Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F9 I0 R1
|
260 |
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226.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
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|
| |
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reads |
annotation |
genes |
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| * | NC_000913 | 4,264,147 | 0 | C | T | 10.2%
| 323.5
/ 6.1
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.82e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
TATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCTCCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCAACAAACAGCAGGCTGAACCCCGCGAACGCGATCCACAAGTTGCC > NC_000913/4263918‑4264378
|
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cccAATAATGTTTTGCACAGAGCTTTAAGCGCCTAACGCCTACGGCGCATAGACTTCACGATCGCCTGCTTTAATATGCTTTACCCCACTGCCGACTTTACTCGCGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCgg < 2:943099/237‑1 (MQ=255)
caaaatttttttggacaGGGCTTTAAGGGCCTAACGCCGACTGGGCATAGGCTACACGATTGCCTGGCTTAATTGGCTTTACACCCCTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCa < 2:1057570/225‑1 (MQ=255)
aataatGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCGCCGCGGAGATATGTGTCGATAAAATT‑GATGGCGCGGGCTTTTTTTTTGTCCCGGGTTTTCTTCTCCGCCgggacgggcg > 2:58182/1‑231 (MQ=255)
atattttttccacatggCTGTAAGCCCCTACCCGCCACTGCTCCTAGCCTTCACGACCGCCTGCATTAATATGCTTTACCCCACTGCCGACTTTCCTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCGACTCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGTATCGGCAGGa < 2:771406/223‑1 (MQ=255)
attttATGCACGGGGCTTTAAGCGCCTAACCCCGACTGGGCATAGACTACACGAACGCCTGCCTTAATAGGTGTTACACCACGGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCCCCGCCGGATCGGCAGGAGt < 2:820157/236‑1 (MQ=255)
attttATGCACAGGGCTGTAAGCGCCTAACGCCGCCTGCGCATAGCCTACACGATCGCCTGCCTTAAGATGCTTTACCCCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGt < 2:933490/236‑1 (MQ=255)
ttATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGCGAGGTCCCTGCGGGTATATGTGTCGTGAAAAAT‑GATGTCGGGTGGTTTTTTTTCGACCGGGGTTTTCTTTTCCCCCGGGTCGGCgggggggga > 2:159613/1‑233 (MQ=255)
tGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGGTATATTTGTCGTTAAAATT‑TGTGCCGATGGCTTTATTTTTGACCTGGATTTCTTTTTCCGCCCGGTCGGCAGGGGGGaaac > 2:726880/1‑236 (MQ=255)
tGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGGTTTCATTCTCCGCCGGATAGGCAggggggacac > 1:923679/1‑230 (MQ=255)
tGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCGCTGCGGGTATATTTGTCGGTAAAATT‑GAAGACGATGGGTTTATTTTCGACCTGGGTTTTATTTTCCCCCGGATGGGCGGGGGGGaaaac > 2:713101/1‑236 (MQ=255)
tGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCGCGGGGGGTAAATGTTTCGATAAAATT‑GTGTCCGATGGGTTTTTTTTTTGCCTGGGTTTTATTTTCCCCCggggcggacggggggacact > 2:663359/1‑221 (MQ=255)
cccaGAGCTGTAAGCGCCTAACGGCGACTGCGCATAGACCACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTa < 1:713101/237‑1 (MQ=255)
gagCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTCATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTTAAGCCCGCCGCGGGTATATGTGTCGATCAAATT‑GATGCCGAAGGGTTTATTTTCGACCTGGATTTCTTTCTCCGCCGGCTCGGCCGGGGGGAActccccggg > 2:619026/1‑233 (MQ=255)
agCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCGCTGCGGGTATATTTGTCGATAAAATT‑GATGCCGAGGGCGTTTTTTTTGACCCGGGTTTTTTTCTCCGCCGGACCGGGAGGGGGGGAGTCTACGGC‑t > 2:58918/1‑239 (MQ=255)
agCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCGCTGCGGGGATATGAGTTGCTAAAATT‑GATGCCGAGGGGGTTATTTTTGACCTGGGTTTCATTTTCCGCCGGATCGGCAggggggagaacaccg > 2:1082745/1‑223 (MQ=255)
gCTGTAAGCGCCTAACGCCGACCGCGCATAGCCCACCCTGTCGGCTGCCTTAATATTCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑t < 1:58918/238‑1 (MQ=255)
tGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCTTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTg < 1:1030270/238‑1 (MQ=255)
tGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGGTTAAAGGTTCGATTAAATTGGATG‑CGATGGGTTTTTTTTCGACCTTGATTTTATTTCCCGCCGGGTCgggcggggggaacactcaggggtta > 2:573112/1‑216 (MQ=255)
aaGCCCCTAACCCCGACTGCCCATTGTCCACCCGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACCCCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTGCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGt < 2:674677/239‑1 (MQ=255)
tggcATAGACTACACGTTCGCCTGCCTTAATATGCTTGACACCACTGCCGACTTTACTCCCGATGCCTGCGGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑Gc < 1:277716/237‑1 (MQ=255)
tCGCCTGCCTTAATAGGCTTTACCCCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAaa‑ttcaattc < 1:89491/238‑1 (MQ=255)
ccGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAaa‑ttcaattc < 1:390898/237‑1 (MQ=255)
gcctgcctTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCgtg < 1:254704/239‑1 (MQ=255)
gccctgctttattcgCTTTACCCCACTGCCGACTTTACTCCCGATGCCTGGTGCTTCGGTGCCTAACCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGGGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCgtg < 1:210212/225‑1 (MQ=255)
cctTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTa < 1:59465/186‑1 (MQ=255)
cctTAAGATGCTTTACACCCCTGCCGAGTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑Gc < 1:232709/215‑1 (MQ=255)
ctTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGGAAAGGCCCCTGCGGGTATATGTGTCGGTAAAAAT‑GGTGCCGCTGGCCTTATTTTTCACCTTGGTTTCATTTTCCCCCGGGTCGGCAGGAGGGGAACCTTCCGC‑TTT‑AAGTACTTCCCGGGCCCCCGG‑GTGTGT‑GAAA‑TCAAATTGCTGtttc > 2:254704/1‑236 (MQ=255)
ttAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTTCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCAt < 1:159613/239‑1 (MQ=255)
atttGCTTTACACCCCTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAACCCGGTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCAtgtg < 1:485881/236‑1 (MQ=255)
cTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGGTATATGTGTTGGTAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTTTCCGCCGGGTCGGCAGGGGGGAAATCTAACGC‑TTG‑AAAGAGTT‑TCCGGCCCCCCC‑GGTTTT‑GAAATTTAAATTGGTGGTG‑CCagttgccc > 2:769170/1‑231 (MQ=255)
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caccacTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGCCCTGGGTTTCATTTTCCGCCGGATCGGCCGGGGGGGACCCTACAGC‑TTT‑AAATAATT‑CCCGGCCCCCCT‑GCCTGTGGAAA‑TTAAATTC‑TGTTGTCCGAGTTTCCTCCaca > 2:481527/1‑237 (MQ=255)
ccacGGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCTCCAGAACg < 1:867572/239‑1 (MQ=255)
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tttACTCACGAGGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCTCCAGAACGTATCGTCAgg < 1:771391/238‑1 (MQ=255)
tttACTCAAGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTtgt‑g < 1:1081324/192‑1 (MQ=255)
ttACCCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCTCCAGAACGTATCGTCAGGGt < 1:663359/239‑1 (MQ=255)
ttACCCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTATACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTTAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCTTCCAGAACGTATCGTCAGGGt < 1:270071/239‑1 (MQ=255)
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cTCAGGAGGCCTGCTGGTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGGAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGTTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCTCCAGAACGTATCGTCAGGGTCTg < 1:913937/239‑1 (MQ=255)
gaCGATGCCTGCTGCTTCGGGTCCTAAGCCGATGGGTAGCGATGGGGGGGGGTAAAGGCCGGTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTTTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCTCCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCt < 1:170881/238‑1 (MQ=255)
cACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCTCCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCt < 1:96078/239‑1 (MQ=255)
cACGATGCCGTCTGCTTCGGTGACTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCTCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCTCCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCt < 1:773274/239‑1 (MQ=255)
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gCCTAATCCGTTGGGTAGCGATGGGGGCGGGTAAAGGCCGGTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCTCCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGAcc < 2:185200/239‑1 (MQ=255)
gCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGGGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGTATATATTTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACGCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCTCCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGAcc < 1:652240/239‑1 (MQ=255)
tGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTTGGGATATATGTTTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCTCCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTAt < 1:986952/238‑1 (MQ=255)
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gtaatttttgtgtcggtGGTTTTTTTTTCTATCTGGATTTCTTGCTTCGCCGGTGCGGGTGGGGTTAACTTTACGGT‑TTG‑CACTACTT‑CCGGCCCTACGT‑CCTTGT‑TAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGCCCTCCAGAACGTATCGTCAGGTTCTGCTTCATATGATAT‑AGTTGCGTCCCATTCTTTAGCTCGGTAACTCAATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCaacaaaca < 2:305606/223‑1 (MQ=255)
gaaaaTT‑GATGCCGATGGCTTTATTTGCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCTCCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCaacaaaca < 1:178348/237‑1 (MQ=255)
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|
TATCCGCAATAATGTTATGCACAGAGCTGTAAGCGCCTAACGCCGACTGCGCATAGACTACACGATCGCCTGCCTTAATATGCTTTACACCACTGCCGACTTTACTCACGATGCCTGCTGCTTCGGTGCCTAATCCGCTGGGTAGCGATGGCGGCGGGTAAAGGCCGCTGCGGATATATGTGTCGATAAAATT‑GATGCCGATGGCTTTATTTTCGACCTGGATTTCATTCTCCGCCGGATCGGCAGGAGTGAACTCTACGGC‑TTG‑AAGTACTT‑CCGGGCCACCGT‑GCTTGT‑GAAA‑TTCAATTCGTGTTG‑CCATGTGTCCTCCAGAACGTATCGTCAGGGTCTGCTTCATATGATAA‑AGTTTCGACCCATTCTTTATCTCGGTAACTCCATT‑CACTATGGC‑AGG‑AAATAAACCCTTCAACAAACAGCAGGCTGAACCCCGCGAACGCGATCCACAAGTTGCC > NC_000913/4263918‑4264378
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
