| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 34945 | 1126 (0.690) | 439 (0.240) +AAA |
87/214 | 21.9 | 26.2% | intergenic (+49/+117) | JCVSYN2_00105/JCVSYN2_00110 | ABC transporter permease/cell division protein FtsH |
| ? | CP016816 | 34946 = | 1250 (0.670) | intergenic (+50/+116) | JCVSYN2_00105/JCVSYN2_00110 | ABC transporter permease/cell division protein FtsH | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 578 total aligned reads displayed.
CTTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/34818‑34945‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCTT > CP016816/34946‑35072 |||| TTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTTTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑A > 2:898913/1‑128 TTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AA > 1:1002043/1‑128 TTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAATATTAAACCAAATACAATGTATATTTTTTTTTTATTT‑AATATTT‑AAAAAA > 2:1732057/1‑128 TCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAATTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGAGTATCGTTTTTTTATTT‑ACAATTT‑AAAAAAA > 2:2677614/1‑128 TCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAA > 1:3626680/1‑128 TTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAA > 1:3453215/1‑128 TTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTAGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTAGATTTTTTATAT‑ACTATTT‑AAAAAAAAAA > 1:735723/1‑128 TATGATTTTCAACAAAAAGAGTAATAAAAGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAATATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAA < 1:3536060/128‑1 ATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATGATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAA > 1:3182009/1‑128 ATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAA > 2:63612/1‑128 ATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATAGTTTATGTTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAA > 2:1076214/1‑128 GAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTTTTTGTTTTTTTAATTT‑AATATTA‑AAAAAAAAAAAAAA > 2:1915917/1‑128 GAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGAGTTAGTTTTTTTTATTT‑ACTATAT‑AAATAAAAAAAAAA > 1:2555029/1‑128 AGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGTTTTTTTTATTT‑TCTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAA > 1:1986555/1‑128 AGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTCATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTAATG‑AATAAAAAAAAAAAA > 1:3097856/1‑128 TTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTATGGATTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAA > 1:2866109/1‑128 CAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAtaat > 1:3963728/1‑124 CAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGAGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACAAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTT‑AAATAAAAAAAAAAAAAAaa > 2:1535185/1‑126 ACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAataa > 1:827071/1‑124 CAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGTTTTTTTTATTT‑ACTATTT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAaa > 2:1162003/1‑126 AAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATTCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAAACAAATACATTTTGTTTTTTTTTTTTATTT‑ACTATTA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAaaaa > 2:53483/1‑124 AAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAtaatttaat > 1:1364665/1‑119 AAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAAATtaattt > 2:3981852/1‑122 AAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAaaat > 2:2217723/1‑124 AAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACAAAATACAAAGTGTTTGTTTTTTTTATTT‑AATATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAt > 2:2752379/1‑127 GAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTG > 1:3315356/1‑128 GTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATTAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTaaa > 2:3643896/1‑125 GTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAAATAATAAAATTTtc > 1:430852/1‑126 GTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAatttgaat > 1:3938163/1‑120 GTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGATTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAAATAAaaatttgaat > 1:1732373/1‑118 GTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGATTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑‑AAAAGAAAAAAAAAAAATAAGATAATTTCCA > 1:3272491/1‑128 GTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACAATGTGTATCGTTTTTTTATAA‑ACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAATAATAATATTTaaa > 1:2205670/1‑125 GTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAAAAAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAaaatatgaat > 1:3131322/1‑118 TAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGAAT > 1:3027577/1‑128 TAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGAAT > 1:3502474/1‑128 AAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAatttaaataa > 1:155086/1‑118 AGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTA‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAatataaataaa > 2:38738/1‑117 GAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTTTGTTTGTTTTTTTTATTT‑ACTATTT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AATAAAATTTaaataat > 1:2360368/1‑121 GAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAATAAATATATTTTaaaaaa > 2:3019422/1‑122 GAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AAAATAATTTaaataaa > 2:1260745/1‑121 GAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGATTTTTTATTT‑ACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTTCAaaat > 2:3227054/1‑124 AAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGTTGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAA‑‑AATATAATTTaaataaaat > 2:824520/1‑119 AAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTAATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAATAATATATTATTaaaactaa > 1:2004287/1‑120 AATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAA‑‑AATATAATTTGAAAAATATA > 2:3494435/1‑128 ATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑‑AAAGAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTaaaaaataaa > 1:2929800/1‑118 ATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAATAATAAATTTTaaataaaaaa > 1:3698835/1‑118 ATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTATTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAA‑‑AATATAATTTGaaaaaaataa > 2:3347396/1‑118 TGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACAGTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAATAAAATATTTTcaaaaaatcaa > 2:3746862/1‑117 GCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGCTTAATATAAA > 1:3880708/1‑128 TACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAA‑‑AATATAATTATCAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTC > 2:2577596/1‑128 ACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTGAAAACTATAAAAAATTATTTT > 2:3287911/1‑128 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AAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAA‑‑AATATAATTTAAATAAAATAAAAAAATTTTTTTAAAATAAATATaaat > 2:2427669/1‑124 tttattAATAAAAAAATATTAAAAAAAATACATTTTGTTTGGTTTTTTTATTT‑AATATT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGA < 1:271463/122‑1 TTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑AAAAAAAAAAAAAAAAAA‑AATATAATTTTAATAATATAAAAAATTTTTTTTAAAAAAATTATaaaata > 2:245971/1‑122 aattTTAAAAAAAATAAATTGTTTTTGGTTTTTTTTTTT‑AAT‑TTT‑TAAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAA < 2:3452245/124‑1 aatATTAAAAAAAATAAATTTTTTTTGTTTTTTTTATTT‑A‑TATT‑‑TTAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAAC < 1:1819034/125‑1 tTTAAAAAAATTATATTTTGTTTGTTTTTTTTTTTT‑ATTATT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCA < 2:1630456/127‑1 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aattatatttttTTTTGTTTTTTTTTTT‑AATATT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTAT < 2:3114557/116‑1 AATAAATTTTTTTTTTTTTTTTTATTT‑AATATT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGATTTATA < 1:4665/128‑1 aaaaATTTTGTTTGTTTTTTTTATTT‑AATATT‑‑TAAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAA < 1:2137522/124‑1 aaattttTGTTTGTTTTTTTTATTT‑AATATT‑‑TTAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAA < 2:3571365/121‑1 aatTTGTTTTTTTTTTTTTTATTT‑AATATT‑‑TTAAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGATTTATAAct < 2:1440337/125‑3 ACAATGTATTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAATAATAAAATTTGCATACTAATAAAAATTTTTTTTCAAATAAGTATTAAGGATTAAATTTAAAAAACAAATAGTTATAAAT > 1:3411084/1‑128 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AAAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTAAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCTT < 2:2189062/128‑1 |||| CTTTACTTCTTTATGAGTTTCAACAAAAAGAGTAAGAAATGCTGAACCAAGTACAATGCTAAGTGAAGTTGATGAATAATAAAAGATTAAACCAAATACATTGTGTTTGGTTTTTTTATTT‑ACTATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/34818‑34945‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAATAATATAATTTGCATACTATAAAAAATTGTTTTTCAAATAAGTATTCAGGAGTAAATTTAAAAAACCAAGAGTTATAAATCTTGGTTTTTTGTTTATATTATTATTTGTCTT > CP016816/34946‑35072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |