| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1431308 | 196 (0.960) | 20 (0.100) +GGAATACATTAA |
4/466 | 17.1 | 9.3% | coding (2260/3363 nt) | stfR | Rac prophage; putative tail fiber protein |
| ? | NC_000913 | 1431309 = | 205 (0.950) | coding (2261/3363 nt) | stfR | Rac prophage; putative tail fiber protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
ATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGA‑TACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGC > NC_000913/1431033‑1431586 | tACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGaa < 2:853760/279‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAAAAAATCCGGCGACGAAAGTTATCGCGGCGTGCTTTATCCTTGATTTTGATAGTGGGCGTTGTTTTTATTAGTCACATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGaa < 3:972186/275‑1 (MQ=255) ccTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGaa < 1:1136357/274‑1 (MQ=255) ccTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGaa < 3:603838/274‑1 (MQ=255) ataAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTT‑TCTTGGTTAAAATTTTTTTGCCACAGACGAAATGGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGGGCAGTATGGCGTAATGATGGTTCTTAAACGTAACTGCTGCTTAACAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACa > 1:594687/1‑275 (MQ=255) taAGTTTGGGGGAACAAATCCGGCGACTGAATGTGTCGCGGCGGACTTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTTGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGa < 4:274914/280‑1 (MQ=255) taAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGGGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATTGCGATAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGTTGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAATACATTAAGa > 4:710402/1‑280 (MQ=255) tGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGACATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTCAAACCGttt > 2:3067/1‑280 (MQ=255) tGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGAc > 1:156728/1‑275 (MQ=255) tGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATCGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGTCCGttt > 2:200219/1‑280 (MQ=255) ggggCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGGGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACTAATCAAG‑TTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATTCATTAAGTcc > 1:613565/1‑275 (MQ=255) gggCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTGTGTTGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGCAAGTTTGc > 4:630259/1‑280 (MQ=255) gggCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTACGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGTCGTAATCGTAGCTCGTGGTGGTAATCAGATTTGAATGATATGTTGGGAGTAG‑GGTGCAGTATGGTGTAATGTTGTCGCACAAACCTACCTGCCGCTTTCCACTCAAGTGTAAT‑TGTATTGTTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTATACTTTAATACCg > 3:978593/1‑275 (MQ=255) aacaaATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTg < 1:1174552/275‑1 (MQ=255) caaATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGCCGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCTTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAACACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGAAAGGTCGGGAGTAT‑GGTGGCTTAAGGCGTAATTAGGGCTCTAAACCTTACCTGCTGCTTATCAAACTAG‑GTGATGTTTTAGGTGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCATCCATTAACACCGTTTgt > 3:1019017/1‑273 (MQ=255) caaATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTCGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGc > 1:1209577/1‑274 (MQ=255) aaaGCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGAt < 2:623740/280‑1 (MQ=255) cTGAATGTATCGCGGCGTACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGATTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGc < 1:202332/274‑1 (MQ=255) aaTGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGa < 2:774771/280‑1 (MQ=255) tCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGGGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTTTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGaa < 1:16465/275‑1 (MQ=255) tCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGaa < 3:27553/275‑1 (MQ=255) ggcggACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGACTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATGATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAAACAAG‑GTGATGATTATGGTGGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATAAAGACCGTTTGCTATGGATAATGCAAACGGCGAATTgg > 3:1228879/1‑275 (MQ=255) gACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCTT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGAGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGAATTATGGCGTAATGATGGGGCTAAACCTTACCTGCTGCTTACAACTAAAG‑GAGATGTTTATGGTGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACAGTGAGACTGTTTCCTATTGGTAACGGACACGGTGAACtactgatagaga > 4:676859/1‑269 (MQ=255) gACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACATGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTa > 3:423537/1‑274 (MQ=255) tcTTGATTTTAAGAGTGTGCTGGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATGACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGGCGCAGACGAAATTGTAGCGCGGGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAGAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCa < 1:962969/274‑1 (MQ=255) taaggttGGGCGTGGTTTTTATGTGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGt < 2:629359/274‑1 (MQ=255) tAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCg < 3:829481/275‑1 (MQ=255) aaGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGt < 2:75441/223‑1 (MQ=255) aaGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGt > 4:75441/1‑223 (MQ=255) tGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGaa > 4:450842/1‑279 (MQ=255) tGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGaa < 2:450842/279‑1 (MQ=255) ggCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTCGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACAAAACTGTCCGCAAGTCTg > 1:1105184/1‑275 (MQ=255) ggCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCTGGAATACATTAAGGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGc > 2:112054/1‑280 (MQ=255) ggCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTg > 3:161397/1‑275 (MQ=255) ggCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTg < 3:905199/275‑1 (MQ=255) ggCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATCGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCATACATTAAGAACGTTTGCTATTTATAACGCAACCGGCGATCTGGTTATTGGAACCAAACTTTCCGCAAGTGTGAACgg > 4:55795/1‑280 (MQ=255) gTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGt < 3:946050/275‑1 (MQ=255) ttttATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCTTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCCAACTGGTTCTTTGAACCAAACTTTCCGAATGACTGAACGGaaa > 3:1152558/1‑275 (MQ=255) tttttaGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGTTAAATTGTAGT‑GCAAAAAACTTGTGGCAACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGGAT‑GGTGCATTATGGCGTAAGGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCTGGAATACATTAAGGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGaa < 4:112054/274‑1 (MQ=255) aTGAGTCTCATTCGTGAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAAc < 2:82017/280‑1 (MQ=255) 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tCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCACCCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCGGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTAACGTTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGA‑TACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTg < 1:978593/275‑1 (MQ=255) g‑gTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGA‑TACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACa < 2:427116/280‑1 (MQ=255) tGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGA‑TACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAAACTGAGGCTTaaa > 3:1204158/1‑273 (MQ=255) tATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGA‑TACATATGCCGATGCGGATGGTGGAGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCAccc > 2:335291/1‑280 (MQ=255) tggtggCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGATTACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTTCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGTCATAACGGCAACGGA‑TACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTGACAATGTCa > 1:872326/1‑275 (MQ=255) ggtggCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGA‑TACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCAc < 1:838123/275‑1 (MQ=255) tggCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCaa < 3:557163/156‑1 (MQ=255) | ATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAATTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTAT‑GGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGA‑TACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGC > NC_000913/1431033‑1431586 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |