| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1431308 | 196 (0.960) | 20 (0.100) +GGAATACATTAA |
4/466 | 17.1 | 9.3% | coding (2260/3363 nt) | stfR | Rac prophage; putative tail fiber protein |
| ? | NC_000913 | 1431309 = | 205 (0.950) | coding (2261/3363 nt) | stfR | Rac prophage; putative tail fiber protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
ATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGA‑TACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGC > NC_000913/1431033‑1431586 | aTACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGaa < 2:96606/280‑1 (MQ=255) aCCTATAAGTTTGGGGCAAAAAATCCGGCGACGAAAGTTATCGCGGCGTGCTTTATCCTTGATTTTGATAGTGGGCGTTGTTTTTATTAGTCACATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGaa < 3:972186/275‑1 (MQ=255) ccTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGaa < 3:603838/274‑1 (MQ=255) ccTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGaa < 1:1136357/274‑1 (MQ=255) ataAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGCGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GGTATTGTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCATa > 3:179079/1‑273 (MQ=255) ataAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTT‑TCTTGGTTAAAATTTTTTTGCCACAGACGAAA‑TGGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGGGCAGTATGGCGTAATGATGGTTCTTAAACGTAACTGCTGCTTAACAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACa > 1:594687/1‑275 (MQ=255) taAGTTTGGGGGAACAAATCCGGCGACTGAATGTGTCGCGGCGGACTTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTTGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGa < 4:274914/280‑1 (MQ=255) taAGTGTGGTGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCAATCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGa < 2:758491/280‑1 (MQ=255) ttGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGt < 2:624362/279‑1 (MQ=255) ttGGGGCAACAAAGCCGGCGACTGAATGTATCGCTGCCGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTATGCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGa < 1:934232/275‑1 (MQ=255) tGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGAc > 1:156728/1‑275 (MQ=255) tGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGAc > 1:780574/1‑275 (MQ=255) tGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGAc > 1:905199/1‑275 (MQ=255) tGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGttt > 4:716834/1‑280 (MQ=255) tGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATCGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGTCCGttt > 2:200219/1‑280 (MQ=255) ggggCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGGGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACTAATCAAG‑TTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATTCATTAAGTcc > 1:613565/1‑275 (MQ=255) gggCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTGTGTTGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGCAAGTTTGc > 4:630259/1‑280 (MQ=255) gggCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAAACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTg > 2:178232/1‑279 (MQ=255) gggCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTACGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGTCGTAA‑TCGTAGCTCGTGGTGGTAATCAGATTTGAATGATATGTTGGGAGTAGGGTGCAGTATGGTGTAATGTTGTCGCACAAACCTACCTGCCGCTTTCCACTCAAGTGTAAT‑TGTATTGTTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTATACTTTAATACCg > 3:978593/1‑275 (MQ=255) aacaaATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTg < 1:1174552/275‑1 (MQ=255) acaaATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGc < 1:764339/275‑1 (MQ=255) acaaATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTCTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGGGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTCTGTTGCATTATGTCGTAATGATGGCGCGAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGGGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACTTTACGACTGATTGc > 3:218831/1‑275 (MQ=255) caaATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGCCGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCTTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAACACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGAAAGGTCGGGAGTATGGTGGCTTAAGGCGTAATTAGGGCTCTAAACCTTACCTGCTGCTTATCAAACTAG‑GTGATGTTTTAGGTGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCATCCATTAACACCGTTTgt > 3:1019017/1‑273 (MQ=255) caaATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTCGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGc > 1:1209577/1‑274 (MQ=255) cTGAATGTATCGCGGCGTACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGATTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGc < 1:202332/274‑1 (MQ=255) aaTGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGa < 2:774771/280‑1 (MQ=255) tCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGGGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTTTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGaa < 1:16465/275‑1 (MQ=255) tCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGaa < 3:27553/275‑1 (MQ=255) ggcggACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGACTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATGATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAAACAAG‑GTGATGATTATGGTGGAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATAAAGACCGTTTGCTATGGATAATGCAAACGGCGAATTgg > 3:1228879/1‑275 (MQ=255) cggACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTAt > 2:226737/1‑277 (MQ=255) gACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCTT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGAGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGAATTATGGCGTAATGATGGGGCTAAACCTTACCTGCTGCTTACAACTAAAG‑GAGATGTTTATGGTGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACAGTGAGACTGTTTCCTATTGGTAACGGACACGGTGAACtactgatagaga > 4:676859/1‑269 (MQ=255) 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tCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGA‑TACATATGCCGATg < 1:1041099/242‑1 (MQ=255) tGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGA‑TACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAAACTGAGGCTTaaa > 3:1204158/1‑273 (MQ=255) tATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGA‑TACATATGCCGATGCGGATGGTGGAGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCAccc > 2:335291/1‑280 (MQ=255) cT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGA‑TACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGc < 2:630259/280‑1 (MQ=255) | ATACGACCTATAAGTTTGGGGCAACAAATCCGGCGACTGAATGTATCGCGGCGGACGTTATCCTTGATTTTAAGAGTGGGCGTGGTTTTTATGAGTCTCATTCGTTAATCGTTAACGATAACTTGTCGT‑GCAAAAAACTTTTTGCCACAGACGAAA‑TTGTAGCGCGTGGTGGTAATCAGATTCGAATGATAGGTGGGGAGTATGGTGCATTATGGCGTAATGATGGCGCTAAAACTTACCTGCTGCTTACCAATCAAG‑GTGATGTTTATGGTGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGAATACATTAAGACCGTTTGCTATTGATAACGCAACCGGCGAACTGGTTATTGGAACCAAACTGTCCGCAAGTCTGAACGGTAATGCATTAACAGCAACAAAGCTGCAAACGCCAAGACGGGTTTCTGGTGTTGAGTTTGATGGTTCCAAAGATATTACTTTAACCGCCGCGCATGTGGCTGCTTTTGCCAGAAGGGCAACGGA‑TACATATGCCGATGCGGATGGTGGCGTTCCATGGAATGCCGAATCTGGCGCTTACAATGTCACCCGCTCTGGC > NC_000913/1431033‑1431586 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |