| New junction evidence | |||||||||||
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gatagAATTAGTAAGAAAAAAAAAATATTTTTTTTTTAGTTATTTTTTTTATATCCAAAATTTAAAAAAATTAATTTTAACTTGTAAAAAATACC‑‑‑‑TTTTTTTTTTTTTTT‑A‑TAATGGAAATATAAAtt < 2:1649262/124‑1 (MQ=255) cttgtgtgaattagtaagaaactaaaactattatctttttagatattttttgtatatgcaaatttttaaaaaattaatttgaacttgtaaaaaatagcTTTTTTTTTTTTTTTTA‑TAATTTAAAtata < 1:1536307‑M1/30‑1 (MQ=255) cttgtatgaattagtaagaaactaaaactattatctttttagatattttttgtatatgcaaatttttaaaaaattaatttgaacttgtaaaaaatagcTTTTTTTTTTTTTTT‑T‑TAATGTAAATATaa < 1:1195162‑M1/30‑1 (MQ=255) cttgtatgaattagtaagaaactaaaactattatctttttagatattttttgtatatgcaaatttataaaaaattaatttgaacttgtaaaaaatagcTTTTTTTTTtttttt‑t‑taattcaaattaaa < 1:1148748‑M1/30‑11 (MQ=255) tatgaattagtaagaaactaaaactattatctttttagatattttttgtatatgcaaatttttaaaaaattaatttgaacttgtaaaaaatagcTTTTTTTTTTTTTTT‑A‑TAATGTAAATAAAAAttt < 2:1239512‑M1/34‑1 (MQ=255) ttagtaagaaactaaaactattatctttttagatattttttgtatatgcaaatttttaaaaaattaatttgaacttgtaaaaaatagcTTTTTTTTTTTTTTT‑A‑AATTGAAAATAAAAATTttagtat < 1:1098006‑M1/40‑4 (MQ=255) 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ATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAAAACTATTATCTTTTTAGATATTTTTTGTATATGCAAATTTTAAAAGAATTAATTTGAACTTGTAAAAAATAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT‑A‑TAATGGAAATATAAATTTTAGGTATTTTGTTGTCT‑AAGTATCTAAAAAAATAGAAAGGAAAAAATATTGTTAAAAGTAATACTAAAATTATTTAATGTTAATTAAAACTTAA > CP016816/165128‑165381 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |