| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 3804223 | 3804535 | 313 | 40 [39] | [36] 43 | waaS | lipopolysaccharide rhamnose:KdoIII transferase; lipopolysaccharide core biosynthesis protein |
CTTCATAAGATATTTGTTTTTCAATCAAATACTTTGAAGTCGTAGATGATGTCTTATCTTTGACAACATTAAAATCTAGCTTACATCCTAGTGTTGTTAATCTCTCGGCTAACTCATTAATTATTTGAAGACGCCCTTTATCACGACCAAGGAAAAAACATATTGGCTGGCTGTTATTTTTGTCAGATAAACTATAATTTCTAATTTCATCCATTCC > NC_000913/3804486‑3804702 | ctTCATAAGATATTTGTTTTTCAATCAAATACTTTGAAGTCGTAGATGATGTCTTATCTTTGac > 2:513207/1‑64 (MQ=255)ctTCATAAGATATTTGTTTTTCAATCAAATACTTTGAAGTCGTAGATGATGTCTTATCTTTGac < 1:513156/64‑1 (MQ=255)ctTCATAAGATATTTGTTTTTCAATCAAATACTTTGAAGTCGTAGATGATGTCTTATCTTTGACAACATTAAAAt > 4:422253/1‑75 (MQ=255)ctTCATAAGATATTTGTTTTTCAATCAAATACTTTGAAGTCGTAGATGATGTCTTATCTTTGACAACATTAAAAt > 4:251921/1‑75 (MQ=255)ctTCATAAGATATTTGTTTTTCAATCAAATACTTTGAAGTCGTAGATGATGTCTTATCTTTGACAACATTAAAAt < 3:251928/75‑1 (MQ=255)ctTCATAAGATATTTGTTTTTCAATCAAATACTTTGAAGTCGTAGATGATGTCTTATCTTTGACAACATTAAAAt < 3:422265/75‑1 (MQ=255)ctTCATAAGATATTTGTTTTTCAATCAAATACTTTGAAGTCGTAGATGATGTCTTATCTTTGACAACATTAAAATCTAGCTTACATCCTAGTGTTGTTa > 3:193579/1‑99 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |