| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 76896 = | 2749 (0.900) | 348 (0.130) | 136/226 | 13.3 | 12.8% | intergenic (‑145/+40) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein |
| ? | CP016816 | = 76892 | 2257 (0.820) | intergenic (‑141/+44) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 789 total aligned reads displayed.
AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aa‑aaaaaaa‑a‑aaaGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < CP016816/76892‑76766 TTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑A > 1:2415210/1‑128 TTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑A > 1:3801140/1‑128 TTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAAATGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑AC‑AA‑A > 2:3457602/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AA > 1:5609613/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AA > 1:6014158/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAAAAATTGTT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AA > 1:6120222/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGAAAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AA < 1:1088164/128‑1 GATATTAAAGTAAATATCACTTATTTATATATAAAAAACATATATATATAAAAATTATTATAATAAATCAATTCATCTTTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAA < 1:5254386/128‑1 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAATTTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAA > 1:4302520/1‑128 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAA > 1:3925360/1‑128 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTATTT‑CC‑AA‑AAA > 1:774398/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTTTTAAATTGAAATTCTAATAATATTT‑AAAATTATATTTTATTT‑CA‑AA‑AAAA > 2:4810363/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTTTT‑AAAATTATATGTTATTT‑CC‑AA‑AAAA > 1:3063943/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAA > 1:653445/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAA > 1:351828/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CA‑AA‑AAAA > 2:1152262/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTAATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAA > 1:5774172/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATAACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGAAAAATTATTAGAAGAAATCAATTAATATTTAAAATTGAATTTCTAATAATATTT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAA > 1:3359230/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATTTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA > 2:3846539/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA > 2:6283211/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAA > 2:2498326/1‑128 ATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAA > 1:5687823/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTATAAGAAATCAATTAATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATTTTATTT‑AC‑AA‑AAAAAAA‑A > 2:1934868/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A > 1:673804/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A > 1:6444212/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAAATCTAATAATTGGT‑AAAAATATATTTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAAc > 1:2621252/1‑127 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATTTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑A > 2:506538/1‑128 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑A > 1:2256571/1‑128 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑A > 2:309788/1‑128 AAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑A > 2:5969892/1‑128 AAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTATTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AA > 2:1354382/1‑128 AAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGAAAAATTATTATAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTTAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AA < 2:6524375/128‑1 GTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAta > 2:265693/1‑126 ACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATTTGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AATTT‑TGTAATAT > 2:2769616/1‑128 CTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCCTCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑ATAATTAAATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAtattttttata > 1:3180857/1‑117 ATTTAGATATAAAAAACATCTATATATACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAAAAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑‑A‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑C < 1:1845502/128‑1 TTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGATAGAT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAAT‑TTTAAatatatat > 2:2164588/1‑120 AAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAATT‑TGTAATAT‑TTTT‑ATTTAAAAAAT > 2:3622831/1‑128 CATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAAATATATGTTACTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑ATAAAAT‑TTTTATATAATTT‑ATTTAAAAAATTat > 2:2050388/1‑126 aTATATATACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCAAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTT < 2:2329122/127‑1 ATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATAT < 1:1537086/128‑1 TAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑AC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TTTAAAAT‑TTTT‑ATTTAAAAAATTTtaaattataat > 2:4955949/1‑117 AGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAATGTTTTATAT‑TTTTAATTTAAAAATTTTATATTTtttt > 1:2745544/1‑124 CAAATTATTATAAGAAATAAATTCATATTTGAAATTTAAATTATAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATG < 1:4445722/128‑1 ATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑ATTAAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTT > 1:884445/1‑128 TTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTG > 1:1753642/1‑128 atAAATCAATTATTCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATTTTATTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTT < 1:5429265/126‑1 GAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAATT‑TTTATTAT‑TTTA‑ATTAAAAAAATTTATATTTATATAATTTTATTTGATTTTA > 2:1728486/1‑128 GAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAATT‑TTTAATAT‑TTTT‑ATTTAAAAATTTTATCTTAATATAATGTTATTTTAATTTA > 2:6088128/1‑128 GAAATCAAATAATATTTGAAATTTAAATTTTAATAATTGGT‑TAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAA < 1:5860246/128‑1 AATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑ATTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAA > 1:4029807/1‑128 aAATTAATCTGTTAAAATTAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATTTTAGTTACA‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGG < 1:3277725/127‑1 TTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAATT‑TTTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATATTTAAATAATTTTATTTTAATTTAAAGtttaa > 1:6380413/1‑123 CATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TTTAATTT‑TTTT‑ATTTAAAAAATTTATATTTATTTATTGTTATTTGATTTTAAAGGGGAATTT > 2:5860246/1‑128 atattttAAATTTAAATTATAATATTTGTT‑AAAATTATTTTTTATTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTT < 1:3622336/121‑1 ttttttAAATTGAAATTATAATAAATTGT‑AAAATTATATTTTATTTACA‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTG < 2:2423695/122‑1 aattttAATTTTAATAATTTTT‑TAAATTTTTTGTTTGTTACA‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTA < 1:1672149/122‑1 taaattaaaAATAA‑TGGT‑AAAATATAATGTAATTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGT < 2:4572486/119‑1 ttAATTATAATAATTTTTAAAAATTATTTTTTTTTA‑CA‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGT < 1:5183979/126‑1 AATTCTTAAATTTGGT‑AAATTTATATTTTAGTT‑CC‑AATAAAAAAATA‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTT < 2:4195108/128‑1 AATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTA < 1:4602946/128‑1 ATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑ATTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTTGAATTTAAAGGGGATTTTGGGTTTTAAAGTTTTTATTta > 2:471808/1‑126 AATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑‑A‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTTGGTTGTACAGTTATTATTAATTTG > 2:5428125/1‑128 tttctttttgtTTAGTT‑CA‑AATAAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAATAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTA < 1:1347886/117‑1 taagttccaC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTAT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTA < 2:4325638/119‑1 TTAGTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAA < 1:5511307/128‑1 TAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACA < 2:100763/95‑1 TAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACA > 1:100763/1‑95 AGTT‑CCAAA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTTTATTATACATCATTAAGT > 2:4115661/1‑128 AA‑AAAAAAA‑A‑TAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAA < 1:4142723/128‑1 AA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAA < 2:1268177/128‑1 AA‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTAT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAA < 2:3987880/128‑1 A‑AAAAAAA‑T‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTAATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 2:845904/128‑1 A‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAATAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGTGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:6328658/128‑1 A‑AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 2:685645/128‑1 AAATAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 2:4483525/128‑1 AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 1:4818608/128‑1 AAAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑ATTTAAAAAATTTATCTTTATATAATTTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATAAATCATTAATTTCACTAATA > 2:5334815/1‑128 AAAAAA‑A‑AAATT‑TTTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:4382169/128‑1 AAAAAA‑A‑AAAGT‑TTTAATAT‑TTTT‑ATTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGTGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:2975716/128‑1 AAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:3706672/128‑1 AAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:1412708/128‑1 AAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:3312333/128‑1 AAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:6175779/128‑1 AAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:1986659/128‑1 AAAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:2849572/128‑1 AAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATA < 1:3484652/128‑1 AAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATA < 1:6239776/128‑1 AAAAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTAATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTTGGTTGTACAGTTTTTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTAAATAATATA > 2:186315/1‑128 AAA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 2:1473817/128‑1 AA‑A‑AAAGT‑TTTAATAT‑TTTT‑CTTAAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGTGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACTTCATTATTTTCACTAAAATATAT > 2:2981316/1‑128 AA‑A‑AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATAT < 1:5084822/128‑1 AAAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATATTTATATAATGTTATTTTAATTTAAAGGGGAATTTGGTTTTTAAAGTTATTATTAATTTTTATTATAAATCATTAAGTTAACTAATATATATAAA > 2:6377180/1‑128 AAGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAAT < 1:4955949/128‑1 AGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 1:2467405/128‑1 AGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 2:5569447/128‑1 AGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 2:574815/128‑1 AGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 1:2160954/128‑1 AGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 1:1247064/128‑1 AGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 2:1582693/128‑1 AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGT‑AAAATTATATGTTAGTT‑CC‑AA‑AAAAAAA‑A‑AAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aa‑aaaaaaa‑a‑aaaGT‑TGTAATAT‑TTTT‑CTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < CP016816/76892‑76766 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |