| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,602,017 | (C)7→10 | coding (200/2019 nt) | hyfB → | hydrogenase 4, membrane subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2602010 | 4 (0.080) | 59 (1.100) +CCC |
32/200 | 0.4 | 93.6% | coding (193/2019 nt) | hyfB | hydrogenase 4, membrane subunit |
| ? | NC_000913 | 2602011 = | 4 (0.070) | coding (194/2019 nt) | hyfB | hydrogenase 4, membrane subunit | |||||
TGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTG‑‑CCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGG > NC_000913/2601873‑2602140 | tGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGc > 2:872759‑M1/1‑138 (MQ=255) gCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGccc > 2:253051‑M1/1‑136 (MQ=255) tCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccc < 1:709016‑M1/139‑7 (MQ=255) gTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGccccccccctt < 2:399658‑M1/139‑12 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccc > 2:653470‑M1/1‑107 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccc > 2:1146120‑M1/1‑107 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccc > 2:1105855‑M1/1‑107 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccc < 2:966745‑M1/139‑33 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccc < 1:1105855‑M1/139‑33 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccc > 1:966745‑M1/1‑107 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccc > 1:116976‑M1/1‑107 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGccccccccccttttgaatttgccgatttaacc > 2:809847‑M1/1‑107 (MQ=255) cTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccc > 2:447124‑M1/1‑106 (MQ=255) cTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccc < 1:447124‑M1/112‑7 (MQ=255) aTTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGccccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaa < 1:809847‑M1/139‑40 (MQ=255) tttCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagc < 2:781611‑M1/139‑47 (MQ=255) cGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctct < 1:1146120‑M1/139‑51 (MQ=255) tCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggca > 2:455088‑M1/1‑84 (MQ=255) gCTGGTGGGCGGCGTTATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatgg < 1:1020752‑M1/139‑63 (MQ=255) cTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccc > 1:764835‑M1/1‑76 (MQ=255) cTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccc < 2:764835‑M1/82‑7 (MQ=255) cTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGC‑CCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTg < 1:664642/139‑1 (MQ=255) gtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTcccccccccttttgaattttccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgct > 2:276276‑M1/1‑73 (MQ=255) gtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgct > 1:247616‑M1/1‑73 (MQ=255) cggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggtta > 1:179415‑M1/1‑68 (MQ=255) cggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgc > 2:1080245‑M1/1‑68 (MQ=255) cggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgc < 1:1080245‑M1/89‑22 (MQ=255) cggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaattt < 1:640949‑M1/87‑20 (MQ=255) cggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaattt > 2:640949‑M1/1‑68 (MQ=255) gaaTTGGCATCTCCGGCGAATTTACGCAATAAC‑TGGTGGTGGTACCTTTTTAGCCCGGTTTTCCCCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTcc < 1:872759/137‑1 (MQ=255) aGCGGTATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGGCC‑GGTTTGcccccccccttttgtatttcccgatttaaccctgcgaatggatcgcctctcggcatatatggtgctggttatctccttgctggtgggggt < 2:116976‑M1/139‑91 (MQ=255) cGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtgg > 2:434986‑M1/1‑47 (MQ=255) cGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtgg < 1:434986‑M1/136‑90 (MQ=255) cGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccc < 2:679206‑M1/53‑7 (MQ=255) cGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccc > 1:679206‑M1/1‑47 (MQ=255) cGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGccccc < 1:1173713‑M1/52‑6 (MQ=255) cGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGccccc > 2:1173713‑M1/1‑47 (MQ=255) ggAATTACGCAATTAAATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtggtttg < 1:455088‑M1/139‑94 (MQ=255) aTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtggtttgttc < 1:456267‑M1/139‑97 (MQ=255) aTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggc > 2:512539‑M1/1‑43 (MQ=255) aTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggc < 1:512539‑M1/97‑55 (MQ=255) ttACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtggtttgttct < 2:247616‑M1/139‑98 (MQ=255) tACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtggtttgttctctctattca < 1:749974‑M1/139‑107 (MQ=255) gCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtggtttgttctctctattcattgac < 1:653470‑M1/139‑112 (MQ=255) gCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaacc > 2:364652‑M1/1‑28 (MQ=255) gCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaacc < 1:364652‑M1/59‑32 (MQ=255) tGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtggtttgttctctctattcattgactt > 2:275327‑M1/1‑26 (MQ=255) tGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtg > 1:67061‑M1/1‑26 (MQ=255) tGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtg < 2:67061‑M1/111‑86 (MQ=255) tGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctc > 2:218428‑M1/1‑26 (MQ=255) tGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctc < 1:218428‑M1/77‑52 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtggtttgttctctctattcattgacttat > 2:1078301‑M1/1‑24 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtggtttgttctctctattcattgacttat > 1:1034602‑M1/1‑24 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggc > 2:431144‑M1/1‑24 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggc < 1:431144‑M1/78‑55 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcg < 2:1228335‑M1/60‑37 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcg > 1:1228335‑M1/1‑24 (MQ=255) aGTCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtggtttgttctctctattcattgacttatatgcgcgaat > 2:981988‑M1/1‑14 (MQ=255) aGTCGCCC‑GTTTTGCCCCCCCCCTTTTGAATTTGc < 2:508312/35‑1 (MQ=255) aGTCGCCC‑GTTTTGCCCCCCCCCTTTTGAATTTGc > 1:508312/1‑35 (MQ=255) tCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtggtttgttctctctattcattgacttatatgcgcgaatac < 1:981988‑M1/139‑128 (MQ=255) tCGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtggtttgttctctctattcattgacttatatgcgcgaatac < 1:253051‑M1/139‑128 (MQ=255) cGCCC‑GTTTTGcccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtggtttgttctctctattcattgacttatatgcgcgaatacg < 1:276276‑M1/139‑129 (MQ=255) c‑GTTTTGccccccccccttttgaatttgccgatttaaccctgcgaatggatagcctctcggcatttatggtgctggttatctccttgctggtggtggtttgttctctctattcattgacttatattcgcgaatacgagg > 2:640841‑M1/1‑7 (MQ=255) | TGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTG‑‑CCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGG > NC_000913/2601873‑2602140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |