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| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 2578 total aligned reads displayed.
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> 1:336519/1‑128 (MQ=255) tA‑TT‑‑GA‑AAAAAAAAAAAAAA‑‑A‑‑T‑AATATAATTTGAAAAATATAAAAAATTTTTTTTAAAATAATTATTAAGGTTTAAATTTAAAAAACAAATAGTTATAAATATTGTTTTTTTTTTTATATTATTAttt > 2:6366190/1‑128 (MQ=255) | CTTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑A‑CTA‑TT‑‑G‑‑AAAAAAAAAAAAAA‑‑A‑‑T‑AATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCTT > CP016816/34818‑35072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |