Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F27 I0 R1
|
322 |
127.1 |
2757226 |
91.8% |
2531133 |
223.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
983,035 |
T→G |
16.2% |
intergenic (+141/‑40) |
ldtD → / → ycbK |
murein L,D‑transpeptidase/M15A protease‑related family periplasmic protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 983,035 | 0 | T | G | 16.2%
| 265.0
/ 4.1
| 124 | intergenic (+141/‑40) | ldtD/ycbK | murein L,D‑transpeptidase/M15A protease‑related family periplasmic protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (52/46); new base G (22/4); total (74/50) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.44e-03 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACACTCTCTACCCCACGCCCGCGCATTTTGACACTCAATAATCTTCATACCGGAGAGTCAATCAAAGCGGAGTTTTTCGATGGCAGAGGCTATATTCAGGAAGAA > NC_000913/982804‑983269
|
tACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCAtata < 2:924238/239‑1 (MQ=255)
aCCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCAtata < 1:272126/238‑1 (MQ=255)
aGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGGGCCCCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCAATTAAACgg > 1:707972/1‑238 (MQ=255)
tATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCCGAA‑GTGCATATCAACGAT‑a > 1:5384/1‑239 (MQ=255)
tATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GGGCATATAAACGAT‑a > 1:1014708/1‑239 (MQ=255)
tATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGGGCCTCTTTTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑a > 1:793503/1‑239 (MQ=255)
aTCGTTAAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTAGCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGa < 1:1315143/236‑1 (MQ=255)
cGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACa < 1:1247707/239‑1 (MQ=255)
ttcAGATATTTCCAATTTGTTTCTGCCTGCGCGACCCAGCCTGAAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACAtt < 2:671733/237‑1 (MQ=255)
tACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGGGCCCGAA‑GGGCAATTAAACGGT‑AACAtt > 1:1099018/1‑239 (MQ=255)
tACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGGGCGCCAGAA‑GGGCATAAAAACGAA‑AACaat > 2:1050281/1‑237 (MQ=255)
tACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCCCTTGGGCGCCAGAA‑GGGCAATAAAACGAG‑aaaaat > 1:989149/1‑235 (MQ=255)
tACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATATTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCAGATAACCGAT‑AACact > 1:556203/1‑237 (MQ=255)
atatTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGGCCCTTTGGTGCCAGAA‑AGGCATATAAACAAA‑AAAATTTAccg > 2:415124/1‑238 (MQ=255)
atatTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTTGGCGCCAGAA‑GGTCATATAAACGAT‑AAAATTGAccg > 1:403880/1‑238 (MQ=255)
atatTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCAtata < 1:215650/222‑1 (MQ=255)
atatTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATTTAAACGGT‑AACATTGAc > 1:139365/1‑237 (MQ=255)
atatTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGGGCCTCTTGTGGGCCCGAA‑GTTCATAAAAACGAA‑AAAACTGAccg > 2:876446/1‑238 (MQ=255)
tttACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTa < 1:36319/239‑1 (MQ=255)
tACTATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGGAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTACTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGCCGATTCTCTGCAGCCCCCGCCACTGCTGGGGCTGGCTATTCCTGACGTCTGCTTTACGGGGCGTTAAGGGGCACCCTGCGCGCCGGAA‑GTGCATATTAACGAC‑AACATGAACCCGTAg > 2:361593/1‑238 (MQ=255)
tACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCCGCCCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAGCTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGCCGATTCTCTCCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTTATTAATCTTGACTTCTGCTTTACGGCCGGTTAAGGGCCCTCTTTCCCCCCCAAA‑GTGCAACTAAACCCT‑AACAttaccctcgaga > 2:1000168/1‑229 (MQ=255)
tACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTg < 2:50656/211‑1 (MQ=255)
tACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GGGCATATAAAAGGTAAACATT‑ACCTTTAGa > 2:931533/1‑239 (MQ=255)
aaTTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGa < 1:501139/219‑1 (MQ=255)
ttATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGCCGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCGAAA‑GGGCATATAAAAGAA‑AAAAtctgtttctttatcca > 2:215650/1‑223 (MQ=255)
aTGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCACCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGCCGCCTTTACGGGCGGTTAAGTGGCCCTCTGTCGGCCCAAA‑GGGGATATAAAGGGA‑AAAATTGAccgtgaaactttgat > 2:398721/1‑226 (MQ=255)
tgcctgcGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGGGCCTCTTGTGCGCCCGAA‑GGGCATATAAACACA‑AACATTTACCCGtgtccttttaacccaat > 2:501139/1‑223 (MQ=255)
tgcctgcGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTCCTTTACGGGCGGTTAAGGGGCCCCTTGTGCGCCCGAA‑GTGCCTTTAAAACAT‑AAAATTTACCTGTAGACtttgtttacctg > 2:746187/1‑229 (MQ=255)
cctgcGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTTGGCGCCCGAA‑GGGCATATAAAAGAA‑AACATTTACCTGAAAACTTGATTATAATGGa > 2:187647/1‑239 (MQ=255)
cctgcGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAAGGGCCTCTTGTGCGCCCGAA‑GGGCATATAAACGAA‑AAAATTGTCCCGTGAACTTTAtttcaaagga > 2:1225857/1‑231 (MQ=255)
cctgcGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGAGGTTAAGGGGCCTCTTGTGCGCCACAA‑GTGCATATAAAGGAG‑AAAATTGGCCTGGTGCCTTGCTTATCATggg > 1:647940/1‑238 (MQ=255)
cctgcGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGGCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCTCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTCCTTTAGGTGCGGGTACGGTGCCTCTTTTGCGCCCTAA‑CGGGATATAAACGAT‑AAAATCATCCTGTaaaactaaataacagggg > 2:587357/1‑222 (MQ=255)
gcgcGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGCCTGCTTTACGGGCGGGTAAGGGGGCTCTTGTGCGCCAGAA‑GGGAATAAAAAAGGT‑AACAATGACCTGTaagatttatattcatgggaaa > 2:1285857/1‑219 (MQ=255)
gATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAAtt < 1:934882/238‑1 (MQ=255)
aTCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGc < 2:1121736/189‑1 (MQ=255)
cTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGa < 2:1308051/193‑1 (MQ=255)
aaaTCTTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATcgc < 1:754752/239‑1 (MQ=255)
aaaTCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGGCTCTTGGGGCCCAGAA‑GGGCCTTTAAACCAA‑AAACTTTACCTGAAGAATTGTTTATAATGGAAAAAATCAACGCaaaaag > 2:340306/1‑235 (MQ=255)
aaaTCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCCGTAGACTTGATATTCATGGCAAAATTcgccgcacatac > 1:923773/1‑232 (MQ=255)
aaaTCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGGGCCCCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATcc > 1:1056305/1‑237 (MQ=255)
tATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTTGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCaaa > 1:48961/1‑239 (MQ=255)
tCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGGTTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCCTTTGTGGGCCAGAAGGGGCAT‑TAAACGAT‑AAAATTTCCCTGTGAACTTGATTATAATGGCAAAATTcacaccaaaaacgcccaaaaa > 2:538486/1‑219 (MQ=255)
aGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTCAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACCAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGCCAAATTCGACGCTAAACGCCCCAAATTGCTgg > 2:1190964/1‑239 (MQ=255)
cAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTtgg < 1:187647/239‑1 (MQ=255)
aTTAATTTGTTAAATGAAGTTGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGGGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTtggtg < 2:36227/239‑1 (MQ=255)
cAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATTGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGtt > 1:117483/1‑238 (MQ=255)
attaaGTATTTTGGGGAAATCGGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTTCCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCgg < 2:434339/236‑1 (MQ=255)
tagtTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCCGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGCCAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGCCGTT‑GAACCCGGGgccc > 1:1105363/1‑237 (MQ=255)
ttttCGGGAAAAATAGTTGTCTTAATAATTGGGATGATTGGGGGCGATTCTGTGCAGCCCCTGTCCCTGCTGGGGTTGAGTCATCTGGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAATGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTgccg < 2:1136178/235‑1 (MQ=255)
agtTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GGGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGTGGGCGTT‑GCACTCGGGgccgc > 1:125416/1‑238 (MQ=255)
ttCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTTGAGACTTGGTTATCATGGACAAATTCCAGGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGGgccgcaa > 1:1326271/1‑236 (MQ=255)
ctttGTCTTATTAATTAGCATGGTTGGGGGCGTTTTCCTGCAGCCCCCGTCACTGCGGGGGTTGAGGCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGAcccc < 2:707972/237‑1 (MQ=255)
ataatTATCATGACTGGAGGCTATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGCCGGTTAAAGTGCCTCTTTTGCCCCCGGA‑GTGCCTCTAAACGAT‑CACCTTCACCTGTAGACTTTATTATCACGGCCCCATTCGACGCCAATCCCCCCAAATTCCTTGCGCTTGGTGTCGCC‑GCACCCGGGGCCGCCACCCCTCCGCCCCCCGCGG‑TTGCa > 2:1192884/1‑239 (MQ=255)
ataatTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGGGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATCTAAACGAT‑AACATTTACCTGTAGACTTGATTATCATGGACCAATTCGACCCTAATCGCCCCCAATTGCTGGCGCTTGGTTGCGTT‑GCACCCGGTGCccccaccccccccaccccccgctttgca > 2:1000596/1‑229 (MQ=255)
atTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAaca < 1:931533/239‑1 (MQ=255)
atTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAaca < 1:43126/239‑1 (MQ=255)
atTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTGACGGGCGGTTAAGGTGCCTTTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAaca < 1:1190964/239‑1 (MQ=255)
tAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTTCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTCCCGACCCCTGCGT‑TTGCacaac > 1:702478/1‑234 (MQ=255)
aGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCCCCGCCAATTGCTGGCGCTTGGGGGCGTT‑GCACTCGGTGCCCCCATCCTTCCGGCCCCCCCGG‑TTGCAACAct > 1:560553/1‑238 (MQ=255)
ctttgttGGGGGCGTTTTCCTTCAGCCCCCGTTCCTGCGGGGTTTGAGTCCTCTTGACCTCTGTTTTACGGGGCGTTAAGGTGCCTCTTTTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACActctc < 2:983429/234‑1 (MQ=255)
cATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCCCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTGTCATGGACCAAATCGCCGCTAATCCCCTCCAATTGCTGAGCCTTGGTGGCGTTGGCAC‑CGGTGCCCCCATCCGCCCCACCCCCCCCG‑TTGCAacccccc > 2:109227/1‑233 (MQ=255)
cATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGGTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAG‑AACATTGACCTGTAGACTTGCTTATCATGGACAAATTCGAAGCTAAACGCCCCAAATGGTTTGCGCTTGGTGGCATT‑TAACTCGGTGACGCCACCTCGCCG‑CACCCGCGTCTTGCAAAActccc > 2:503385/1‑237 (MQ=255)
aTTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTTTCATGGACAAATTCGACGCTAATTGCCGCAAATTGCTGACCCTTGGTGGCGGT‑GCACTCGGTGCCGCCACCCTTCCCCCCCCTGCGT‑TTTCAACACTCTCTaa > 2:962032/1‑237 (MQ=255)
aTTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTAAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTTTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTTACCTGTAGACTTGATTATCATGGGCAAATTCGACCCTAATCGCCGCAAATTTCTGGCGCCTGGGGGCGTT‑GCACCCGGGGCCCCCCCCCTGCCCCCCCCCCCGT‑TTTCAacacccccaca > 2:1260718/1‑231 (MQ=255)
ggggCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GGGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTa > 1:772694/1‑121 (MQ=255)
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ggCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGGGGCGTT‑GCACTCGGGGCCGCCCCCCTGCCGACCCCCCCGT‑TTGaaaacacactaaccccacc > 2:117205/1‑222 (MQ=255)
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tGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGGGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTATACTTGGTTATCAGGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCCTCCCCACGACCCCTGCGT‑TTGAAACCCCATCTACCCCACCCCCCCGCAttt > 2:1358275/1‑239 (MQ=255)
gCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTTATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTTTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGCCCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCGATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACACTCTCTACCCCACGCCCGCGCATTTTGac < 1:1225857/239‑1 (MQ=255)
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cccccGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCCCTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACActctc > 2:851906/1‑214 (MQ=255)
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ccGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCCGCGT‑TTGCAACACTCTCTACCCCACCCCCCCCCCATTTGacaacc > 2:92826/1‑236 (MQ=255)
gTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACActctc > 1:447232/1‑209 (MQ=255)
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tCACTGCTGGGGTTGAGTCCACTTGAAGTCTGCTTTACGGGGGGTTAAGTGTCCTTTTGTGCGCCAGAA‑GGGCATATAAACGAT‑AACATTGACCGGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACACTCTCTACCCCACGCCCGCGCATTTTGACACTCaat < 2:845087/239‑1 (MQ=255)
gtcgggggTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATCCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACAct < 1:1012641/197‑1 (MQ=255)
ctgGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGCTCCTCTTGGGGGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AAAAATGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACCAATTTGGAGCTAATCGCCGCAAATTTCTGGCGCTTAGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGAACCCTGCGT‑TTGCAACCCTCCCTACCCCACGACCGCCCATTTTTAACCCCAATAATCt > 2:973185/1‑238 (MQ=255)
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tttgtccatttggcggttGCTTTTCGGGGGGTTAAGGTGCCTTTTTTGCCCCAAAA‑GTGAATAAAAACGAT‑AACATTGGCCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCCCTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACACTCTCTACCCCACGCCCGCGCATTTTGACACTCAATAATCTTCATACCg < 2:702478/222‑1 (MQ=255)
gAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCCCTCGGTGCCCCCATCCTTCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACCCCCTCTACCCCACGCCCCCGCACTTTTCAACCCAATAAAATTCAAAACgg > 2:482304/1‑239 (MQ=255)
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cGGTTAAGGTGCCTTTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACACTCTCTACCCCACGCCCGCGCATTTTGACACTCAATAATCTTCATACCGGAGAGTCAATCAAAGCGGAGTTTTTCg < 1:482304/238‑1 (MQ=255)
ggTTAAGGTGCCTCTTTTGCGCCAGAA‑AGGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTCCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACACTCCCTACCCCACCCCCGCCCATTTTGACACTCAATAATCTTCATACCGGAGAGGCAATCAAACCGGAGGTTTTCGAt > 2:244238/1‑239 (MQ=255)
ggTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGGGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACACTCTCTAcc > 1:887225/1‑170 (MQ=255)
tAAGGTTCCTCTTGGGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACACTCTCTACCCCACGCCCGCGCATTTTGACACTCAATAATCTTCATACCGGAGAGTCAATCAAAGCGGAGTTTTTCGATGGc < 1:876446/239‑1 (MQ=255)
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agggtccTTTTGGGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATGGACCTGTAGACTTGATTATCAAGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACACTCTCTACCCCACGCCCGCGCATTTTGACACTCAATAATCTTCATACCGGAGAGTCAATCAAAGCGGAGTTTTTCGATGGCag < 1:389879/234‑1 (MQ=255)
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aaa‑GGGCATTTAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGGCTTGCTTTTCTGGGACAAATGCGCGCCTAATCGCCGCAAATTGCCGGCGCTGGGTGGCGTT‑GCCCCCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACACTCTCTACCCCACGCCCGCGCATTTTGACACTCAATAATCTTCATACCGGAGAGTCAATCAAAGCGGAGTTTTTCGATGGCAGAGGCTATATTCAGgaagaa < 2:919131/238‑1 (MQ=255)
|
TACCCAGTATCGTACAGATATTTACAATTATGATCTGCCTGCGCGATCCAGCTCGCAAATCGTATCGAAAGCGGAACAATTAATCAGGTAAATGAAGTAGTTCGGGGAAATCAGTTGTCGTAATAATTAGCATGATTGGGGGCGATTCTCTGCAGCCCCCGTCACTGCTGGGGTTGAGTCATCTTGACGTCTGCTTTACGGGCGGTTAAGGTGCCTCTTGTGCGCCAGAA‑GTGCATATAAACGAT‑AACATTGACCTGTAGACTTGATTATCATGGACAAATTCGACGCTAATCGCCGCAAATTGCTGGCGCTTGGTGGCGTT‑GCACTCGGTGCCGCCATCCTGCCGACCCCTGCGT‑TTGCAACACTCTCTACCCCACGCCCGCGCATTTTGACACTCAATAATCTTCATACCGGAGAGTCAATCAAAGCGGAGTTTTTCGATGGCAGAGGCTATATTCAGGAAGAA > NC_000913/982804‑983269
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
