| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 76896 = | 2169 (0.850) | 362 (0.160) | 134/226 | 12.4 | 16.4% | intergenic (‑145/+40) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein |
| ? | CP016816 | = 76892 | 1753 (0.760) | intergenic (‑141/+44) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 757 total aligned reads displayed.
AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aa‑aaaaa‑a‑aa‑aaaGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATTT < CP016816/76892‑76765 AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A > 2:4937543/1‑128AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A > 1:1968716/1‑128 GTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTCGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA > 2:2396024/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTTAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AA < 2:416816/128‑1 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGAGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTAAATGTTAGAT‑CC‑AA‑AAA > 1:583964/1‑128 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTAATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAA > 2:1842846/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAA > 1:4865284/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑AC‑AA‑AAAA > 2:1753503/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGAAAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTTCTAAAATTATATGTAAGTT‑CA‑AA‑AAAA > 1:933105/1‑128 TATTAAATTAAATATAACTTATTTATATAAAAAAAACATATATAAAGAAAAATTATTAGAATAAATCAATTCATATGTGAAATTTAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA < 1:2878941/128‑1 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA > 1:3619850/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA > 1:5070753/1‑128 ATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CA‑AA‑AAAAA‑A > 1:5004378/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA > 2:468802/1‑128 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑A > 1:4767443/1‑128 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑A > 1:4325406/1‑128 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGATAAAATAATATGTAAGTT‑CA‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑A > 2:3151936/1‑128 AAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTTAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATTTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AA > 2:2290411/1‑128 AAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTATTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AA > 2:3726232/1‑128 AAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AA > 1:3844502/1‑128 AAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAAATATTAGAATAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAAATATATTTTATTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AA > 2:3554833/1‑128 AAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTT > 2:3935803/1‑128 ACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAATTTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑‑A‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATT > 2:76196/1‑128 ACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAGTTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑AC‑‑A‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTTT‑AATATT > 1:4049540/1‑128 CTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTATAAGAAATCAATTAATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑AC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAtaatttttatt > 1:4140446/1‑117 GATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AATAAAGATCT‑AATATTT > 2:4843653/1‑128 TTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTATTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTT > 2:2972790/1‑128 TTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTATT‑AATATTTTT > 1:2177062/1‑128 TTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAATTTGT‑AATATTTTTa > 1:4274091/1‑127 TAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTTT‑ATAATTTTTATT > 2:4013703/1‑128 ttTATAAAAAACATCTTTATAGAAAAATTATTAGAAGAAATTAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTA < 2:5227713/126‑1 ATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAATTTTT‑AATATTTTTATTTA > 2:2521341/1‑128 TATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAATTTTT‑AATTTTTTTTTTTTAA > 2:4789099/1‑128 AAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAATTTTT‑ATTATTTTACTTAAAAAAAat > 2:5290629/1‑126 AACATATAAATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTTAAATTGAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTT < 2:863793/128‑1 TCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATATGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATTTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTT < 1:998434/128‑1 ttatttataaAAATTATTATAATAAATCAATTCATATTTTAAATTTAAATTATAATAATTTGTAAAATTATATTTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTT < 1:824439/118‑1 TATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTTT‑AATATTTTTATTTAAAAAATTTATCTTT > 2:4458558/1‑128 ATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAATATTT‑AAAATTTTTATTATAAAAATTTATataata > 2:1459222/1‑122 TATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAATTAGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATA > 1:4396679/1‑128 ATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTTT‑ATTATTTTTATTTAAAAAATTTATATTTATA > 2:5368532/1‑128 TAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATAT > 1:5273219/1‑128 ACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAATTTTT‑AATTTTTTTAATTAAAAAATTTATATTTTTATTAT > 2:1289864/1‑128 AAATTATTAGAATAAATCAATTCATATTTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATTTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTT < 1:1760442/128‑1 AATTATTATAATTAATCAATTCATCTGTTAAATTGAAATTTTAATAATTTGTAAAATTATATGTTATTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTT < 2:106910/128‑1 tattacgatatAATCAATTAATCTGTTAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATTTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTAT < 1:632869/117‑1 TTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑ATTATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTAATATTATGTTTTTTG > 1:1391095/1‑128 GAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTGTT‑AATATTTTTATTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTTTTTGAATTTA > 2:5107889/1‑128 GAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTATATATAATGTTATTTGAATTTAA > 2:3642833/1‑128 tatAATTCATATTTTAAATTTAAATTATAATAATTTTTAAAATTATATTTTAGTT‑TC‑‑A‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGG < 2:2610978/125‑1 ATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTATTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAG < 1:5153456/128‑1 TCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAATTTAT‑AATATTTTTATTTAAAAAATTTAAATTTATATAATTTTATTTTAATTTAAAtt > 2:1179957/1‑126 TCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAATTTTAAATATTTTTATTTAAAAAATTTATATTTATTAAATTTTATTTTAATTTAAAtg > 2:207715/1‑126 atattatTCTGTTAAATTTAAATTTTAATAATTGGTAAAATTATATGTTATTTACA‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGG < 1:3458452/121‑1 ATTCATATGTGTAATTGAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTATTTACA‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGA < 2:3295252/128‑1 ATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGA‑ATTATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTTAATTTAAAGGGGAATTT > 1:5460600/1‑128 ATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑A < 1:2528076/52‑1 TCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGG < 2:5178055/128‑1 AATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATT < 1:2073862/128‑1 TTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTG > 1:760913/1‑128 TAAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTTGGTTTTACATTTTTTATTAATTTGTATT > 2:343925/1‑128 AAATTATATTTTTTTT‑CC‑AATAAAAA‑ATAA‑TAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTA < 1:4904707/128‑1 AATTATATTTTAGTTACA‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATA < 2:2701656/128‑1 AATTATATGTTATTTACA‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATA < 1:1242734/128‑1 AATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATA < 2:4344063/128‑1 ttttttttttatAA‑ATAAT‑A‑AA‑TAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCT < 1:3695284/116‑1 TGTTTGTT‑CC‑AA‑AAAAATA‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTATTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTT < 2:1536252/128‑1 tttttcataAA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAA < 1:3566819/119‑1 tatTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGT < 2:4563832/125‑1 aaacAAAA‑A‑AA‑ACATTTGA‑ATTATTTTTCTTTAAAACATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTA < 2:2153272/124‑1 AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAA < 2:4612487/128‑1 AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAA < 1:2572408/128‑1 A‑AAAAA‑A‑AA‑TAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGTGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:3311678/128‑1 A‑AAAAA‑A‑AA‑AAATTTTT‑AATTTTTTTTTTTTATAAATTTAAATTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:1698407/128‑1 A‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 2:5482988/128‑1 A‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:4610876/128‑1 A‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:305431/128‑1 A‑AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:103206/128‑1 atAAA‑C‑AA‑AAAGATGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTTAATTTAAAGGTGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTTTTATAAATCCATAAGTTCACTAATA < 2:5546418/126‑1 atAAA‑A‑AA‑AAATTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 1:2412855/126‑1 AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 1:267247/128‑1 AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 2:4522378/128‑1 AAAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 1:2778598/128‑1 AAAA‑A‑AT‑ATAGTTGA‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:5221834/128‑1 AAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:467847/128‑1 AAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:677648/128‑1 AAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:4529630/128‑1 AAAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATA < 2:193659/107‑1 AAA‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATA > 1:1503643/1‑128 A‑A‑AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATAATATGTTATTTGAATTTAAATGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 2:2551904/128‑1 AA‑AAATTTGT‑AATATTTTTCTTTAAATAATTTATATTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGTGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATA < 1:2316807/128‑1 AA‑AAAGTTTT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATA < 2:2782483/128‑1 AA‑AAAGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATA < 2:4748015/128‑1 AAAGTTGT‑AATTTTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTTTAATTTAAAGGGGATTTTGGTTTGTAAAGTTATTTTTAATTTTTATTATAAATCATTAATTTCACTAATATTTATAAA > 1:1122695/1‑128 AGTTTT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGTGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 1:22560/128‑1 AGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGTTGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 2:1621713/128‑1 AGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGTGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 1:3166544/128‑1 AGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGATTTTGGGTTGTAAAGTTATTATTAATTTGTATTATAAATCATTAATTTCACTAATTTATATAAATT > 1:1586089/1‑128 AGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT > 1:1895989/1‑128 AGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 2:4286318/128‑1 AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA‑A‑AA‑AAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aa‑aaaaa‑a‑aa‑aaaGTTGT‑AATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATTT < CP016816/76892‑76765 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |