| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 1622778 | 4280 (78.350) | 22 (0.430) | 11/276 | 2.1 | 0.52% | intergenic (+37/+182) | yneM/dgcZ | inner membrane‑associated protein/diguanylate cyclase, zinc‑sensing |
| ? | NC_000913 | = 1622789 | 4498 (88.350) | intergenic (+48/+171) | yneM/dgcZ | inner membrane‑associated protein/diguanylate cyclase, zinc‑sensing | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 5548 total aligned reads displayed.
AGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTC > NC_000913/1622637‑1622938 | aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTac > 2:402057‑M2/1‑149 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTac > 1:597795‑M2/1‑149 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTac > 1:550055‑M2/1‑149 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTac > 1:517214‑M2/1‑149 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTac > 2:254590‑M2/1‑149 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTa < 2:225169‑M2/150‑2 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTa < 1:190769‑M2/150‑2 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTa < 2:559346‑M2/150‑2 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTa < 2:269203‑M2/150‑2 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTa < 1:343943‑M2/150‑2 (MQ=255) aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTCTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTac > 2:117613‑M2/1‑149 (MQ=255) taatGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTtcaag > 1:630681‑M2/1‑146 (MQ=255) taatGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTtcaag < 1:838977‑M2/151‑6 (MQ=255) taatGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTacaag < 1:70783‑M2/151‑6 (MQ=255) taatGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTacaag > 1:431400‑M2/1‑146 (MQ=255) aatGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTacaagg > 2:604148‑M2/1‑145 (MQ=255) atGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTacaaggg < 2:636235‑M2/151‑8 (MQ=255) gggTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTacaaggggc < 1:658874‑M2/148‑10 (MQ=255) 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aTCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCa > 2:711417/1‑148 (MQ=255) aTCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCa > 2:282045/1‑148 (MQ=255) tCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCAttt > 2:785800/1‑140 (MQ=255) cccTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGAt > 1:311026/1‑151 (MQ=255) ccccaacccGCCCCT‑TTTTTACGGTTGTGTACAGGGGGCT‑TTTTTTTTAT‑GAGGGAA‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACg < 1:469408/144‑1 (MQ=255) ccccTAACCGGCCCT‑TTGTTACAGTTGTGAACAGGGGGCT‑TTATTTTTAT‑GGCGGAA‑AAAAAAAGCCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACg < 1:100242/149‑1 (MQ=255) cACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACg > 1:328252/1‑151 (MQ=255) aCCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGa > 1:503531/1‑151 (MQ=255) ccaacccGCCCCT‑TTTTTACAGTTGTGTAAAGGGGGCT‑TGTTTTTTAG‑GCCGGAA‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGaa < 2:512983/146‑1 (MQ=255) caacccGGCCCC‑TTGTTAAAGTTGTGTAAAGGGGGCT‑TTTTTTTTAT‑GACGGAA‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAAt < 1:727620/147‑1 (MQ=255) aaCCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCg > 1:612820/1‑151 (MQ=255) ccttttttacgtttGTGAACAGGGGGCC‑TGTTTTTTAT‑GCGGGAA‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGacac < 2:651052/139‑1 (MQ=255) cctttGTTACAGTTGTGTAAAGGGGGCT‑TTTTTTTTAT‑GGCGGCA‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGacac < 2:769821/148‑1 (MQ=255) cc‑TTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGAcaca > 2:590705/1‑151 (MQ=255) cc‑TTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGAcaca > 2:433890/1‑151 (MQ=255) ttGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGAG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGt > 2:75555/1‑151 (MQ=255) gTTACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAg > 2:356158/1‑151 (MQ=255) ttACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGt > 1:115198/1‑148 (MQ=255) ttACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAg > 1:646009/1‑150 (MQ=255) ttACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAg > 1:275175/1‑150 (MQ=255) gTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAg > 1:142599/1‑151 (MQ=255) ttGTGTACAGGGGGCT‑TGTTTTTTAT‑GACGGC‑‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGt < 2:833173/150‑1 (MQ=255) gtgtACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTcc > 2:372261/1‑112 (MQ=255) gtgtACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGttt > 1:91384/1‑151 (MQ=255) gtACAGGGGGCT‑TGTTTTTTAT‑GAGGGAA‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATc < 2:131131/144‑1 (MQ=255) gtACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGtttt > 1:7723/1‑150 (MQ=255) | AGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAA‑ATGGG‑ATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTCACCTAACCGGCCCC‑TTGTTACAGTTGTGTACAAGGGGCC‑TGATTTTTAT‑GACGGCG‑AAAAAAAACCGCCAGTAAACCGGCGGTGAATGCTTGCATGGATAGATTTGTGTTTTGCTTTTACGCTAACAGGCATTTTCCTGCACTGATAACGAATCGTTGACACAGTAGCATCAGTTTTC > NC_000913/1622637‑1622938 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |