128 (MQ=255) cccTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTAAATTTCACATATGAAt > 2:1638699/1‑128 (MQ=255) cccTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGTAACTAAAATATAATTTTAAAAATTATTAGAATTTAAATTTCACATATTAAtt > 2:1420014/1‑128 (MQ=255) tttAAATTAAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGAtt < 2:1073366/128‑1 (MQ=255) ttAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGAttt < 2:1558312/128‑1 (MQ=255) ttAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAAATAACATATAATTTTACAAATTATTAGAATTTCAATTTAACAGATGAATTTAtta > 1:1149548/1‑127 (MQ=255) taaatt‑aaatATAATTATTTAAATATAAATTTTTTAAATA‑AAAATATT‑AA‑AA‑‑‑‑ATTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATttct < 1:1427790/128‑1 (MQ=255) aattaaaaataa‑atTATATAAATATAAATTTTTTAAATA‑AAAATATT‑A‑‑AAA‑‑ATTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATttct < 1:1067016/122‑1 (MQ=255) aaaataaaaaaaaaTTATATAAATAAAAATTTTTATAATA‑AAAATATT‑ACAAAT‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGAta < 1:506471/122‑2 (MQ=255) aaaTTAAAATAAAATTATATAAATATAAATTTTTTAAATA‑AAAATATT‑AA‑AA‑‑‑‑ATTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATttct < 1:1176563/128‑1 (MQ=255) aaTTCAAATAAAATTATATAAATATAAATTTTTTAAATA‑AAAATATT‑AA‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATttct < 2:680999/128‑1 (MQ=255) ttaaaaTAAAATTATATAAATATAAATTTTTTAAATA‑AAAATATT‑AA‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTtcttct < 1:1598512/125‑1 (MQ=255) cAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAAAATTTCAATTTCACAGATTAATTGATTACTTCtaa > 1:661024/1‑128 (MQ=255) aaTAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTT‑GAACTAACATTTAATTTTACCAATTATTAGAATTTAAATTTCACAGATTAATTGATTTCTTAtaaa > 1:436320/1‑127 (MQ=255) cATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAAATAACATATAATTTTACCAATTATTATAATTTCAATTTAAAAAATTAAATTATTTATTATAATAAtt > 2:1614861/1‑128 (MQ=255) cATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGTAAATAAAATTTAATTTTACAAATTATTATAATTTAAATTTAAAAAATTAATTTATTTATTATAATAAttt > 2:59692/1‑128 (MQ=255) tataattttAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AA‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAAAATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCtat < 2:1288972/120‑1 (MQ=255) ttaAATATAAAATTTTTAAATT‑AAAATATT‑AC‑AAA‑‑TTTTTTTTTTTTTTT‑‑GAACTAACATATAATTTTACCTATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCtata < 1:1719211/127‑1 (MQ=255) ataaatataaatATTTTAAATA‑AAAATATT‑TA‑AAA‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCta < 2:1775632/128‑1 (MQ=255) atattttAAATTTTTTTAATA‑AAAATATT‑AA‑AAT‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACAAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCtat < 2:62376/122‑1 (MQ=255) aatatatatatTTTTTAAATA‑TATATATT‑TA‑AAA‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGATCTAAAATATAATTTTACCAATTATTAGAATTCCAATTTCACAGATGAATTGATTTATTCTAATAATTTGTCtat < 1:828622/123‑1 (MQ=255) atataTAAATTTTTTAAATA‑AAAATTTT‑AA‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCtatata < 2:405709/124‑1 (MQ=255) aaaGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑A‑‑‑‑TATTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCtatata < 1:707393/128‑1 (MQ=255) aaaCATAATTTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AA‑AA‑‑‑‑‑‑ATTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGa < 1:1365577/128‑1 (MQ=255) aGATTAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑A‑‑AAA‑‑ATTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAg < 1:1270743/128‑1 (MQ=255) gATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AACT‑TTTTTTTTTTTTTTTTTGAATTAAAATATAATTTTAACAATTTTTAAAATTTAAATTTAAAATATGAATTCATTTATTATAAAAATTTGTatatttt > 2:1937444/1‑125 (MQ=255) gATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAAAATTTAATTTTAACAATTATTTTAATTTAAATTTAAAATATTATTTTATTTATTATAATTATTTTtatatatata > 2:1141432/1‑126 (MQ=255) gATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTATAATTTCAATTTAACAGAAGAATTTATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGAt > 1:551956/1‑128 (MQ=255) aTAAATTTTTTTAATT‑AAAATATT‑TA‑AAA‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGa < 1:466181/128‑1 (MQ=255) taaTTTTTTAAATATAAAATATT‑AA‑AA‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGt < 2:812455/127‑1 (MQ=255) aaaTTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AACT‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTAACTAAAAAATAATTTTACCAATTATTAAATTTACAATTTCAAAAATGAATTTATTAATTAAAATAATTTTAATATATAgtt > 1:681068/1‑126 (MQ=255) ttttAAATA‑AAAATATTAAA‑AAT‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGtttt < 2:65669/128‑1 (MQ=255) ttttAAATA‑AAAAAATT‑AA‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGATCTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTta < 2:374915/128‑1 (MQ=255) ttttAAGA‑AAAATTTT‑TT‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGtttttt < 1:1873985/128‑1 (MQ=255) tttAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAAATAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATTAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTATATATATATGTTTTTta > 2:485969/1‑128 (MQ=255) ttAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTATAATTTCAATTTAACAGATTAATTGATTTCTTCTAATAATTTTTATATATAAATGTTTTTtat > 1:788330/1‑128 (MQ=255) tAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAAGTAACATTTAATTTTACAATTTATTATTATTTAAATTTCAAATATTAATTTATTTATTATAATAATTTGTATATATATATTTTTTTtata > 2:775667/1‑128 (MQ=255) tAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATTTAATTTTACCAATTTTTATAATTTAAATTTAACATATGAATTTATTTATTATAATTATTTTTCAATATTAATGTTTTTtattt > 2:1444974/1‑126 (MQ=255) tAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACAAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTGTTAAAATTATTTGTCTATATACATTTTTTTtatag > 2:343656/1‑127 (MQ=255) gA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTaa < 2:1731392/128‑1 (MQ=255) aaTATT‑AC‑AAC‑‑‑TTTATTTTTTTTTTTGGAAAAAAAAAAAAATTTTACCAATTATTAAAAATTAAATTTCACAGATGAATTAATTTATGCTAAAAAATTTTCAATATAAATGTATTTtataaaaaaaac > 1:351460/1‑120 (MQ=255) atatT‑AC‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAAAATATAATTTTACCAATTATTAAAATTTCATTTTCACATATGAATTTATTTATTCTATTAATTTGTCTATATATATTTTTTTTATATATAAATCa > 2:84229/1‑128 (MQ=255) tatT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACATATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGt < 1:1113417/128‑1 (MQ=255) atT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACAAATTATTAAAATTACAATTTCAAATATTAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTATATATATATGTTTTTTATATAAAAATAAGTg > 1:1204213/1‑128 (MQ=255) aaatatttaaaattttttttttttttGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATc < 2:969239/116‑1 (MQ=255) aaatttttttttttttttttGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTGAt < 1:129898/124‑1 (MQ=255) aattttttttttttttGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTGATcttt < 2:301752/126‑1 (MQ=255) | TATATATATTAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAAGA‑AAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTGATCTTTACT > CP016816/76770‑77023 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |