New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4067707 = | 97 (1.020) | 3 (0.030) | 3/286 | 10.7 | 3.3% | coding (1570/2037 nt) | yihQ | putative sulpholipid alpha‑glucosidase; alpha‑glucosyl fluoride glucosidase |
? | NC_000913 | 4067734 = | 83 (0.930) | coding (1543/2037 nt) | yihQ | putative sulpholipid alpha‑glucosidase; alpha‑glucosyl fluoride glucosidase | |||||
Rejected: Position hash score below cutoff. |
GCCGGACTTCGCATTCAGCGCGACGGCCTCTTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTTCTGGC > NC_000913/4067528‑4067895 | gCCGGACTTCGCATTCAGCGCGACGGCCTCTTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTtgc < 1:372309/200‑1 (MQ=255) gcgcGACGGCCTCTTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGCGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAAc < 1:579492/200‑1 (MQ=255) gCCTCTTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGggtggt > 1:816951/1‑200 (MQ=255) ccTCTTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGgtggtg < 1:598115/200‑1 (MQ=255) ctctTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGgtgt < 1:315608/200‑1 (MQ=255) ctctTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGgtgt < 1:572775/200‑1 (MQ=255) ctTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTaa > 1:429755/1‑200 (MQ=255) cAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGc > 1:526010/1‑200 (MQ=255) aGGTAATGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGAGAAATCGGCGACGGTTAGTGCATCACCGTCAAACTGCCAGTTGTCGACAGGTCGGTTATTTCCGGGGGTGCGCATCATCGGGGTGGAGGCGCTGAAATTGCACCAgcgc < 2:818536/150‑1 (MQ=255) aaGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATg < 1:66039/200‑1 (MQ=255) ggTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCCAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGCGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAg > 4:524734/1‑141 (MQ=255) ggTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAg > 4:215070/1‑141 (MQ=255) gTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCgcagcagca > 2:385167/1‑150 (MQ=255) gTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCg > 1:813432/1‑200 (MQ=255) tCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCtg < 1:45501/200‑1 (MQ=255) cAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGctc < 2:484212/150‑1 (MQ=255) 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tCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTc < 1:589091/200‑1 (MQ=255) cATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCa < 1:581664/200‑1 (MQ=255) tACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTtgc < 3:304667/132‑1 (MQ=255) tACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTtgc < 3:93135/132‑1 (MQ=255) cGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAgg > 2:78697/1‑150 (MQ=255) 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3:195371/132‑1 (MQ=255) gTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAg > 2:203818/1‑150 (MQ=255) gTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGt > 1:167118/1‑200 (MQ=255) aCCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTc < 4:452774/128‑1 (MQ=255) aCCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTc > 3:452755/1‑128 (MQ=255) aCCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGCCTCCAGTCGACGTTCt > 1:531309/1‑200 (MQ=255) cTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCTTCATCTGCTCTTTGCTTCGCTTCCTCTCAAACAGCTTGTTCTAACCGCCACTTTCGCTGTGGTCCATGCCATGTcctctca > 3:351650/1‑127 (MQ=255) cTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCa > 3:629907/1‑132 (MQ=255) tCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCgccgcc > 2:667720/1‑150 (MQ=255) cGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGccgccg > 2:311106/1‑150 (MQ=255) gTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGc > 3:436662/1‑132 (MQ=255) cgcATCATCGGCGTGAGGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGAc < 3:587825/132‑1 (MQ=255) tcatcGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGTAGGCCATGTCCGGTCATTGTCAGCGACAGCGCCGCCCGGACAActgccg > 2:363521/1‑145 (MQ=255) tcatcGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACg < 2:298501/150‑1 (MQ=255) ggCGTGAGGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCTGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCAtggt < 1:787404/200‑1 (MQ=255) ggCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCAtggt < 1:550528/200‑1 (MQ=255) ggCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCAtggt < 1:26651/200‑1 (MQ=255) cGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGcc < 2:525954/150‑1 (MQ=255) tGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAg < 1:820334/200‑1 (MQ=255) ggCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAAc < 3:613584/132‑1 (MQ=255) gcTGAAAGCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTTACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCgag < 2:258340/150‑1 (MQ=255) tGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTTCTgg < 1:749244/200‑1 (MQ=255) gtttgagatgaaGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTGGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTTCTGGc > 1:799899/12‑200 (MQ=255) gAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTTCTGGc > 1:412623/1‑200 (MQ=255) aaaTCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCAtcg > 4:484016/1‑141 (MQ=255) cACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGTCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACCCCAGTcc > 2:130538/1‑149 (MQ=255) aGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCAtcgt < 3:215060/132‑1 (MQ=255) | GCCGGACTTCGCATTCAGCGCGACGGCCTCTTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTTCTGGC > NC_000913/4067528‑4067895 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |