| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 2700550 = | 115 (1.230) | 14 (0.180) | 14/224 | 7.6 | 12.4% | noncoding (31/77 nt) | ohsC | sRNA antisense regulator of shoB toxin |
| ? | NC_000913_3_hsa_tpiA | 2700601 = | 100 (1.250) | intergenic (+5/+17) | ohsC/acpS | sRNA antisense regulator of shoB toxin/holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAGC > NC_000913_3_hsa_tpiA/2700452‑2700750 | tCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTaaa < 3:557012/150‑1 (MQ=255)tCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTaaa < 3:349002/150‑1 (MQ=255) gAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAaga > 2:1248249/1‑150 (MQ=255) tGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGtat > 4:594388/1‑150 (MQ=255) tAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑CCGGtattat > 2:756724/1‑150 (MQ=255) aaaGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTattatt > 4:675407/1‑150 (MQ=255) aGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGta < 2:793302/143‑1 (MQ=255) aaGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACttt > 1:835336/1‑150 (MQ=255) aaGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACttt < 2:542373/150‑1 (MQ=255) aaGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACttt > 2:819070/1‑150 (MQ=255) agttttttGGAAAAGATAAGTATTCGGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGTTGCACAAAATTAAAGTTATAAAGTAAATCCCGCGTTCCTTACCGTTTCTGGGTTTTTTCTTTTTAAAGATA‑ACTGTATTATTTTTAACTTTc < 2:541601/144‑1 (MQ=255) gTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCa < 3:785435/150‑1 (MQ=255) gCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCaata > 2:147110/1‑150 (MQ=255) gCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCaata > 4:255234/1‑150 (MQ=255) tGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAAtt > 4:267582/1‑150 (MQ=255) tAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTAc > 1:1288261/1‑150 (MQ=255) aaaGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCg < 3:480958/150‑1 (MQ=255) aaGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGt > 3:106617/1‑150 (MQ=255) aaGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGt < 3:546162/150‑1 (MQ=255) gATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGACACTGTGTT‑TGGTTATCTTTCAATAATTACCGTgg < 4:837451/150‑1 (MQ=255) gATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTgg < 1:273272/150‑1 (MQ=255) aTAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGc < 3:279263/150‑1 (MQ=255) gTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCg < 3:723317/142‑1 (MQ=255) gTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCg > 4:723317/1‑142 (MQ=255) gTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACaa > 2:796121/1‑150 (MQ=255) tACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAg > 1:64795/1‑150 (MQ=255) tGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAg > 1:433566/1‑150 (MQ=255) aTCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTg > 2:934514/1‑150 (MQ=255) aTCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTg > 1:93787/1‑150 (MQ=255) ccATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGcc > 3:57864/1‑150 (MQ=255) cATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCg < 1:1105265/150‑1 (MQ=255) aTAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGc < 3:267582/150‑1 (MQ=255) aaTCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTc > 1:1315309/1‑150 (MQ=255) gCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑Ac > 3:125264/1‑94 (MQ=255) gCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑Ac < 4:125264/94‑1 (MQ=255) gCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCt < 1:300052/150‑1 (MQ=255) tgttgtTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAAtt < 1:30746/118‑1 (MQ=255) tgttgtTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAAtt > 2:30746/1‑118 (MQ=255) ttgttgAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCa < 1:3740/150‑1 (MQ=255) ttgttgAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTAAGCTGCCa < 4:69219/150‑1 (MQ=255) gttgAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGc < 4:606324/150‑1 (MQ=255) gAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGtt < 3:675407/150‑1 (MQ=255) aGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAATCCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTa < 2:447339/150‑1 (MQ=255) aGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTa < 2:447021/150‑1 (MQ=255) ggTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACa < 2:1288261/150‑1 (MQ=255) gTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACAt < 1:71623/150‑1 (MQ=255) gTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACAt < 3:375579/150‑1 (MQ=255) tGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCt < 1:1352265/136‑1 (MQ=255) tGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCt > 2:1352265/1‑136 (MQ=255) gCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTTGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGc < 4:607781/150‑1 (MQ=255) gCATGCTGCACAAAATTAAAGATAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTCTCAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATga > 2:517427/1‑149 (MQ=255) aTGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCat > 2:440372/1‑150 (MQ=255) gctgcACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTAtttt < 4:308827/86‑1 (MQ=255) gctgcACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTAtttt > 3:308827/1‑86 (MQ=255) gctgcACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGc < 1:1207712/115‑1 (MQ=255) gctgcACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGc > 2:1207712/1‑115 (MQ=255) gctgcACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCatat > 1:181369/1‑150 (MQ=255) ctgcACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATAtt < 2:181369/150‑1 (MQ=255) caAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCaa < 1:934514/150‑1 (MQ=255) aaaaTTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAAc > 3:497909/1‑150 (MQ=255) aaaTTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACg < 3:594388/150‑1 (MQ=255) 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cccGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAAt < 2:25566/150‑1 (MQ=255) cGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGc < 1:147110/150‑1 (MQ=255) ttCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTcc > 1:729202/1‑134 (MQ=255) ttCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTcc < 2:729202/134‑1 (MQ=255) ttACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGcc > 4:292234/1‑150 (MQ=255) ttACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGcc < 3:255234/150‑1 (MQ=255) aCCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGcccc < 2:433566/150‑1 (MQ=255) cAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGttt > 2:483442/1‑134 (MQ=255) cAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAt > 1:244097/1‑150 (MQ=255) gtacGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtag < 1:344796/147‑1 (MQ=255) tCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtagcc < 3:1978/150‑1 (MQ=255) ggTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCAtagccgtagc > 1:559874/1‑150 (MQ=255) ttACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTg > 1:515654/1‑150 (MQ=255) aCTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTgg > 1:814438/1‑49 (MQ=255) tttttAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGttt < 1:893195/150‑1 (MQ=255) tttAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCa < 1:365296/72‑1 (MQ=255) tttAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCa > 2:365296/1‑72 (MQ=255) tAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCg > 2:572654/1‑150 (MQ=255) tAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCg < 1:999994/150‑1 (MQ=255) | TCGAGTTTTTATGCTAAAGATTGCAAGTTGCTTGTAAAAGATAAGTACACTGATCCATAATCGCTGTTGTTGAGGGTGCATGCTGCACAAAATTAAAGTTAAAAAGTAAAACCCCCGTTCCTTACCAGTTCGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGA‑ACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAGC > NC_000913_3_hsa_tpiA/2700452‑2700750 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |