| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4532499 = | 68 (0.640) | 10 (0.100) | 10/276 | 11.7 | 11.8% | intergenic (+49/‑433) | fimE/fimA | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/major type 1 subunit fimbrin (pilin) |
| ? | CP009273 | 4532813 = | 86 (0.870) | intergenic (+363/‑119) | fimE/fimA | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/major type 1 subunit fimbrin (pilin) | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTA > CP009273/4532351‑4532644 | ccATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑GAAAAAACAAATAAATACAAGACAAt > 2:118656/1‑149 (MQ=255) cATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAAtt < 2:1269781/149‑1 (MQ=255) acggtgCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCCCTTTTTGCCGGATTCTCAGAAAAAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTggg < 2:409172/146‑1 (MQ=255) aCTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTggg < 2:751712/149‑1 (MQ=255) aCTGGGCGTTAAACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGCT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTggg < 2:1069488/149‑1 (MQ=255) tgtgCTTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTgg < 1:668272/146‑1 (MQ=255) tgtgCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGACGGATTAGGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACACTTgg > 1:681701/1‑146 (MQ=255) tgggtgtataTCGCGAGTAATGCTGCTCGGTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTggg < 1:322716/140‑1 (MQ=255) gttctttATACCGTCAGGAATGCTGCTCGTGTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTggg < 1:625016/141‑1 (MQ=255) gcgCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTggg < 1:436261/144‑1 (MQ=255) tgCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGGTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGGCa > 2:210691/1‑149 (MQ=255) tgCGTTAGACCGCAAATAATGTTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAACAATCTCATCAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTgggg < 1:6891/146‑1 (MQ=255) ataCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGt < 2:77540/149‑1 (MQ=255) acaCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGCGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGt < 2:680705/147‑1 (MQ=255) aCCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTTAAAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTc < 2:251195/149‑1 (MQ=255) cGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTc < 1:1645244/146‑1 (MQ=255) cGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTc > 1:1625705/1‑146 (MQ=255) gCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTGCata > 2:1136825/1‑149 (MQ=255) ccAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAGGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAATACAATTGGGGCCAAACTGTCCatat < 2:992830/149‑1 (MQ=255) ccAGTAATGCGGCTCGTTTTGCCGGGTTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCatat < 2:1402443/149‑1 (MQ=255) gaGTAATGCTGCTCGTTTTGGCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCattttgactca < 1:250845/145‑11 (MQ=255) gctCGTTTTGACGGCTTATGGGAAAGAAATACTCTAATTAACGACAAATTAAAAAGAGCAGAGGTTTGATTTAATTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑t < 2:1250805/149‑1 (MQ=255) ctCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCataaataa > 1:856327/1‑146 (MQ=255) ctCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑tt > 2:1122243/1‑149 (MQ=255) ctCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCAATATCATAAATAAG‑tt > 2:1152468/1‑149 (MQ=255) gTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACg > 2:313718/1‑149 (MQ=255) ccGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTAt > 1:939287/1‑146 (MQ=255) ggATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAATCAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTAtttttt < 2:1198469/149‑1 (MQ=255) ggATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATCAATAAG‑TTACGTAtttttt < 2:1292906/149‑1 (MQ=255) ggATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAAGTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TAACGTAttt > 1:797677/1‑146 (MQ=255) gactATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAGTGGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTtc < 2:809244/146‑1 (MQ=255) aTTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTtct < 2:1252100/149‑1 (MQ=255) ggAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATGAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAATACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCaa < 1:912818/146‑1 (MQ=255) gaaagaaaTAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGCTTTGATTTAACTGATTTAGAATAAAGGG‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGAGCCAAACTGGCCATATCATAAACAAA‑TTCCTTAATTTTTCTCAAGCAt > 2:443086/1‑149 (MQ=255) aataatCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGAGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATaaa > 1:1792/1‑146 (MQ=255) tctcATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAAAAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTaa > 2:86945/1‑149 (MQ=255) aTAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTaaaaaa < 2:1615961/149‑1 (MQ=255) aTAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTaaa > 1:1625135/1‑146 (MQ=255) aaCGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTaaaaaa < 1:577005/146‑1 (MQ=255) cGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACa > 2:1616817/1‑149 (MQ=255) gAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCAGAAAGAGATTAAAAAACGaaaa > 2:153097/1‑149 (MQ=255) aaaaaTTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGAc > 1:1186673/1‑146 (MQ=255) ataaaaaaGACAAAAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAAAACAAGACAATGGGGGCCAACCTGTCCATACCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACAaaaaaa < 1:316486/143‑1 (MQ=255) aTTAAAAAGAGAAGAGGTTGGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATGAAAATATTAAAAAACGACAAAAAgg > 2:1306679/1‑148 (MQ=255) ttAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAACACCAAATAAAGACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCa < 2:1741247/149‑1 (MQ=255) aaaGGGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCAt < 1:1188935/146‑1 (MQ=255) aagagaagagGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTaa < 2:653493/149‑1 (MQ=255) agagGGTTAATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGAACATTTTGTGCATA‑CAAATTGCGGTTTATGTATGTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGttt < 2:861226/149‑1 (MQ=255) taagTTTGATTTAACTGATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTg < 2:258480/146‑1 (MQ=255) gagGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTTTTAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGt > 1:1564939/1‑146 (MQ=255) acgTTTGAATGAAATTATTGAAAAAAAAGAA‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAAGTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAAAGACAAAAAGCATCTAACTGtt < 1:565408/144‑1 (MQ=255) tttGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGatat > 2:253223/1‑149 (MQ=255) ttGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGAGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAGGCATCTAACTGTTTGat > 1:747604/1‑146 (MQ=255) ttAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTACCTGTTTGATATGTAAat > 2:86305/1‑149 (MQ=255) ttAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAat < 2:1025272/149‑1 (MQ=255) aCTTATTTATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGCCAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAat < 1:50967/146‑1 (MQ=255) gATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTAtt > 2:1476126/1‑149 (MQ=255) aataaAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTa > 2:701885/1‑149 (MQ=255) t‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAaattaatt > 2:1521681/1‑149 (MQ=255) aaaaaaCAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAaattaat < 1:222308/146‑1 (MQ=255) aaaaaaCAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTc > 2:444273/1‑149 (MQ=255) aaaaaCAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACAGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATGTAAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACGGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAaattaatt > 1:439930/1‑146 (MQ=255) aaCAAAAAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCAGCTAACTGTTTCATATGTAAATTATTTCTATGGTAAAGTTATTTCACAt > 2:1419249/1‑149 (MQ=255) 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aaGACAATGGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCCCCTCCGCt < 1:829466/146‑1 (MQ=255) catttGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCCCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTatat < 1:1309140/143‑1 (MQ=255) ttGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTa > 1:337388/1‑146 (MQ=255) | CCATACTGTGCGTTATACCGCCAGTAATGCTGCTCGTTTTGCCGGATTATGGGAAAGAAATAATCTCATAAACGAAAAATTAAAAAGAGAAGAGGTTTGATTTAACTTATTGATAATAAAGTT‑AAAAAAACAAATAAATACAAGACAATTGGGGCCAAACTGTCCATATCATAAATAAG‑TTACGTATTTTTTCTCAAGCATAAAAATATTAAAAAACGACAAAAAGCATCTAACTGTTTGATATGTAAATTATTTCTATTGTAAATTAATTTCACATCACCTCCGCTATATGTA > CP009273/4532351‑4532644 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |