Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
42 |
117.4 |
2145065 |
96.9% |
2078567 |
261.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,603,740 |
A→G |
14.9% |
E241G (GAG→GGG) |
lsrC → |
autoinducer 2 import system permease protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,603,740 | 0 | A | G | 14.9%
| 241.1
/ 7.2
| 112 | E241G (GAG→GGG) | lsrC | autoinducer 2 import system permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/50); new base G (7/12); total (49/63) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.17e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
CTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGCCCGCTTTATGACGCCACCGCCATCCGTTAAACC > NC_000913/1603469‑1604013
|
ctctCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGggga > 1:687446/1‑274 (MQ=255)
ctctCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGgaga > 1:325940/1‑274 (MQ=255)
cGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAg < 2:325940/275‑1 (MQ=255)
ctgctgctTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATGCACAACCAGACCGGTACCGGGGTGGAGATGGAAGCAATTGc > 1:808829/1‑275 (MQ=255)
ctTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCCAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGAAGATTGGTTTTATTCCCACACAGACCGGTACCGGGCTGCGGACGAAAGCACTTTCAACCt > 2:491109/1‑274 (MQ=255)
cGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACGGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGGGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGGGTTTGCTTCGCAGATGGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTAACGGGCTGGGGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGtcc > 2:316745/1‑273 (MQ=255)
tccgCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGTTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTgg < 1:385611/271‑1 (MQ=255)
taaGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTggg < 1:706166/273‑1 (MQ=255)
tCAGCATTTGGTTGGTTGACGATAATTTTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGGCGGCGTTTGGACTCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTAGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGAAATTGCAGCCTGCGTGCTggg < 1:924044/275‑1 (MQ=255)
tCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACTGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTggg < 1:102303/275‑1 (MQ=255)
cAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTTTCCCCCACCAGACCGGTACCGGGCCGGGGAGGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGcgtgg > 1:957312/1‑270 (MQ=255)
aTTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCa < 1:173105/274‑1 (MQ=255)
aTTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCa < 1:95993/274‑1 (MQ=255)
aTTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCGTCGGTCTGGGCGGCAt > 1:221007/1‑275 (MQ=255)
aTTGGTTGGTTGACAATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCTGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCa < 1:697223/274‑1 (MQ=255)
ggttggttGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGGGATGAAAGAAATTGCAGCCTGCGTGCGGGGCGGCGTTa > 1:996708/1‑274 (MQ=255)
ggtgggctgttatttggggggcctgtATGGCCGTGCTGCTGGCAAAGCCGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCACCGGGCGATAATTTCCAGGGTGCTCGTCAAGTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCTCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTg < 2:763890/250‑1 (MQ=255)
gttgACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGGGATGACAGCAATTTCAGCCTGCCTGCTGGGCGGCATTAGTTTgg > 2:683581/1‑274 (MQ=255)
gATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGCTAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCTGGCCTTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCACCCCGGTACCGGGCCGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCCGGGCGGCACTAGTTTGCACtgtg > 2:137814/1‑275 (MQ=255)
ttCTGGTGGCATTTATGGCCTGGATGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGAAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAACTGTGTTTGCTTCGCAGATCGGCTTTAACCCGCACCAGACCGGTACCGGGGCGGAGATGAAAGCAATTGCCGCCCGCGTGCAggggcgcgttgatgtggtgggggggtcc > 2:692723/1‑250 (MQ=255)
gtggCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGGGTTTGCTTCGCCGATTGGGTTTATCCCCAACCGGACCGGTACCGGGCTGGGAATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGGTGGGGGGCATTGGTTTGGTCGGTGGGTCCGGttc > 2:1059915/1‑273 (MQ=255)
gcgtttATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTTGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGAt < 1:1045329/272‑1 (MQ=255)
tttATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCCGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGGTGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTGGGTTGCTCGGGGGGTCCGGGTCGATCAt > 1:836499/1‑275 (MQ=255)
tttATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAAGTGTTTTTGCTTCGCCGATTGGTTTTATCCCCAACCCGACCGGTACCCGGCTGGAGATGAAAGCACTTGCAGCCTGCGTGCCTGGCGGCCGTAGTTTGGCCGGGGGGTCCGGTGctcc > 2:324952/1‑269 (MQ=255)
tGGCCGGGGGGCTGGCAAGGACGGCGTTTGGAAGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTTGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTg < 1:377907/273‑1 (MQ=255)
ggCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGTTGCGGTa > 1:486714/1‑275 (MQ=255)
gctgctGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCACCTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGCTTGGGTTTATCCCCACCCCGACCGGTACCGGGCTGGCGTTGAAAGCAATTGAATCCTGCGTGCCTGGCGGCCCGAGTTTGCTCGGTGGTTTCggatccagccttggggggtgc > 2:648115/1‑255 (MQ=255)
gctgctGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGCTTGGTTTTTTCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCCGGAGATTCAAGCAATTTCCTCCTTCGTGCTGGGCGCCCTTAGTTTGCTCGGGGGGTCCggatcgcacacttgcgcggtc > 2:20114/1‑255 (MQ=255)
gctgctGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTa > 1:491135/1‑274 (MQ=255)
gctgctGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACAGGTACATGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGGGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTTCGGTGCGTTCCTTCGTGCGGTa > 1:565759/1‑274 (MQ=255)
tgctgGCAAAGACGGCGTTTGGGCGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATGTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACt < 1:568538/274‑1 (MQ=255)
cAAAGAGGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCa < 1:233303/275‑1 (MQ=255)
aaaGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGGCGCGGGGGATAATTTACGGGGCGTTCGTCAACTGGGCGTTCGTACGGAAGCCATTCGCATTGGTGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTAGCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGGGACGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCa < 2:946561/274‑1 (MQ=255)
aaaGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTTCAGGCTGAGTGCTGGGCGGCATTAGGTTGGTCGGTGGTTGCGGTTCGATCAATGGTGGTGTACCCgggccat > 2:258455/1‑270 (MQ=255)
aggACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCAt < 1:691599/272‑1 (MQ=255)
cGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGTCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGCGCTGGAGATGAAAGCAATTGCCGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGCTCATGGTTGCGGTGCTCgtggcccggtttct > 2:318360/1‑261 (MQ=255)
ttGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACg < 1:48179/275‑1 (MQ=255)
cAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGGGTTTGCCTCGCAGATTGGTTTTATCACCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGACGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCCGCATTAGTTTGCCCGGTGGGTCCGGGACGATCATGGGTGCGGGGCCCGGGGCATGGGTccgtgcccggaagg > 2:486785/1‑263 (MQ=255)
aGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGCGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTGTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGa < 1:582798/275‑1 (MQ=255)
aGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTGACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGa < 1:1059916/275‑1 (MQ=255)
tagcccACGGGCGAGAATTTACGGGGCGTTCGTCAACTGGGCGTTGGTAGTGAAGCCATTCGCATTGTTGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATTGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGTGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGt < 1:488890/271‑1 (MQ=255)
aTGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGc > 2:792709/1‑189 (MQ=255)
ccACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCCGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCCGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCCCGGTGGTTCCGGTGCCATCATTGGTCCCGTACCCGTCCCATTGTTCCTgccccacaacggtcgcctatcg > 2:1067496/1‑254 (MQ=255)
cACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTggg < 1:792709/189‑1 (MQ=255)
aCGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTTCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCCATCATTGGGTCGGTACTCGGCCCCTGCGTCCTGACGCAAGGCGATAGCGTACTgg > 2:531158/1‑274 (MQ=255)
tccAGGGCGCCCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCAATTCGCATGGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTGTGCTTCGCAGATTGGTTTTAGCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCAtt < 1:319673/273‑1 (MQ=255)
aGGGCGCTCGTCAACTGGGCTTTCGTACTGAAGCCATTTGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGATTTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCg < 1:938611/275‑1 (MQ=255)
ggCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGGGGCATTAGTTTGCCTGGTGGTTCCGGTTCGAGCATTGGTGCGGTACCCGGCGCAGGGTTCCTGGCGCCGATCGATAGCGTAcgtgttggctcttttacacatct > 2:367535/1‑253 (MQ=255)
ggCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTTCGGTGCGATCATTGGTGCGGGACTCGGCGCATGGTTACTGCAGGAGGTCGATAGCGTACGGGTGCTGTTGCGCATTCCGGc > 1:92833/1‑275 (MQ=255)
ggCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCCTTGGTGCGGTACCCGGCGCCTGGTTCCTGACGCAGATCGGTAGCGCATGGGTTCTGTTGCGCATTCgggg > 2:471572/1‑274 (MQ=255)
cgcTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCCGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGGGGTTCCGGTGCGATCCTGTGTGCGGTACCCGGCGCATTGTTCCTGACGCCGATTGACAGTGTGCTGGTCCTTCTGCGCATGCCGGcct > 2:1057540/1‑273 (MQ=255)
cgcTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCATGCGGGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGTTCCTTGGTGCGGGACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGGGCACTgggtgcgtttcgtattgcgtcat > 1:751644/1‑254 (MQ=255)
cgcTCGGCAACTCGGCGTTCGTACTGCAGCCATTCGCATTGGGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATTGCGGAACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCATGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCa < 1:692723/274‑1 (MQ=255)
cTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGa < 1:367535/241‑1 (MQ=255)
tCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTGGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGAt < 2:376295/234‑1 (MQ=255)
cAACTGGGTGTTCGTACTGAATCCATTCTCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGTCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTGTTATCCCCAACCAGACCGGTACCAGGCTTGTGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGaa < 1:486785/275‑1 (MQ=255)
cAACTGGGCGTGCGGAATGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGGTGAACGGCTGCGTGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGaa < 2:687446/275‑1 (MQ=255)
ggCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGCATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGGTTTCCCGGTGGTTCCGGGGCCATCCTTCGTCAGGTGCTCTGCCATTGGTTCCTGACCACGCTCGACACCGTCCTGGTCCCGGTgcgtctcccaccccgggggtagtattt > 2:1017738/1‑251 (MQ=255)
cGCATTGTGGCGTTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTctgct < 1:482404/275‑1 (MQ=255)
cGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCCGATTGGTTTTATCCCCCACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCCGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTACGGTGCGAACATCAGTTCGGAACTCGGGGCATGGTTCCTGAGCCAGATCCACAGCGTACTGGGTCCGTTGCGCAACTCGTCGTGGGGTAATGCTTTTATCGAGGGTCAGGtgctgcg > 2:765549/1‑274 (MQ=255)
agtgggggattggcGTTGGGCGGCTGGATTGCGGGTCTGGGGTGAATTGGGTTTGGTTCGCAGATTGGTCTTATCCCCAACCAGACTCGTACCTGGCTGCGGATGAAGGCAATTGCAGACTGCGTGCTGGGAGGCATTAGTGTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTGCTGCTgg < 2:179973/261‑1 (MQ=255)
tggtagtttGGTTGACGGGCTGCATGGCTGCACGGGCGGGAATTGTTTTTGTTTCGTAGTTTGTTTTTATCCCCAACCAGACTGGGACCGGGTTGTAGATGAAGGCAAGTGATGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTTCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCTTTGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTg < 2:632718/269‑1 (MQ=255)
ggCATTTGCGTTTGAGGGCGGCATGGCGGCACTGGCGGGGATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGGGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGc < 1:415942/275‑1 (MQ=255)
cATGTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGc < 1:53612/273‑1 (MQ=255)
aTTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCCTTAGTTTGCTCGGTGGTTCACGTGCCATCATTGGTGCCGTACACGGCCCACGGTTCCTGACGCACATCGCACGCGCACTGGCGCGGTTGGGCATCCCGGGCAGTTGGCATGATTTtctccagggctgttttcttgtggccggtgtg > 2:2392/1‑247 (MQ=255)
aTTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACg < 2:12471/190‑1 (MQ=255)
ttttCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCTGGGCCTGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGGTTTTAGCGCTGGTCTGGTTCTGCTTGCGGTGCTg > 2:327791/1‑273 (MQ=255)
gaggggtggcttGGCGGCACTGGCGGTGATTGTGGTGGGGTCGCGGATGTGTTTTACCCCCGACCGGACCGGGACCGGGCTGGGGATGAAGGGAATGGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATGAGTTTGCTCGGTGGGTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACGGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATg < 2:977660/264‑1 (MQ=255)
aaCGGCGGCATGGGGGCCCTGGCGGGAATTGTGGTTGCTGCGCAGATTGGTTTTCGCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGGCTGCGGGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATg < 2:936875/274‑1 (MQ=255)
aCGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTATATCCCCAACGAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGGGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGa < 1:186793/275‑1 (MQ=255)
gtGGCGGGACTGGCGGGAATTGTGGTTGCTTCTCAGATTGGTTTTTGCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATGGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCg < 1:928615/274‑1 (MQ=255)
ggcggcACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGtt < 1:1057541/275‑1 (MQ=255)
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gCGGGAATTTGGTTTGCTTGGCGGATTGGTTTTGGCCCCAACCGGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCGGCCTGCGGGCTGGGCGGGATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGa < 2:221007/275‑1 (MQ=255)
ggggAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGa < 1:426808/273‑1 (MQ=255)
cGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCgg < 1:1015135/109‑1 (MQ=255)
ggAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACg < 1:327791/275‑1 (MQ=255)
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ggTTTTTGCCCCGACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCTGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCTGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGc < 2:93426/275‑1 (MQ=255)
ggTTTTAGCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCGGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGc < 1:531158/275‑1 (MQ=255)
gTTTTACCCCCAACCAGGACGTTACCGGGGTGGGGATGCAAGAAAATGCAGCCTGCGGGCTGGGGGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGGTCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGcc < 2:808828/275‑1 (MQ=255)
tttATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGGGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGCCCg < 2:535124/275‑1 (MQ=255)
cccaCCAGACGGGTGCAGGGCTGGATAGGAAAGCAATTGCGGCCTGCGTGCTGGGCGGGATTAGTTTGTTCGGTGGTTCCGGTGGGATCATTGGTTCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGTCGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTTCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGCCCGCTTTAt < 2:491135/271‑1 (MQ=255)
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aaCCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGACTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTTCTGGACGCCTGGGGTGTGACTGGGAACGTAATCTACCGCGGCAAAAACATGccccccttttg > 2:488205/1‑265 (MQ=255)
ccAGACCGGTACCGGGCTGGAGAGGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTGCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGCCCGCTTTATGACGc < 1:318360/275‑1 (MQ=255)
aCCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCTGCAAAAATATGCCAGCTTTATGACGCCAc > 1:715231/1‑274 (MQ=255)
ggTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGCCCGCTTTATGACGCCACCGcc < 1:65369/275‑1 (MQ=255)
gtgcggggCTGGGGGTGAAGGCAATTGCAGCATGCGTGCTGGGCGGCATTAGTGTGCTCGGTTGTTCGGGTGCGGTCATTGGGGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGAAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTTGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGCCCGCTTTATGACGCCACCGCCa < 2:631453/270‑1 (MQ=255)
gtgccGGGCTGGGGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGCCCGCTTTATGACGCCACCGCCa < 1:491109/272‑1 (MQ=255)
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gTACCGGGCTGTGGATGAGAGCAGTTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGCCCGCTTTATGACGCCACCGCCa < 1:316745/275‑1 (MQ=255)
tACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCGGGCGGTGCGGGTGTTTGATGGCCGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATGTACGGAGGCAAAAATATGCCCGCTTTATGACGCCCCGGCCAt > 1:1022606/1‑275 (MQ=255)
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ggCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGCCCGCTTTATGACGCCACCGCCATCCGtt > 1:128347/1‑275 (MQ=255)
ggCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGCCAGCTTTATGACGCCACCGCCATCCGtt > 1:764196/1‑275 (MQ=255)
ggCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGGTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGCCCGCTTTATTACGCCACCGCCATCCGtt > 1:796747/1‑275 (MQ=255)
gagaTGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGCTCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGGCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGAGTGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCCACGGCGGCGAAAATATGCCCGGTTTATGAGCCCCCCGCCCTCCGTTCAAcc > 2:94980/1‑275 (MQ=255)
gagaTGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCGCAAATATGCCCGCTTTATGCCGCCACCGCCATCCGTTaacac > 1:969666/1‑272 (MQ=255)
gagaTGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGCCCGCTTTATGACGCCACCGCCATCCGTTacccc > 1:80982/1‑271 (MQ=255)
|
CTCTCCGCCCCGCTGCTGCTTGGCGTTTCAGCAATTGGTTGGTTGACGATAATTCTGGTGGCATTTATGGCCTGGCTGCTGGCAAAGACGGCGTTTGGACGCAGTTTTTATGCCACGGGCGATAATTTACAGGGCGCTCGTCAACTGGGCGTTCGTACTGAAGCCATTCGCATTGTGGCATTTTCGTTGAACGGCTGCATGGCGGCACTGGCGGGAATTGTGTTTGCTTCGCAGATTGGTTTTATCCCCAACCAGACCGGTACCGGGCTGGAGATGAAAGCAATTGCAGCCTGCGTGCTGGGCGGCATTAGTTTGCTCGGTGGTTCCGGTGCGATCATTGGTGCGGTACTCGGCGCATGGTTCCTGACGCAGATCGATAGCGTACTGGTGCTGTTGCGCATTCCGGCATGGTGGAATGATTTTATCGCGGGTCTGGTTCTGCTGGCGGTGCTGGTGTTTGATGGACGCCTGCGTTGTGCGCTGGAACGTAATCTACGGCGGCAAAAATATGCCCGCTTTATGACGCCACCGCCATCCGTTAAACC > NC_000913/1603469‑1604013
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
