| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 76896 = | 4388 (0.990) | 281 (0.070) | 124/226 | 14.7 | 6.9% | intergenic (‑145/+40) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein |
| ? | CP016816 | = 76892 | 3643 (0.910) | intergenic (‑141/+44) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 4679 total aligned reads displayed.
TTATATATATTAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTGATCTTTACT > CP016816/76769‑77023 | tatatTAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑ttttttttt > 1:5681975/1‑128 (MQ=255) atatTTTTGAAATTAATGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTACCATTTAAATTAAAAAAAAATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑TAAAAATATT‑AA‑AAA‑tttttttttt < 2:2315331/128‑1 (MQ=255) ttAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑ttttttttttttt > 1:5182052/1‑128 (MQ=255) tGAACTTAAGGAAGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATAAT‑AC‑AAC‑tttttttttttattata > 1:6813013/1‑125 (MQ=255) atAATGATTTATAAAAAAAAATAATAATAAATGTACAACCCAAATTCCCCATTAAATTGAAATAACAATATTTAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAAAAAT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACt < 1:6329472/127‑1 (MQ=255) aaGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑attatttttttttttttttaaata > 1:9202757/1‑120 (MQ=255) aaGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGAAAAAATATTTAAA‑GAAAAAAATT‑AC‑AAC‑ttatattttttttataaaaaataa > 2:5471973/1‑117 (MQ=255) ggATGTATAAAACAAATTAAAAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAAAAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑TAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACat < 1:3095564/128‑1 (MQ=255) gATTTATAATACAAATTAAAAATAAATGTACAAACCAAATTACACTTTAAATTCAAATAAAATTATATAAATATAAATTTTTTAAA‑TAAAAATATT‑AA‑AAC‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACatat < 1:4216275/128‑1 (MQ=255) gTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATAA‑ATATaa > 2:886691/1‑128 (MQ=255) gTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAAATAACAtata > 1:5364648/1‑128 (MQ=255) tataATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATAAAAAATaa > 1:5495065/1‑128 (MQ=255) taCAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAAGTCCCCTTTATATTCAAATAACATTTTATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AACATTTTTTTTATTTTTATGTCACAAACATATAAttaa > 2:7465883/1‑126 (MQ=255) aaCAAAATAAAAAAAAATGTACAAACCAAAATACCCTTTAAATTAAAAAAAAATTATATAAATATAAATTTTTTAAA‑TCAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTa < 1:8722003/127‑1 (MQ=255) cAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTATTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTT‑GAAAAAAAATATAATTTTACCa > 1:9386304/1‑128 (MQ=255) aaataaaaataaCTGTACAAACCAAAATCCCCTTTAAAATAAAATAAAATAATATAAATATAAATTTTTTAAA‑TAAAAAAATT‑AA‑AACTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCa < 2:4973957/125‑1 (MQ=255) aaTTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATAAAATTAAATTTTACCaa > 1:8383652/1‑128 (MQ=255) aaTTAATAATAAATTTAAAAAACAAATTACAAATTAAATTAAAATAAAATTTTATAAATATAAATTTTTTAAA‑TAAAAATATTAAA‑AAT‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCa < 2:4618429/128‑1 (MQ=255) aaTTAAAAATAACTTTAAAACACAAATTAACATTTAAAATAAAATAAAATTATAAAAATATAAATTTTTTAAA‑TAAAAATTTT‑AA‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCaa < 1:1961529/128‑1 (MQ=255) aTTAATAATTACTTTTATAACCAAATTCACCTTTAAATTTAAATAAAATTATTTAAATATAAATTTTTTAAA‑TAAAAATTTT‑A‑‑AAA‑ATTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAatt < 2:6912786/128‑1 (MQ=255) tataataaATTTAAAACAAAAATTTCACTTTAAAATCAAATTATATTATATAAATAAAAATTTTTTAAA‑TAAAAAAATT‑AC‑AA‑‑‑ATTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAAttatta < 1:4360893/127‑1 (MQ=255) taataaATGTAAAAACCAAATTCCACTTTAAATTAAAATAAAATTATATAAATATAAATTTTTTAAA‑TAAAAATATT‑AA‑AAA‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAAttatta < 2:3256362/128‑1 (MQ=255) aaataatTTTAAAACCAAAATTACCATTTTAATTTAAATAAAATTATTTTAATTTAAATTTTTTAAA‑TAAAAATATT‑TA‑AAA‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAAttatta < 2:4818849/127‑1 (MQ=255) aaaaaatttACAAAACAAATTATCCTTTTAAATAAAATAAAATTATATAAATATTAATTTTTTAAATTAAAATTTTT‑AA‑AAT‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAAttatta < 2:6036102/120‑1 (MQ=255) taaCTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTT‑TAAATAAAATATAATTATACCAAATATTAAaat > 1:6174142/1‑128 (MQ=255) taaCTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGTAAATAAAATATAATTTTACAAATTATTaaaaa > 1:1479272/1‑127 (MQ=255) aCTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AACTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAACTAACATATAAATTTACAAATTATTATaat > 1:2862065/1‑128 (MQ=255) tGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAAATAAAATTTAATTTTACCAATTATTAGaattta > 2:3100384/1‑127 (MQ=255) taaaaCCCAAATTCACCTTTAAATTAAAAAAAAAATATATAAATATAAATTTTTTAAA‑TAAAAATTTT‑AA‑AAA‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGaatttcaa < 2:8669419/125‑1 (MQ=255) aaaaaattaacatttAAATTAAAATTAAATTATTTAAATTTAAATTTTTTAAA‑TAAAAATATT‑TCAAAT‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGaatttcaatttc < 2:1412239/116‑1 (MQ=255) ccAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACAAACATATATATTTACCAATTATTATaatttcaatttacca > 2:3806273/1‑124 (MQ=255) aaattacaatttAAATTCAAATTAAATTATATAAATATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGa < 1:1780347/119‑1 (MQ=255) aaaTTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTT‑AAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTAACAGa > 2:5646201/1‑128 (MQ=255) aaaTTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATg < 1:819553/128‑1 (MQ=255) attaaaatttAAATTAAAATAAAATTATATAAATATAAATTTTTTAAA‑TAAAAATAAT‑AC‑AAA‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGAt < 1:3269526/121‑1 (MQ=255) aTTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGTAAGAAAAATATAATTTTACCAATTTTTTGaattaaaatttaaaagttg > 2:5157451/1‑120 (MQ=255) aTTACCATTTAAATTATAATATCATTATATAAATATAAATTTTTTAAA‑TTAAAATATT‑TA‑AAA‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGAt < 2:1038776/128‑1 (MQ=255) cccTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACAAATTATTATAATTTAAATTTCACATATTAAtt > 1:1159676/1‑128 (MQ=255) cccTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGa > 2:9021558/1‑128 (MQ=255) ccTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTT‑‑GAACTAACATATAATTTTACCAATTATTATAATTTCAATTTAACatatatatcgg > 1:261979/1‑121 (MQ=255) cattAAATTCAAAAAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AA‑‑ATTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTTTTAATATTTAAATTTAACATATTaaatta > 2:9553984/3‑124 (MQ=255) ttaaattaaaATAAAATTATATAATTATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAA‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGAt < 2:8552028/128‑1 (MQ=255) ttaaattaaaAAAAAATTTTTAAAATATAAATTTTTTAAA‑TAAAAA‑ATT‑TA‑AAA‑ATTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGGATTTCAATTTCACAGATGAATTGAtt < 2:6675302/128‑1 (MQ=255) ttAAATACAAATTAATTTTTATAAAGATAAATTTTATAAA‑GAAAAATATT‑AA‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGAt < 1:9048172/128‑1 (MQ=255) tAAATTAAAATTAAAATATTTAAATAAAAATTTTTTAAA‑AAAAAATATT‑AA‑AAA‑TTTTTTTTTTTTTTTTGTAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGAtt < 2:6169232/128‑1 (MQ=255) aaaTTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAAATAAAATATAATTTTACAAATTTTTATATTTTCAATTTAAAAGATGAatttattt > 2:8251191/1‑128 (MQ=255) aaaTTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAAAATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTAAATTTAACATATGAatttattta > 1:7869424/1‑127 (MQ=255) aaTTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTT‑‑GAACTAACATATAAATTTACCAATTATTATAATTTAAATTTAAAATATTAATTtatttatt > 1:8527293/1‑128 (MQ=255) aTTTAAATAAAATTATATTAATATATATTTTTTTAA‑TAAAAATATT‑AA‑AAA‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATttct < 2:2690617/128‑1 (MQ=255) aTTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGTAAATAACATATAATTTTACCAATTATTATAATTTAAATTTCAAATATTAATTTAttaat > 1:4499301/1‑125 (MQ=255) aTTAAAATAAAATTATATAAATATAAATTTTTTAAA‑TAAAAATATT‑AA‑AAA‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATttct < 1:1310653/128‑1 (MQ=255) taaaaTAACATTATATAAACATAAAATTTTTAAA‑TAAAAATATT‑AC‑AAA‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATttcttc < 1:4038558/126‑1 (MQ=255) aaaaTAAAATTAAATAAATATAAATTTTTTAAA‑TAAAAATATT‑A‑‑AA‑‑TCTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCtaa < 2:2911434/127‑1 (MQ=255) aattaaaTTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑TTAAAATATT‑AA‑CAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCtaa < 2:9199614/122‑1 (MQ=255) aTAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAAATAACATATAATTTTACAAATTATTATAATTTAAATTTCACAGATTAATTGATTTATTataata > 1:6986455/1‑128 (MQ=255) aaCATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AACTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAAAAAAAATAAAATTTTACAAATTTTAAGAATTTAAATTTCAAAAATTAATTGAttaattataaaa > 2:7806656/1‑118 (MQ=255) aCATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGGAAAAAACATATATTTTAACAAATTATTATATTTACAATTTCCAATATAAATTGATTTATTATAATAttt > 1:5003643/1‑128 (MQ=255) cATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AACTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAAAAAAAAAAAATATTACAAATTATAAAAAATACAATTTAACAGATAAATTAATTAATTGAaataat > 2:940153/1‑128 (MQ=255) aTTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAAATAAAATATAATTTTACCAATTATTATAATTTAAAATTAAAAAATTAATTGATTTATTATAATAAtttt > 1:2306273/1‑127 (MQ=255) aTTATAAAAAATAAAATTTTTTAAA‑TAAAAAATAT‑AC‑AA‑‑‑ATTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGt < 2:5821961/128‑1 (MQ=255) ttATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATAAAATATAATTTTACAAATTATTATAATTTAAATTTAAAAGATGAATTGATTTATTCTAATAAttt > 1:4692105/1‑128 (MQ=255) tttataAATTTAAATTTTTTAAA‑TAAAAATATT‑AA‑AAA‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGt < 1:3480466/126‑1 (MQ=255) taaataaatataaatTTTTTAAA‑TAAAAATATT‑AA‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGt < 2:3407358/125‑1 (MQ=255) tttttatttttaaTTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑A‑‑AAA‑ATTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCt < 2:8384029/117‑1 (MQ=255) atataaatataaATTTTTTAAA‑TAAAATTATT‑A‑‑AAA‑ATTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCt < 1:3643263/128‑1 (MQ=255) atataAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAAAATATAATTTTACAAATTATTATATTTTAATTTTCAAAAATGAATTTATTAATTAAAATAAttttta > 1:7275719/1‑125 (MQ=255) ttttaatattaaTTTTTTAAA‑TTAAAATATT‑TA‑TAA‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCtat < 2:1779621/118‑1 (MQ=255) aaaGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAg < 1:6595213/128‑1 (MQ=255) ataTAAATTTTTTAAA‑TAAAAATATT‑AA‑AAA‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCtatata < 1:6047962/126‑1 (MQ=255) atttaTTTTTTAAA‑TATAAATTTT‑AA‑AAA‑ATTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAACATATAATTTTACAAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATTAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGa < 2:7128032/124‑1 (MQ=255) aTAAATTTTTTAAA‑TAAAAATATT‑AA‑AA‑‑‑ATTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATg < 2:1599376/128‑1 (MQ=255) tAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGTAAATAAAATAAAATTTTACCAATTATTATAATTTAAATTAAACATATGAATTGATTTATTAAAAAAAtttttataattatat > 2:6322951/1‑116 (MQ=255) atatttttttAAA‑AAAAAATTTA‑AC‑AAA‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGAt < 1:4846196/124‑1 (MQ=255) aaaaTTTTTTAA‑TAAAAATTTT‑AA‑AA‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTAACAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGtt < 2:6469081/128‑1 (MQ=255) ttttttAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AACTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAAATAACATATAATTTTACCAATTATTTGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTTTATATATAGATGtt > 1:5851139/1‑128 (MQ=255) ttttttAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGTAAATAAAATATAATTTTAAAAATTATTATAATTTCAATTTAAAATATGAATTTATTTATTCTAATAATTTTTATATATAGAtttttt > 1:7707991/1‑128 (MQ=255) tttAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TCTTTTTTTTTTTTTTTGAAATAAAATATAATTTTAAAAATTATTATAATTTAAATTAAACATATTAATTTATTTATTATAATAATTTTTATATATATAtttttttt > 2:192189/1‑128 (MQ=255) tttAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTATTATAATAATTTTTATATATATATGTTTTTta > 2:7960968/1‑128 (MQ=255) tAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTATAATTTCAATTTAAAAGATTAATTTATTTATTATAATAATTTTTCTATATAGATGtttttttt > 1:3838739/1‑126 (MQ=255) tAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAAAAAACATAAAATTTAACCAAATTTTAAAATTTAAATTTAACATATTAATTTATTTATTCATAAAATTTTTCTAATAAAATTTTTTTtat > 2:3596308/1‑128 (MQ=255) tttattaaaaTTTT‑AA‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTtat < 1:9553283/122‑1 (MQ=255) aaaaaTATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTAAATTTCACATATTAATTTATTTATTATAATAATTTGTCTATATAGATGtttttttaatataa > 2:7642481/1‑120 (MQ=255) aaaaTATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTTGAACTAACATAAAATTTTACAAATTATTAAAATTTAAATTAAAAAAATTAATTGATTTCTTAAAATAATTTTTATAAATATATATTTTTTATATATaa > 2:409412/1‑128 (MQ=255) aaaaTATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGTAACTAACATATAATTTTACAAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATTAATTGATTTATTATAATAATTTGTATATATATATTTTTTTTATATCaaaa > 2:4449396/1‑128 (MQ=255) aaaTATT‑AC‑AAC‑‑TTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTATAATTTAAATTTAACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTTTGTTTATAGATGtttttattattaaaat > 2:8093053/1‑117 (MQ=255) aaTATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAAt < 2:1209216/128‑1 (MQ=255) attaataattttttttttttttttttGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATc < 1:7149544/118‑1 (MQ=255) atattaaatattttttttttttttGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAg < 2:5302164/118‑1 (MQ=255) ataaaaatttttttttttttttttGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAg < 1:1005503/120‑1 (MQ=255) tttatatttttttttttttttttGGTACTATAATATAATTTTACCAATTATTAGATTTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGt < 1:6443635/121‑1 (MQ=255) tttatattttttttttttttttGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTg < 2:213756/122‑1 (MQ=255) taataattttttttttttttttTGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTg < 1:1597010/122‑1 (MQ=255) aaaaC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTGa < 1:2134844/126‑1 (MQ=255) aaaatttttttttttttttttGGAAATAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTGa < 2:7280425/123‑1 (MQ=255) aacttttttttttttgttGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTATAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTATATATAGATGTTTTTTATATATAAATCAGTGAtat > 1:8889036/4‑126 (MQ=255) tttttttttttttttttGGAACTAACATATAATTTTAACAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTGATctt < 2:4289047/127‑1 (MQ=255) ttttttttttttttttGGAAAAAACATAAAATTTTACCAATTATTATAATTTAAATTAAAAATATTAATTTATTTATTATAATAATTTTTATATATTTTTTTTTTTTTTATATAAATAATTGATattt > 2:2521750/1‑128 (MQ=255) tttttttttttttttGGAAAAAAAATAAAAATTTAACAAATATTAAAATTTAAATTTAAAAGTTTTATTGAATTATTTAAATAATTTTTCTAAATATATTTTTTTTATATAAAAATCAGTGAGcttaa > 1:8038945/1‑126 (MQ=255) ttttttttttttttTGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTACAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATTTAAATGTTTTTTATATGTAAATATGTGATctttac > 1:2450521/1‑128 (MQ=255) ctttttttttttttGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTGATctttac > 1:7522073/2‑128 (MQ=255) | TTATATATATTAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGATAAATTTTTTAAA‑GAAAAATATT‑AC‑AAC‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTGATCTTTACT > CP016816/76769‑77023 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |