| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1622778 | 4280 (78.350) | 22 (0.430) | 11/276 | 2.1 | 0.52% | intergenic (+37/+182) | yneM/dgcZ | inner membrane‑associated protein/diguanylate cyclase, zinc‑sensing |
| ? | NC_000913 | = 1622789 | 4498 (88.350) | intergenic (+48/+171) | yneM/dgcZ | inner membrane‑associated protein/diguanylate cyclase, zinc‑sensing | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 6357 total aligned reads displayed.
CATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCA > NC_000913/1622628‑1622929 | caTAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGT > 1:639853‑M1/1‑151 (MQ=255) tAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTa < 2:543522/151‑1 (MQ=255) aaaCGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTAc < 2:615675/151‑1 (MQ=255) cGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGt < 2:328452/151‑1 (MQ=255) cGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGt < 2:834109/151‑1 (MQ=255) cGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAATTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGt < 1:79439/151‑1 (MQ=255) aGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTtg < 1:677230/150‑1 (MQ=255) ggCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTtgtg > 2:106445/1‑151 (MQ=255) ggCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTtgtg > 1:696038/1‑151 (MQ=255) cAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTgtgt < 1:92292/150‑1 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATTTCCTTAATGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTATGGCCGCGTATTTCAACCACAAATGGTATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTac > 2:740200‑M2/1‑149 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGt < 2:158178/144‑1 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTac > 1:665088‑M2/1‑149 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTac > 2:511657‑M2/1‑149 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTac > 2:254590‑M2/1‑149 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTac > 2:270339‑M2/1‑149 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTa < 2:174442‑M2/150‑2 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTa < 1:114849‑M2/150‑2 (MQ=255) aataatGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTaca < 2:710691‑M2/151‑4 (MQ=255) taatGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTacaag > 1:749556‑M2/1‑146 (MQ=255) taatGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTacaag > 2:189052‑M2/1‑146 (MQ=255) aatGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGTCCCCTTGTTACAGTTGTGTacaagg > 1:810877‑M2/1‑145 (MQ=255) atGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTacaaggg < 1:494647‑M2/151‑8 (MQ=255) atGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTacaaggg > 1:860780‑M2/1‑144 (MQ=255) atGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTacaaggg > 1:587194‑M2/1‑144 (MQ=255) cTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTacaaggggcc > 2:676731‑M2/1‑141 (MQ=255) cTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTacaaggggcc > 2:240894‑M2/1‑141 (MQ=255) gggTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTacaaggggc < 1:244760‑M2/148‑10 (MQ=255) 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aaTGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGa < 2:498908/151‑1 (MQ=255) gCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCG‑aaaaaaa > 2:817787/1‑151 (MQ=255) gCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCG‑aaaaaaa > 1:28022/1‑151 (MQ=255) gTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCG‑AAAAAAAAc > 1:422153/1‑150 (MQ=255) taatTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTaaa > 2:484965/1‑150 (MQ=255) 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cccTTGTTACAGTTGTGAACAGGGGGCTTGTTTTTTATGACGGAA‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGacac < 2:208489/151‑1 (MQ=255) ccTTGTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcatt > 1:524548‑M1/1‑6 (MQ=255) cTTGTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcatta > 1:178376‑M1/1‑5 (MQ=255) cTTGTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcatta > 1:212221‑M1/1‑5 (MQ=255) cTTGTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcatta > 2:600690‑M1/1‑5 (MQ=255) 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tGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTa > 2:525924/1‑151 (MQ=255) tttACAGTTGTGTAAAGGGGGCCTTTTTTTTATGGCGGCA‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAg < 2:661317/150‑1 (MQ=255) gTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcattattt > 1:296061‑M1/1‑2 (MQ=255) gTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcattattt > 1:459656‑M1/1‑2 (MQ=255) gTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcattattt > 1:711592‑M1/1‑2 (MQ=255) gTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcattattt > 2:850369‑M1/1‑2 (MQ=255) gTacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattaccc < 2:553561‑M1/141‑140 (MQ=255) gTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGTGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAg > 2:313256/1‑151 (MQ=255) gTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAg > 1:330797/1‑151 (MQ=255) ttACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAg > 2:434813/1‑150 (MQ=255) tacacaactgtaacaaggggccggttaggtgagggattatctccgttcattagtcatcccatttgtggctgaaatacgcggccagaaaaccagaaaataaaattattcccagtacggccataaaaacattcatattacccagcattattt < 2:769975‑M1/150‑150 (MQ=255) | CATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCCTTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCCTGATTTTTATGACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCA > NC_000913/1622628‑1622929 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |