| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1735255 = | 58 (0.890) | 7 (0.120) | 7/238 | NT | 12.1% | intergenic (+5/‑123) | mepH/sodB | murein DD‑endopeptidase, space‑maker hydrolase/superoxide dismutase, Fe |
| ? | NC_000913 | 1735283 = | 49 (0.830) | intergenic (+33/‑95) | mepH/sodB | murein DD‑endopeptidase, space‑maker hydrolase/superoxide dismutase, Fe | |||||
CGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATAAAGGAGAGTAGCAATGTCATTCGAATTACCTG > NC_000913/1735121‑1735396 | cggcaacggcaaATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTAc < 3:278601/149‑1 (MQ=255) gcatatggtagtgaaggtaattcgaatgacattgctactctcctttattattaatttgcatacgtacaatagccttattgtgcgtatggatagggtagcaaattaaaaggtgggacaaaagatgaacTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACa > 3:60894‑M1/128‑149 (MQ=255) gcaaATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCTGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAg < 2:512304/149‑1 (MQ=255) caaATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAgg < 2:598596/149‑1 (MQ=255) aaTTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAgg > 3:524956/1‑147 (MQ=255) aaTTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAgg < 4:524956/147‑1 (MQ=255) gtagtgcaggtaattcgaatgacattgctactctcctttattattaatttgcatacgtacaatagccttattgtgcgtatggatagggtagcaaattaaaaggtgagacaaaagatgaacTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAg > 3:324044‑M1/121‑149 (MQ=255) tATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGt < 1:283985/149‑1 (MQ=255) agtgcaggtaattcgaatgacattgctactctcctttattattaatttgcatacgtacaatagccttattgtgcgtatggatagggtagcaaattaaaaggtgagacaaaagatgaacTTTACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGt > 3:13814‑M1/119‑149 (MQ=255) tCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCACATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAACAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCa < 1:5068/149‑1 (MQ=255) aGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATc > 1:478159/1‑149 (MQ=255) gTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCt > 1:186537/1‑149 (MQ=255) aCCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCtttt > 3:280689/1‑149 (MQ=255) gcgcACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGtc < 2:186537/149‑1 (MQ=255) cacaGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCa < 2:116586/149‑1 (MQ=255) acaGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCAc > 4:102634/1‑149 (MQ=255) acaGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCAc > 3:300759/1‑149 (MQ=255) aGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCt < 2:33202/149‑1 (MQ=255) gTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCttt < 3:148021/149‑1 (MQ=255) gTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCttt > 3:4694/1‑149 (MQ=255) gTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCtt < 2:216992/148‑1 (MQ=255) gTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCtt > 1:216992/1‑148 (MQ=255) aGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTaa > 3:424330/1‑149 (MQ=255) aGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTaa < 4:275159/149‑1 (MQ=255) gAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAAtt < 4:300759/149‑1 (MQ=255) tactctcctttattattaatttgcatacgtacaatagccttattgtgcgtatggatagggtagcaaattaaaaggtgagacaaaagatgaacTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAgg > 2:277352‑M1/93‑116 (MQ=255) tactctcctttattattaatttgcatacgtacaatagccttattgtgcgtatggatagggtagcaaattaaaaggtgagacaaaagatgaacTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAgg < 1:277352‑M1/24‑1 (MQ=255) aTTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGc < 2:301555/149‑1 (MQ=255) ttCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCtgtt > 2:337690/1‑100 (MQ=255) ttCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCtgtt < 1:337690/100‑1 (MQ=255) ttCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCt > 1:428968/1‑149 (MQ=255) aaaTCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTAcc > 3:500896/1‑149 (MQ=255) aaaTCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTAcc > 3:560517/1‑149 (MQ=255) aaaTCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTAcc > 1:93531/1‑149 (MQ=255) aaTCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTAccc > 2:2680/1‑149 (MQ=255) ttaatttgcatacgtacaatagccttattgtgcgtatggatagggtagcaaattaaaaggtgagacaaaagatgaacTT‑Ac > 1:425973‑M1/78‑81 (MQ=255) ttaatttgcatacgtacaatagccttattgtgcgtatggatagggtagcaaattaaaaggtgagacaaaagatgaacAT‑Ac < 2:425973‑M1/4‑1 (MQ=255) tctcAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATAc > 1:551073/1‑149 (MQ=255) tcAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGc > 1:296158/1‑149 (MQ=255) gACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAg > 4:42202/1‑149 (MQ=255) tactGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCt > 3:234853/1‑149 (MQ=255) aGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTAc < 2:478159/149‑1 (MQ=255) aGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTAc > 2:256335/1‑149 (MQ=255) ccttattgtgcgtatggatagggtagcaaattaaaaggtgagacaaaagatgaacTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTaa < 3:103810‑M1/28‑1 (MQ=255) ccttattgtgcgtatggatagggtagcaaattaaaaggtgagacaaaagatgaacTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTaa > 4:103810‑M1/56‑83 (MQ=255) gcCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTa < 4:75479/149‑1 (MQ=255) ccACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTAt > 1:329884/1‑149 (MQ=255) aCTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGc < 2:197788/149‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATtaa < 1:314703/149‑1 (MQ=255) ggCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATtaat < 2:188632/149‑1 (MQ=255) gcTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATtaataat > 2:173930/1‑149 (MQ=255) tcgtcgGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATtaataataa > 2:245264/1‑149 (MQ=255) tcgtcgGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATtaataataa < 2:551073/149‑1 (MQ=255) cgtcgGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAGACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGTTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATaaa < 4:433891/149‑1 (MQ=255) cgtcgGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATaaa < 4:4694/149‑1 (MQ=255) cgtcgGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATaaa < 2:394159/149‑1 (MQ=255) aaTGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATAAAGGAGAGTa < 3:102634/149‑1 (MQ=255) cccAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATAAAGGAGAGTAGCAATg > 2:105612/1‑149 (MQ=255) cccAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATAAAGGAGAGTAGCAATg < 2:329884/149‑1 (MQ=255) ccAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATAAAGGAGAGTAGCAATGt > 2:69585/1‑149 (MQ=255) aaCACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACACACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATAAAGGAGAGTAGCAATGTCATTc < 4:138135/149‑1 (MQ=255) ttCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATAAAGGAGAGTAGCAATGTCATTCGAAtt > 2:345902/1‑149 (MQ=255) ttCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATAAAGGAGAGTAGCAATGTCATTCGAAtt > 2:210234/1‑149 (MQ=255) cGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATAAAGGAGAGTAGCAATGTCATTCGAATTAc < 2:33229/149‑1 (MQ=255) gCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATtaa > 3:131599/1‑114 (MQ=255) gCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATtaa < 4:131599/114‑1 (MQ=255) tAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATAAAGGAGAGTAGCAATGTCATTCGAATTACCTg > 3:379084/1‑149 (MQ=255) | CGGCAACGGCAAATTTATTCAGTCACCGCGCACAGGTCAGGAAATTCAAATCACTTCTCTCAGTGAAGACTACTGGCAGCGCCACTATGTTGGCGCTCGTCGGGTAATGACCCCAAAAACACTTCGCTAAAACTTT‑ACCCTGTTGTTACGGCAACAGGGTAAGTTCATCTTTTGTCTCACCTTTTAATTTGCTACCCTATCCATACGCACAATAAGGCTATTGTACGTATGCAAATTAATAATAAAGGAGAGTAGCAATGTCATTCGAATTACCTG > NC_000913/1735121‑1735396 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |