| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3854888 | 131 (0.790) | 3 (0.020) | 3/496 | 15.5 | 2.4% | coding (967/1185 nt) | emrD | multidrug efflux system protein |
| ? | NC_000913 | = 3854930 | 116 (0.720) | coding (1009/1185 nt) | emrD | multidrug efflux system protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GCGTGCTGATGGGCGCGGTGTTAGGGCTGAGCAGTATGACGGTCAGTATTTTGTTTATTCTGCCGATTCCGGCAGCGTTTTTTGGCGCATGGTTTGCCGGACGTCCCAATAAACGCTTCTCCACGTTAATGTGGCAGTCGGTTATCTGCTGCCTGCTGGCTGGCTTGCTGATGTGGATCCCCGACTGGTTTGGCGTGATGAATGTCTGGACGCTGCTCGTTCCCGCCGCGCTGTTCTTTTTCGGTGCCGGGATGCTGTTTCCGCTGGCGACCAGCGGCGCGATGGAGCCGTTCCCCTTCCTGGCGGGCACGGCTGGCGCGCTGGTCGGCGGTCTGCAAAACATTGGTTCCGGCGTGCTGGCGTCGCTCTCT‑GCGATGTTGCCGCAAACCGGTCAGGGCAGCCTGGGGTTGTTGATGACCTTAATGGGATTGTTGATCGTGCTGTGCTGGCTGCCGCTGGCGACGCGGATGTCGCA‑TCAGGGGCAGCCCGTTTAAGCGCACGTCACCGCAGCATCGTCATCAGCTCCATGGGAGAACGATGCTG > NC_000913/3854613‑3855155 | ggttGCTGGTGGGCGGTGTGTTAGGGCTGCTGTGTTTGACGGTTATTAGTTTGTTTATTCTCCCGATTCCGGGTGCGTTTTTTGGCGCCTGGTTTGCCGGACGTCCCAATAAACGCTTCTCCACGTTAATGTGGCGGTCGGTTATCTGCTGCCTGCTGGCTGGCTTGCTGATGTGGATCCCCGACTGGTTTGGCGTGATGAATGTCTGGACGCTGCTCGTTCCCGCCGCGCTGTTCTTTTTCGGTGCCGGGATGCTGTTTCCGCTGGCGACCAgcgg < 4:294448/274‑1 (MQ=255) gggCTGATGGGGGGGGTGTTAGGGCGGGTCAGTATGACGGTCAGTATTTTGGTTATTCTGCCGATTCCGGCAGCGTTTTTTGGCGCATGGTTTGCCGGACGTCCCAATAAACGCTTCTCCACGTTAATGTGGCAGTCGGTTATCTGCTGCCTGCTGGCTGGCTTGCTGATGTGGATCCCCGACTGGTTTGGCGTGATGAATGTCTGGACGCTGCTCGTTCCCGCCGCGCTGTTCTTTTTCGGTGCCGGGATGCTGTTTCCGCTGGCGACCAgcgg < 3:103705/273‑1 (MQ=255) tGCTGATGGGCGCGGTGTTAGGGCTGAGCAGTATGACGGTCAGTATTTTGTTTATTCTGCCGATTCCGGCAGCGTTTTTTGGCGCATGGTTTGCCGGACGTCCCAATAAACGCTTCTCCACGTTACTGTGGCAGTCGGTTATCTGCTGCCTGCTGGCTGGCTTGCTGATGTGGATCCCCGACTGGTTTGGCGTGATGAATGTCTGGACGCGTCTCGTTCCCGCCGCGCTGTTCTTTTTCGGTGCCGGGGTGCTTTTTCCCCTGGCGCCCcgcgc > 3:894360/1‑273 (MQ=255) gATGGGTGGGGTGTTAGGGCTGAGCAGTATGACGGTCAGTATTTTGTTTATTCTGCCGGTTCCGGCAGCGTTTTTTGGCGCATGGTTTGCCGGACGTCCCAATAAACGCTTCTCCACGTTAATGTGGCAGTCGGTTATCTGCTGCCTGCTGGCTGGCTTGCTGATGTGGATCCCCGACTGGTTTGGCGTGATGAATGTCTGGACGCTGCTCGTTCCCGCCGCGCTGTTCTTTTTCGGTGCCGGGATGCTGTTTCCGCTGGCGACCAGCGGCGCGATgg < 2:711961/278‑1 (MQ=255) cgcgGTGTTAGGGCTGAGCAGTATGACGGTCAGTATTTTGTTTATTCTGCCGATTCCGGCAGCGTTTTTTGGCGCATGGTTTGCCGGACGTCCCAATAAACGCTTCTCCACGTTAATGTGGCAGTCGGTTATCTGCTGCCTGCTGGCTGGCTTGCTGATGTGGATCCCCGACTGGTTTGGCGTGATGAATGTCTGGACGCTGCTCGTTCCCGCCGCGCTGTTCTTTTTCTGTGCCGGGATGCTGTTTCCGCTGGCGACCAGCGGCGCGGTgggtc > 2:201235/1‑272 (MQ=255) cgcgGTGTTAGGGCTGAGCAGTATGACGGTCAGTATTTTGTTTATTCTGCCGATTCCGGCAGCGTGTTTTGGCGCATGGTTTGCCGGACGTCCCAATAAACGCTTCTCCACGTTAATGTGGCAGTCGGTTATCTGCTGCCTGCTGGCTGGCTTGCTGATGTGGATCCCCGACTGGTTTGGCGTGATGAGTGTCTGGACGCTGCTCGTTCCCGCCGCGCTGTTCTTTTTCGGTGCCGGGATGCTGTTTCCGCTGGTTGCCAGCGtcgccgcggagc > 1:447433/1‑267 (MQ=255) gtgtTGGGGCTTAGCAGTATGACGTTCAGTATTTTGTTTATTCTGCCGATTCCGGCGGCGTTTTTTGGGGCATGGTTTGCCGGACGTCCCAATAAACGCTTCTCCACGTTAATGTGGCAGTCGGTTATCTGCTGCCTGCTGGCTGGCTTGCTGATGTGGATCCCCGACTGGTTTGGCGTGATGAATGTCTGGACGCTGCTCGTTCCCGCCGCGCTGTTCTTTTTCGGTGCCGGGATGCTGTTTCCGCTGGCGACCAGCGGCGCGATGGAGCCGtt < 3:794442/275‑1 (MQ=255) tgtTAGGGCTGAGCAGGATGACTGTCAGTAGTTTGTTTATTCTGCCGATTCCGGCAGCGTTTTTTGGCGCATGGTTTGCCGGACGTCCCAATAAACGCTTCTCCACGTTAATGTGGCAGTCGGTTATCTGCTGCCTGCTGGCTGGCTTGCTGATGTGGATCCCCGACTGGTTTGGCGTGATGAATGTCTGGACGCTGCTCGTTCCCGCCGCGCTGTTCTTTTTCGGTGCCGGGATGCTGTTTCCGCTGGCGACCAGCGGCGCGATGGAGCCGtt < 1:40539/274‑1 (MQ=255) gAGCAGTATGACGGTCAGTATTTTGTTTATTCTGCCGATTCCGGCAGCGTTTTTTGGCGCATGGTTTGCCGGACGTCCCAATAAACGCTTCTCCACGTTACTGTGGCAGTCGGTTATCTGCTGCCTGCTGGCTGGCTTGCTGATGTGGATCCCCGACTGGTTTGGCGTGATGAATGTCTGGACGCTGCTCGTTCCCGCCGCGCTGTTCTTTTTCGGTGCCGGGATGCTGTTTCCGTTGGCGACCAGCGGCGCGATGGAGCCGTTCCCCTTCCTg > 1:349757/1‑274 (MQ=255) gAGCAGTATGACGGTCAGTATTTTGTTTATTCTGCCGATTCCGGCAGCGTTTTTTGGCGCATGGTTTGCCGGACGTCCCAATAAACGCTTCTCCACGTTAATGTGGCAGTCGGTTATCTGCTGCCTGCTGGCTGGCTTGCTGATGTGGATCCCCGACTGGTTTGTCGTGATGAATGTCTGGACGCTGCTCGTTCCCGCCGCGCTGTTCTTTTTCGGTGCCGGGATGCTGTTTCCGCTGGCGACCCGGGGCGCGCTGGAGCCGTTCCCCTTCCttg > 1:760170/1‑273 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |