| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 76896 = | 4388 (0.990) | 281 (0.070) | 124/226 | 14.7 | 6.9% | intergenic (‑145/+40) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein |
| ? | CP016816 | = 76892 | 3643 (0.910) | intergenic (‑141/+44) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 953 total aligned reads displayed.
AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑A‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaa‑aaaaaa‑a‑aGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < CP016816/76892‑76766 AGTTTATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGAAATAAAAAACATATATAAACACAAATTATTATAATAAATAAATTCATCTGTTAAATTTAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A < 1:6767980/128‑1AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTTTGAAAATGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A > 1:1751255/1‑128AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATTATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A > 2:3097126/1‑128AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGCTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A > 1:7250743/1‑128AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGATAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A > 1:5739262/1‑128 GTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATAATTAGAAGAAATCAATTCATCTCTGAAATTGAAATTCTAATAAATTGTAAAATTATATGTTAATT‑AC‑AA > 2:1863867/1‑128 TGATATTAAAGTAAATATCACTTATTTAGATATAAAAAAAATCTATATAGAAAAATTATTATAATAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAA < 1:834629/128‑1 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTTATAAAATTATATGTTAGTT‑CA‑AAAA > 2:2560795/1‑128 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATATTAGTA‑CC‑AAAAA > 1:1271286/1‑128 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTAATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGATAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA > 1:5169003/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTTAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑A > 2:7249736/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTT‑AC‑AAAAA‑A > 1:4432846/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAACCATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAGAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AA > 2:8113744/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTATTAATTGTTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAtata > 2:5261681/1‑124 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AA > 2:7668651/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AA > 2:8267827/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTATATATAAAAAACATATAAATATAAAAATTATTAGAATAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAA < 1:4660994/128‑1 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTTTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAA > 2:5919011/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAA > 1:2038242/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAA > 2:1133640/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAA > 1:3362874/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAA > 2:2730246/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATAGGTAAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAA > 2:8428605/1‑128 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA > 1:7683449/1‑128 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCGATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATAATATGTTAGTT‑AC‑AAAAA‑AAAAAA > 2:1188843/1‑128 AAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A > 1:7831655/1‑128 AAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A > 1:9144331/1‑128 acTAAATATCACTGATTTATATATAAAAAACATATATATATACAAATTATTACAAGAAATCAATTCATCTGTTAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑A < 1:3238460/126‑1 AGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATATACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑A > 1:1389252/1‑128 AGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTTGTT‑CA‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑A > 2:2022789/1‑128 AGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑A > 2:892871/1‑128 AGTAAAGATCAATGATTTATATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATATGTTAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑A < 2:778814/128‑1 AAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAATTCAATTCATCTTTGATATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATGTTAGTT‑AC‑TATAA‑AAAttaataat > 1:4065665/1‑120 TCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAA > 1:7408243/1‑128 TCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAAT > 1:713623/1‑128 ACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTATTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATt > 1:6163053/1‑127 TGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑ATT‑TGTAATA‑TTT > 1:6603517/1‑128 GATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTA < 1:3821356/128‑1 TATAAAAAACATCTATATATACAAATTTTTAGAAGAAATCAATTCCTCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAA < 2:2232334/128‑1 TAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑ATT‑TTTAATA‑TTTTTATTTAAAAAATATATATTTATAT > 1:1588526/1‑128 AGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAAATGAAATTCTAATAATTGGTAAAATAATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑ATA‑TTAAATA‑TTTTACTTTTAAAAATAAAACTTTATATAA > 1:2430628/1‑128 aAAATTTTTATAATAAATCAATTCATCTGTGAAATTTAAATTATAATAATTGGTAAAATTATATTTTAGTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATG < 1:8086072/127‑1 TTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TTTAATA‑TTTTTATTTAAAAAATTTATCTTTATAAAATttaaattt > 2:7360649/1‑120 TTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑AAT‑TGTAAAA‑TTTTTATTATAAAATTTAATAATTATATAtattatattta > 1:8674983/1‑117 TTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑‑AAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TTTAATA‑TTTTTATTTAAAAAATTTATGTTTATATAATTTTATTTGAA > 1:4762102/1‑128 TAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑ATT‑TGTAATA‑TTTTTATTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTTGA > 1:799934/1‑128 AAGTAATCAATTAATCTGTGAAATTTTAATTCTAATATTTTGTAATATTTTATGTTATTT‑CA‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTT < 1:5994816/128‑1 AGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑ATT‑TGTAATA‑TTTTTATTAAAAAAATTTATATTTATATAATTTTATTATAATTTA > 2:4091593/1‑128 tAAATCAATTAATCTGTTAAATTTAAATTCTAATATTTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTA < 1:6299559/127‑1 GAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑ATT‑TGTAATA‑TTTTTATTTAAAAAATTTAAATTTATTAAATTTTATTTTAATTTA > 2:9371578/1‑128 GAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TTTAATA‑TTTTTATTTAAAAAATTAATATTTATATAATTTTATTTTAATTTA > 2:8020008/1‑128 GAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAA < 2:713623/128‑1 AATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGAAATA‑TTTTTATTAAAAAAATTTAAATTTATATAATTTAATTTGAATTTAAA > 2:3583487/1‑128 AATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑AATATTTTATATTTTTTATTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTTTTTAAATTTAA > 1:5438460/1‑128 TGTGAAATTGAAATTCTAATAAATTGTAAAATTATATGTTAGTTACA‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGG < 2:481649/128‑1 GTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑ATT‑TGTAATA‑TTTTTATTTAAAAAATTTATATTAATATAATTTAATTTAAATTTAAAGTGTAATTTGttt > 1:2305753/1‑125 tAAATTTAAATTCTAAAAATTGTTAAAATTTATTGTATGTT‑CA‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGT < 2:794732/127‑1 TTGAAATTCAAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACA < 2:7488405/128‑1 tAATTCTAATAATTTTTAAAATTATATGTTTGTT‑CC‑AAAAA‑TAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTAATTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGGTGTACAGTTA < 2:6212986/127‑1 aTAATAATTTGTATAATTATAATTTAGTT‑AC‑AAAAA‑AAAAAA‑ATAGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAATATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTAT < 2:1479739/127‑1 ATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATT‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGATTTTGGGTTGTACAGTTATTTTTATTTT > 2:9156377/1‑128 tGTAAAATTATTTGTTAGTTACA‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTATAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTA < 1:9567438/127‑1 TATTTTATTT‑AC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCT < 2:1581661/128‑1 ATGTTAGTT‑AC‑AAAAATAAAAAACA‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCC < 1:4547577/128‑1 tAAAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTA < 1:9416090/127‑1 ataattAAAAAA‑T‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAATATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAATGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCGTTAAGTTGACTA < 2:3286525/122‑1 tAAA‑AAAAAA‑A‑ATT‑TGTAATT‑TTTTTATTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGATTTTAAAGGTGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTTTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 2:6851533/127‑1 AAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAATAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:7567493/128‑1 AAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 2:3825385/128‑1 AAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 2:655208/128‑1 AAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 2:6098193/128‑1 AAAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTATTTAAAAAATTTATATTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:4226238/128‑1 AAA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 1:854948/128‑1 tA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAATAATTTATATTTATATTATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTAAAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:4998275/127‑1 AA‑AAATAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:5723716/128‑1 AA‑AAAAAA‑T‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:6469081/128‑1 AA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATTTAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGATTTTGGGTTGAACAGTTATTATTAATTTGTATTTTACATCATTAAGTTCAATAATAT > 1:8800980/1‑128 AA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:9540771/128‑1 AA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:8694755/128‑1 AA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:6676038/128‑1 AA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:1495995/128‑1 AA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:2655067/128‑1 AA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:3006897/128‑1 AA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:4374791/128‑1 AA‑AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:4474417/128‑1 aatAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATTTTTATATAATGTTATTTGAATTTATAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:5461541/125‑1 tatAAAT‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTATCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTTAATTTAAAGTGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATA < 1:8942558/125‑1 AAAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATAT < 1:8221168/128‑1 aagAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 1:3580350/125‑1 AAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTTGAATTTAAAGGGAAATTTGGGTTTTAAATTTATTATTAATTTTTTTTATAAATCATTATGTTAAATAATATAaa > 1:2902332/1‑126 AAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 2:3435485/128‑1 AAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 1:3125891/128‑1 AAAAA‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 1:5330570/128‑1 AAAT‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAATATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTTGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATAT < 1:6898970/128‑1 AAAA‑A‑AGT‑TGTAAGA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATAT < 1:5527043/128‑1 A‑A‑AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAA < 1:3485324/128‑1 A‑A‑AGT‑TGTAATA‑TATTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAA < 2:4960494/128‑1 aatAGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAA < 2:6368079/125‑1 AGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 1:1010154/128‑1 AGT‑TGAAATA‑TTTTTATTTAAAAAATTTATATTTTTAAAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTTTACAGTTATTTTTAATTTGTATTATACATCATAAAGTTCACTAATATATATAAATT > 2:2376079/1‑128 AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AAAAA‑AAAAAA‑A‑A‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaa‑aaaaaa‑a‑aGT‑TGTAATA‑TTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < CP016816/76892‑76766 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |