Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F27 I0 R1
|
83 |
86.1 |
2053078 |
89.1% |
1829292 |
215.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,709,181:1 |
+C |
13.4% |
coding (40/1059 nt) |
rsxD → |
SoxR iron‑sulfur cluster reduction factor component, putative membrane protein of electron transport complex |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,709,179 | 1 | . | C | 13.4%
| 244.6
/ 42.2
| 82 | coding (38/1059 nt) | rsxD | SoxR iron‑sulfur cluster reduction factor component, putative membrane protein of electron transport complex |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (31/40); new base C (6/5); total (37/45) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.32e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.33e-02 |
AGCCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCTGCCGTCGAAGCGGCTATTGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCATTGCTGACAGGCTTATTGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCC > NC_000913/1708942‑1709414
|
aGCCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCTGCCGTCGAAGCGGCTATTGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTTCCCGCGCCCCGGCCAAAAAAACCGCCCAGCAAAAGCGTGTAAACGAGGAATAAAAGGAATTCAGAAGAACAAGGCCCCCTTATACCCaaaa > 1:889857/1‑238 (MQ=21)
aGCCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCTGCCGTCGAAGCGGCTATTGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGGGGGCTAAATGGGATTACGAATAGCTAGCTCCCCTTCTACCCATaa > 2:652420/1‑238 (MQ=255)
aGCCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCTGCCGTCGAAGCGGCTATTGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGACTAGCTAGCTCCCCTTATACCCATaa > 2:996536/1‑238 (MQ=255)
gCCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCTGCCGTCGAAGCGGCTATTGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTAAACCCAAAA‑cc > 2:965235/1‑239 (MQ=255)
gCCAGAACAACAGGTTGGTCCGCAGGAAGCCGCCGTGGAAGGGTCTAGTGCGAGCGCCAAAGCACGGAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGGACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGGCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑c < 1:4549/238‑1 (MQ=37)
accAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCTGCCGTCGAAGCGGCTATGGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑c < 2:592910/237‑1 (MQ=255)
aaaaccggtttgcccGCGCAAACGTGCCGTGCAAGCGGCTATTGCACCGCCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGcc < 1:996536/226‑1 (MQ=38)
cAGGTTGATCCGCGCAAAGCTGCCGTCGAAGCGGCTATTGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAACCGCCCCGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCCTAA‑CCAGCGCCAGAc > 2:732728/1‑239 (MQ=255)
ttGACCCGCGCAAAGCTGCCGTCGAAGCGGCTACTGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATc < 2:637756/238‑1 (MQ=255)
tGATCCGCGCAAAGCTGCCGTCGAAGCGGCTATTGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGGGGCTATTGCCCGCCGTCAGGCCCAAAAAACCGCCCAGCAGAAGGTTGAAAACGGGGGCCAAAATGGATTAAGAAAACCCAACCCCCCTTGAACCCAAAA‑CCacacccggacaaccc > 1:251301/1‑225 (MQ=18)
tGATCCGCGCAAAGCTGCCGTCGAAGCGGCTATTGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCCAGCGCCAGACATc < 2:205880/238‑1 (MQ=255)
tacgggcAAAGGTGCCCTTGAAGCGGCTATTGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACCGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCa < 2:353551/234‑1 (MQ=255)
gcgcAAAGCTGCCGTCGAAGCGGCTATTGCACGCGCCAAAGCCCGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGTGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGGTGTAAACGCGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCCTAA‑ACAGCGCCATAAATCTCGCATTa > 2:981377/1‑239 (MQ=37)
gcgcAAAGCTGCCGTCGAAGCGGCTATTGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTa < 2:889857/239‑1 (MQ=255)
aGCGGCTATTGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCCCATTATGCTGTTGGTGTTGccc > 2:563931/1‑236 (MQ=255)
gcgcAAAGCACGCAAGGTGGCACCGCAACAGGGTAATGGGGTCCCAAGAGAACAGTTTGAGCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGaa < 1:965235/236‑1 (MQ=255)
gCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGGATTTAGAATAGCTAACTCCCCTTATACCCATAC‑CCCGAGCCCAACACCGCGCCTTATGCTGTTGGTTGTGCTCCCACCCCGGCCAGGaagccacgccaca > 1:476102/1‑228 (MQ=37)
aGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACtg < 2:819680/239‑1 (MQ=255)
aCAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATc > 2:7810/1‑177 (MQ=255)
aCAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATc < 1:7810/177‑1 (MQ=255)
cAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTAt < 2:335213/182‑1 (MQ=255)
cAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGGTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGCAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTAt > 1:335213/1‑182 (MQ=255)
aaaggtcTATTGCGGGGCCAGGAGCACCGGTTTAACCCCGCAAAGGCGCCGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTttgg < 1:35579/232‑1 (MQ=255)
aaCAGGCTAATGCGGTCCCAGAAGAACATGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTttgg < 2:834986/239‑1 (MQ=255)
aaCAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGACCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTttggt < 2:616250/239‑1 (MQ=255)
tAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTa < 2:921227/239‑1 (MQ=255)
ctGCGGTACCCGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGATGCCGCGGCGACTGCCCGGGCCCAGGGCAAAAAAGCCGCCCAGAAGAAGGTTGTAAACGTGGACTAAATCGGATTACGGATACCTAGCTCCACTTCTACACATAACCCAGCGCCAGACATCGCGCATTCTCCTGTTGTGGTTGGTGCCAGCCGTGCAAGGAATTGCAGCGCCACGGTGGCTTTTTGGGTgggggca > 1:736484/2‑236 (MQ=255)
attcGGTACCAAAAAAAAGGGTTATACCGCGGAACGCCGGAGGTGCCGAGGATAGTGGCCGGGTACAGGCCAAAAAAGCCGCACAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTAGTCATAATAGCTAGCGCCCCTTATCCCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTTGCAGCCGTGCCAGGAAGCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTAct < 1:961851/236‑1 (MQ=255)
tACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAAt > 2:284153/1‑199 (MQ=255)
tACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAAt < 1:284153/199‑1 (MQ=255)
agaaCAGTTTGAGCCGCGCAAAGGGGCGGTGGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTGCGGCCAAAAAAGCCGCCCAGGAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGGATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATGCCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGa < 1:813487/236‑1 (MQ=255)
aCAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCGGCGCAACTGTGGGTTTTTGGTTGGGGGACTCTCGTTCAGATCCCGt > 2:924911/1‑239 (MQ=255)
aCAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCACCTGTGGCTTTTTGGTTGGGGTCCTCTCGTTCAGATccgtt > 2:813487/1‑236 (MQ=255)
aCAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGGATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGAt > 2:533922/1‑235 (MQ=255)
gTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCGATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGt < 2:382687/235‑1 (MQ=255)
tGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTAGTGCCCGCGCTGAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCa < 2:309293/238‑1 (MQ=255)
aTCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCCGGAATCGCAGCGCAACCGTGGTTTTTTGGGTGGGGTCCTCTCGTTCCGATCCTGTTGGCATCg > 2:84339/1‑239 (MQ=255)
cccggcAAAGGGGCCGTTGCCGGGTCTATTGCCCGGGGTAAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTTTAAACGAGGACTAAAGGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTAGACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGt < 1:6366/235‑1 (MQ=255)
gcAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGATCAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGAAACTGGGGGTTTTTGGTTGGGGGACCCCTGTTCAAATCCTGTTgggacggggtttg > 1:382687/1‑228 (MQ=255)
gcAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTCGt > 2:171144/1‑239 (MQ=255)
gcAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGCTGTAAACGAGGACTACATTGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCCTGCAGCCGTGCCAGGAATCCCACCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTCTCCTCGTTCAGATCCGGTTGGCCTGGGTTTGt > 1:741394/1‑239 (MQ=255)
gcAAACCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGACGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCTCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCCCAGCGCACCTGGGGTTTTTTGGTTGGGGGACCCTCTTTCACATCCTGTTGGCCTCGGtttgg > 1:717727/1‑236 (MQ=255)
cAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGAGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGtt > 2:178667/1‑239 (MQ=255)
cgcgGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAg < 2:251301/239‑1 (MQ=255)
aTTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCg < 2:476102/238‑1 (MQ=255)
cgcTAAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAAc < 2:741394/239‑1 (MQ=255)
tCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTa < 1:563931/238‑1 (MQ=255)
ggCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGCGGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCCCGTTCAGATCCTGTGGGCATCGGTTAAGGCCCTGTTAGCCGAAG‑CCCCCGTACTCACAACACGCa > 1:586511/1‑239 (MQ=255)
ccgccCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGCCTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTg < 1:360216/193‑1 (MQ=255)
ccgccCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCATGATAGCTAGCTCCCCTTATTCCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTttgg < 1:309379/151‑1 (MQ=255)
ccgccCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTg > 2:360216/1‑193 (MQ=255)
ccgccCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTttgg > 2:309379/1‑151 (MQ=255)
ccgcaCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCTTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGCAG‑CCCTCGAACTCAAACTAGGCagtcagctggta > 2:884793/1‑228 (MQ=255)
aacagAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCa < 2:390139/237‑1 (MQ=255)
ggagAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTAGACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCTCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCaa < 2:717727/237‑1 (MQ=255)
aGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTg < 2:586511/239‑1 (MQ=255)
ttttAAACGAGGTCTAAATGGTTTTAAGAATGGCTATCTCCCCTTATACCAAAAC‑CCAGCCGCAGACATCGCGCATTATTGTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCACCTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACCCAAACTACGCAAGAAGTCGGTAGCCGCAACGTTGaaa < 1:652420/236‑1 (MQ=255)
tGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTAGACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCAGCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGaaa < 2:230187/238‑1 (MQ=255)
tagaaggcagcttAAATGGTTTTTAGAATAGCTAGCGCCCCTTATACCAATAA‑CCCGGGCCAGCCATCGGGCATTAAGTTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCGCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGa < 1:920303/227‑1 (MQ=255)
tAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTg > 2:920513/1‑179 (MQ=255)
tAAACGAGGACTAAATGGTAATCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGTGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTg < 1:920513/179‑1 (MQ=255)
aaCGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATaa < 2:785611/239‑1 (MQ=255)
cGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACt < 2:881022/239‑1 (MQ=255)
ggACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCCTGCCAGTAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTGGGGGAACTAGCGTTCAGATCCAGTTGGCATCGGTTAGTGATCTGTTGACCCAAGACTC‑CGTACTCAAACATCCACAGAGTTCGGGAGCCGCAACGTGGAAA‑ATAACttcac > 1:803836/1‑235 (MQ=255)
aCTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAg < 2:594438/203‑1 (MQ=255)
gtcacatgtgtataagagccagccTTATCCCCATAA‑ACCGGGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCATTGCTGa < 1:824008/217‑1 (MQ=255)
ttttaaGAATATCTAGCCCCCTTTTAACCCGTAA‑CCCGCGCCAGGCCTAGCGCTTTTTGCTGTTGGTGTTGCCCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCATTGCTGa < 1:924911/232‑1 (MQ=255)
tATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGc < 1:472604/208‑1 (MQ=255)
tATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGc > 2:472604/1‑208 (MQ=255)
tATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGAAAACCCAACATTGcgggca > 1:691224/1‑234 (MQ=255)
ttCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACg > 1:379483/1‑189 (MQ=255)
ttCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACg < 2:379483/189‑1 (MQ=255)
ttCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCAtctgcctctta > 2:920303/1‑229 (MQ=255)
gtCAGAATGGCTAGCTCCCCTTATAACCATAA‑CCAGCGCAAGACAACGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCCGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCATTGCTGa < 2:1002316/234‑1 (MQ=255)
tagctagcTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGAAATCGCGCATTATGCGGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCATTGCTGACAGGCTTATTg < 2:223192/239‑1 (MQ=255)
agctagctCCCCTTATACCCATAACCCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGtt > 2:182301/1‑122 (MQ=255)
agctagctCCCCTTATACCCATAACCCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGtt < 1:182301/122‑1 (MQ=255)
agctagctCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCACCATTGCTGACAGGCTTATTGc > 2:955642/1‑239 (MQ=255)
ttgggtttaaggtaccgcATAC‑CCATCGCCGGACAGCGGGGATTTTGGTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGTGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCATTGCTGACAGGCTTATTGCt < 1:561930/221‑1 (MQ=255)
ctagctCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTAAGCTCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CCCTCGTACTCACACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACCTTGAAAGATAAACAAGAATAGCTGACAGGGTTATTGGTg > 1:1002316/1‑239 (MQ=255)
cTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGc < 1:908907/145‑1 (MQ=255)
cTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGc > 2:908907/1‑145 (MQ=255)
cATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGACG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTGGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCATTGCTGAAAGGCTTATTGGTGGGGGTAAATATGcccc > 1:622887/1‑238 (MQ=255)
cATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCATTGCCGACAGGCTTATTGCTGGGGGGAAGAATTcccc > 1:985382/1‑238 (MQ=255)
tAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCa > 2:82676/1‑199 (MQ=255)
tAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCa < 1:82676/199‑1 (MQ=255)
tAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCATTGCTGACAGGCTTATTGCTGGCGGTAAGTATTcccccc > 2:408510/1‑238 (MQ=255)
tAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGCCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCATTGCTGACAGGCTTAtt > 2:824008/1‑216 (MQ=255)
|
AGCCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCTGCCGTCGAAGCGGCTATTGCACGCGCCAAAGCACGCAAGCTGGAACAGCAACAGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAA‑CCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTAGTGCTCTGTTAGCCGAAG‑CTCTCGTACTCAAACTACGCAAGCAGTCGGTAGCCGCAACGTTGAAAGATAACTCAGCATTGCTGACAGGCTTATTGCTGGCGGTAAGTATTCCCCCC > NC_000913/1708942‑1709414
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
