| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 76896 = | 1458 (0.790) | 234 (0.140) | 116/224 | 16.5 | 15.6% | intergenic (‑145/+40) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein |
| ? | CP016816 | = 76892 | 1223 (0.740) | intergenic (‑141/+44) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 484 total aligned reads displayed.
AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaa‑aaa‑a‑aa‑aaaaGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < CP016816/76892‑76766 attttATATTAAATTAAATATCACTTATTTTTATATAAAAAACATATATATAGACAAATTATTAGAATAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTATTT‑CC‑A < 2:1432685/123‑1 TTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTTTGAAATTGAAATTCTAATAATTTATAAAATTATATGTTATTT‑CC‑AAA > 1:1546507/1‑128 TTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAATTTGAAATTCTAATAATTAGTAAAATTATAAGTTAGTT‑CC‑AAA > 1:771655/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑A > 1:2816245/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑A > 2:3942938/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑A > 2:147906/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑A > 1:3269148/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATAGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CA‑AAA‑A > 2:3080363/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTAAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑A > 1:2763588/1‑128 tATATTAAAGTAAATATAAATGATTTAGATATAAAAAACATATAAAAAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTAAAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AA < 2:500927/127‑1 ggTATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑AC‑AAAta > 1:3880691/3‑126 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTTAAATTGAAAATCTAATAATATCTAAATTTATATGATAGTT‑CC‑AAA‑AA > 1:3669348/1‑128 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AA > 2:86092/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTTGTAAAATAATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA > 1:1792035/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATCTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA > 1:36381/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGAAAAATTATATTTTAGTT‑CA‑AAA‑AAA‑A > 2:1756524/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTAATCTGTGAAATTTAAATTATAATAATTTGTAAAATTATATTTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA‑A > 1:2681475/1‑128 ATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTAAATGTTAGAT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑A > 2:2105951/1‑128 ATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGAAAAATTATATGTTATTT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑A > 2:2062971/1‑128 TTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CA‑AAA‑AAA‑A‑AA > 1:1632862/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑AA‑A > 1:3485350/1‑128 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAATAAATCAATTAATCTGTTAAATTTAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTATTA‑AC‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AA > 2:561579/1‑128 AGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGATATTCTAATAATTGGTAAAATTATATTTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAA > 1:1034472/1‑128 CTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAAGTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAACAAA‑A‑AA‑AAAATTTGT‑‑AA‑TAT > 1:1864033/1‑128 GATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑‑AA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTT > 1:436787/1‑128 ATTTAGATATAAATAACATGAATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATATGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑‑‑A‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCT < 2:2964379/128‑1 ATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAATTTT‑‑TA‑TTTTTTT > 2:321545/1‑128 TTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAATT‑T‑‑TA‑TATTTTTta > 2:2566536/1‑126 AGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTATT > 1:2356031/1‑128 AAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAATTGT‑‑TA‑ATTTTTTATTTTAAAA > 1:1127546/1‑128 AACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTTT‑‑AA‑TATTTTAATTTAAAAAATTT > 1:2410005/1‑128 TCTATATATAAATATTATTAGAAGTAATCAATTCATGTTTTAAATTTAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCT < 2:3423583/128‑1 CTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAATTTT‑‑AATTATTTAAATTTAAAAATTTTAatt > 2:1010525/1‑125 ATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAATTTGT‑‑AA‑TATTTTTATTTAAAAAATTTATATTTAT > 2:2249584/1‑128 TAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATAT < 2:3298325/128‑1 GACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTTT‑‑AA‑TATTTTTATTTAAAAAATTTATATTTATATAA > 1:4037520/1‑128 ACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAATTTTTAAA‑TTTTTTTATTTAAAAATTTTATATTTATAata > 1:635380/1‑125 CAAATTATTAGAATAAATCAATTAATTTGTTAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATTTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATG < 1:174004/128‑1 CAAATTATTAGAATAAAACAATTAAACTTTGAAATTGAAATTCTAAAAATTGGTAAAATTAAATGTTATTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATG < 2:2005536/128‑1 ATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTA > 2:2314424/1‑128 TTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTTT‑‑AA‑TATTTTTATTAAAAAATTTTAAATTTATATAATTTTATTTt > 1:2235045/1‑127 AAGTAATAAATTAATCTTTTAAATTTAAATTCTAATAATTGGTAAAATTTTATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATT < 1:867157/128‑1 AAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTATTTAAAAAATTTATATTTATAAATTTTTATTTTAATT > 1:3715443/1‑128 GAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTA < 1:1378350/128‑1 GAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAATTAGA‑‑AA‑TATATTTATTTAAAAAATTTATCTTTATTAATTTTTATTTAAATTTAA > 1:3123397/1‑128 AATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTTT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTATATAATGTTATTTTAATTTAAA > 2:3657107/1‑128 aaTCATATGTTTAATTTAAAATTTAATAATTTGTAAAATTAAATGTTATTTACA‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGA < 2:1203392/126‑1 tttattTGTGAAATTTAAATTCTAAATATTTGTAAAATTATATTTTATTTACA‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAA < 1:2124201/122‑1 TTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTATTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAATTTGT‑‑AA‑TATTTTAATTTAAAAAATTTATATTTATATAATTTTATTTGAATTTAAtgtttaa > 1:2606969/1‑121 TCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTATTTAAAAAATTTATATTTATATAATGTTATTTTAATTTAAAGGTTAATT > 1:2938396/1‑128 ATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAATTTGT‑‑AA‑TATTTTTATTTAAAAAATTTATATTTAAATAATTTTTTTTTAATTTTAAGTGTAATTT > 2:2719633/1‑128 TCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAATTTTT‑‑AA‑TATTTTTATTTAAAAAATTTAAATTTATATAATTTTATTTTAATTTAAATGTTAATTTG > 2:3382912/1‑128 TCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTG < 2:1302183/128‑1 ttttAAATTTAAATTAAAAAAATTGTAAAAATAATATTTTAGTT‑‑C‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTT < 2:1261500/124‑1 TGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAATTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGTGAAATTTGGtt > 2:3155951/1‑126 ttAAATTTAAATTTTAATAATTGGTAAAATTATTTGTTAGTTACA‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTT < 1:3960710/126‑1 AAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAATTTGT‑‑AA‑TATTTTTATTTAAAAAATTTATATTTATATAATGTTATTTTAATTTAAAGTGGAATTTGGTTTtt > 1:961440/1‑126 AATTGTAATTTTAATAATATGTAAAATTTTATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AAATA‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTA < 2:2223392/128‑1 TTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑‑‑A‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTAACTTTATATAATTTTATTTGAATTTAAAGTGTAATTTGTGTTTTAaattt > 2:940972/1‑123 GAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAATTTGT‑‑AA‑TATTTTTATTTAAAAAATTTAAATTTATATAATTTTATTTGAATTTAAAGGGTATTTTGGTTTGTACAGT > 2:3757244/1‑128 aaaTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTA < 2:2283229/125‑1 TAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAATTTGT‑‑AA‑TATTTTTATTAAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTTTAATTTAAATGGTAAATTGGTTTGTACATTTATTATT > 2:666371/1‑128 aaaaaattGTAAAATTATATGTTATTT‑CC‑AAATAAA‑A‑AA‑AAAAGGTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTA < 2:401944/120‑1 TAATTGGTAAAATATAATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAAT < 1:3314712/128‑1 AATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTT > 1:1273229/1‑128 gtTAAAATAAAATTTTTTTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTA < 1:765274/126‑1 AAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAATTTGT‑‑AA‑TTTTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTTTATAATGTTATTTGAATTTAAAGCGGAATTTGGTTTGTACAGTTATTATTAATTTTTATTA > 2:188864/1‑128 aaaTATATTTTATTT‑ACAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATA < 2:3538151/125‑1 ATTATTTTTTATTT‑CC‑AAA‑AAA‑ATAT‑AATAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATAC < 1:460262/128‑1 TTATATTTTAGTT‑CC‑AAA‑AAATA‑AATAAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTTAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGATTTTGGGTTGTACAGTTTTTATTAATTTGTATTATAC < 2:3713814/128‑1 ATATGTTAGTT‑CCAAAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTATTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAATGGGAATTTGGGTTGTTCAGTTATTATTTAGTTGTATTATACATC > 1:1908036/1‑128 ATGTTAGTT‑CA‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTT < 1:3194139/128‑1 tttatttaaaatAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAATATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTT < 1:2849615/116‑1 AAA‑AAA‑A‑AT‑AAAAGTTGT‑‑AT‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGTGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAA < 1:3047167/128‑1 AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAA < 1:147906/128‑1 AA‑AAA‑A‑AA‑AAAATTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTTGAATTTAAAGGTGAATTTTGGTTTTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:677955/128‑1 AA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:324449/128‑1 AA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 2:1827467/128‑1 AA‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:1340465/128‑1 A‑AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 1:2536312/128‑1 atAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 2:1108591/126‑1 atA‑A‑AA‑AATAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAATAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:2318134/126‑1 AAA‑A‑AA‑AATAGTTTT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:2433983/128‑1 AAA‑A‑AA‑AAAAGTTTT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTTTATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTTTTATTAATTTGTTTTATACATCCTTAAGTTAACTAATAT > 1:378827/1‑128 AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGATTTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:3392029/128‑1 AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:2649849/128‑1 AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:1342233/128‑1 AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:497735/128‑1 AAA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:1700416/128‑1 AA‑A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATA < 1:1197926/128‑1 A‑A‑AA‑ATAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAATATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGTATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATAT < 2:2812467/128‑1 A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 2:3841626/128‑1 A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 2:1563453/128‑1 A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 1:515008/128‑1 A‑AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 1:1949356/128‑1 AA‑AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATAT < 1:1004602/128‑1 AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAA < 2:453905/128‑1 AAAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAA < 1:3550715/128‑1 AAAGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTTAATTTAAAGGGGATTTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTTTATTATACAACATAATTTTCAATAATATATAAAAA > 2:434682/1‑128 AGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGTTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT > 1:2279562/1‑128 AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAA‑AAA‑A‑AA‑AAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaa‑aaa‑a‑aa‑aaaaGTTGT‑‑AA‑TATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < CP016816/76892‑76766 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |