New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4067707 = | 97 (1.020) | 3 (0.030) | 3/286 | 10.7 | 3.3% | coding (1570/2037 nt) | yihQ | putative sulpholipid alpha‑glucosidase; alpha‑glucosyl fluoride glucosidase |
? | NC_000913 | 4067734 = | 83 (0.930) | coding (1543/2037 nt) | yihQ | putative sulpholipid alpha‑glucosidase; alpha‑glucosyl fluoride glucosidase | |||||
Rejected: Position hash score below cutoff. |
GCGCGACGGCCTCTTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTTCTGGCTACCGGTAGAACCGGCGCGCATAAAGAAAAGGATC > NC_000913/4067545‑4067930 | gcgcGACGGCCTCTTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGCGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAAc < 1:579492/200‑1 (MQ=255) gCCTCTTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGggtggt > 1:816951/1‑200 (MQ=255) ccTCTTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGgtggtg < 1:598115/200‑1 (MQ=255) ctctTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGgtgt < 1:315608/200‑1 (MQ=255) ctctTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGgtgt < 1:572775/200‑1 (MQ=255) ctTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTaa > 1:429755/1‑200 (MQ=255) cAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGc > 1:526010/1‑200 (MQ=255) aaGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATg < 1:66039/200‑1 (MQ=255) gTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCg > 1:813432/1‑200 (MQ=255) tCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCtg < 1:45501/200‑1 (MQ=255) cGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGt > 1:436301/1‑200 (MQ=255) ggtggtCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTc < 1:1091/200‑1 (MQ=255) ggtggtCATACGGGCGAAATGGGCGACGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCAt < 2:227239/150‑1 (MQ=255) ggtCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCAtctc > 2:734117/1‑150 (MQ=255) 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< 3:195371/132‑1 (MQ=255) gTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAg > 2:203818/1‑150 (MQ=255) gTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGt > 1:167118/1‑200 (MQ=255) aCCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTc > 3:452755/1‑128 (MQ=255) aCCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTc < 4:452774/128‑1 (MQ=255) aCCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGCCTCCAGTCGACGTTCt > 1:531309/1‑200 (MQ=255) 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tGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTTCTgg < 1:749244/200‑1 (MQ=255) gtttgagatgaaGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTGGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTTCTGGc > 1:799899/12‑200 (MQ=255) gAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTTCTGGc > 1:412623/1‑200 (MQ=255) aaaTCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCAtcg > 4:484016/1‑141 (MQ=255) cACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGTCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACCCCAGTcc > 2:130538/1‑149 (MQ=255) aGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCAtcgt < 3:215060/132‑1 (MQ=255) gcgcAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCCATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCa > 4:628700/1‑141 (MQ=255) gcgcAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTTCTGGCTACCGGTAGAAc < 1:312308/200‑1 (MQ=255) gcgcAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCCCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACCCCAGTCGACggt > 2:384479/1‑148 (MQ=255) cagcagcTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTTCCAGCGACATCTCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGAAGCTCTGGTc > 2:715100/1‑150 (MQ=255) gcTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAACCGCGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTTCTGGCTACCGGTAGAACCGGCGCGCa > 1:577943/1‑200 (MQ=255) gcTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACattgg > 3:83264/1‑87 (MQ=255) gcTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACattgg < 4:83269/91‑5 (MQ=255) gcTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGCCGTTCTGGTcgcccg > 2:532415/1‑150 (MQ=255) gcTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTcgcccg > 2:185039/1‑150 (MQ=255) gctgcGCTTCATATCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGAGGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTcgcc < 4:351666/141‑1 (MQ=255) gcTTCATCTCAAACAGGGTTGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGGCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTTCTGGCTACCGGTAGAACCGGCGCGCATAAAGAAAAGGAtc < 1:577182/200‑1 (MQ=255) cTTCATCTCAAACGGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCAtggt < 2:429706/150‑1 (MQ=255) cTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCAtggt < 2:167106/150‑1 (MQ=255) tCAGCTCAATAAGGGTGGGTTGAG‑‑CGCCAAGGTCGATGTGGTGTAGGCCAGGTCCGGGCATTGCCAGCGACAGCGCGGCCGGGACAACCGAAGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGGCGACGTTCTGGTCGCAAGCCCACATCAtggtgg < 2:544758/150‑1 (MQ=255) | GCGCGACGGCCTCTTTCAGGTAAGGTTTCAGGGTGGTGAAGACGGTGGTCATACGGGCGAAATGGGCGATGGTTTCTGCGTCGCCGTCAAACTGCCAGTTGTCGCCAGGACGGTTACCTTCGTGGGTGCGCATCATCGGCGTGAAGGCGCTGAAATCGCACCAGCGCAGCAGCAGCTCTTTGCTGCGCTTCATCTCAAACAGGGTGGTGTAAC‑‑CGCCAATGTCGCTGTGGTGCAGGCCATGTCCGGTCATTGCCAGCGACAGCGCCGCCGGGACAACCGACGCCAGGCCATCGTCGAGACTCCAGTCGACGTTCTGGTCGCCCGCCCACATCATGGTGGAGTATTTCTGGCTACCGGTAGAACCGGCGCGCATAAAGAAAAGGATC > NC_000913/4067545‑4067930 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |