Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A18 F70 I0 R1
|
504 |
105.3 |
3845710 |
98.0% |
3768795 |
140.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,410,037 |
T→C |
5.5% |
intergenic (+31/‑96) |
rlmB → / → yjfI |
23S rRNA mG2251 2'‑O‑ribose methyltransferase, SAM‑dependent/DUF2170 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,410,037 | 0 | T | C | 5.5%
| 268.3
/ 3.6
| 87 | intergenic (+31/‑96) | rlmB/yjfI | 23S rRNA mG2251 2'‑O‑ribose methyltransferase, SAM‑dependent/DUF2170 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/39); new base C (3/2); total (46/41) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.11e-01 |
ACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAAC > NC_000913/4409890‑4410184
|
aCTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGAtt < 2:547720/148‑1 (MQ=255)
aCTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGAtt < 2:584802/148‑1 (MQ=255)
tCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTgg > 4:310497/1‑149 (MQ=255)
cGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTgg < 1:18573/148‑1 (MQ=255)
cGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGa < 3:721063/149‑1 (MQ=255)
cGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCCGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTgg < 1:48995/148‑1 (MQ=255)
tGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATg > 3:908977/1‑149 (MQ=255)
aaCATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑t < 3:436420/149‑1 (MQ=255)
cATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑tt < 1:492929/148‑1 (MQ=255)
gCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑tttttt < 1:362107/148‑1 (MQ=255)
gCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGG‑cttttca < 3:302071/149‑3 (MQ=255)
gATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑ttttttttt < 3:617097/149‑1 (MQ=255)
gATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑tttttttt < 1:355607/148‑1 (MQ=255)
gATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGACGG‑tttttttt < 1:112987/148‑1 (MQ=255)
tGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTg < 1:314169/148‑1 (MQ=255)
ttGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCtat > 3:40112/1‑149 (MQ=255)
ttGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCta < 1:338392/148‑1 (MQ=255)
aTCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGc > 3:20627/1‑149 (MQ=255)
cATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTa > 3:801041/1‑149 (MQ=255)
aTCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCTGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTaa > 3:510369/1‑149 (MQ=255)
aTGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATaa < 1:260606/148‑1 (MQ=255)
gCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGTATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGT‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTAc < 4:303390/149‑1 (MQ=255)
aaGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑t > 1:430337/1‑112 (MQ=255)
aaGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑t < 2:430337/112‑1 (MQ=255)
aaGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAtt > 3:666542/1‑149 (MQ=255)
gCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGc > 4:478055/1‑149 (MQ=255)
cGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCTGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGc > 2:967960/1‑148 (MQ=255)
tttCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCaaa < 4:442729/149‑1 (MQ=255)
ttctgcCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCGAGATCTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCaaa > 2:829796/1‑148 (MQ=255)
tcttcCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAat > 1:914820/1‑148 (MQ=255)
ttcCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATAtt > 3:58699/1‑149 (MQ=255)
tcCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATAtt < 1:587791/148‑1 (MQ=255)
tcCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATAtt < 2:627624/148‑1 (MQ=255)
ccTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAt > 4:250018/1‑149 (MQ=255)
cTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAtt > 3:535761/1‑149 (MQ=255)
tGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAttt > 4:206069/1‑149 (MQ=255)
gAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAtttt < 3:96719/149‑1 (MQ=255)
caCGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTtta > 4:273837/2‑149 (MQ=255)
aaCGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGTATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTtta > 4:550078/1‑149 (MQ=255)
aCGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTtta < 1:167769/148‑1 (MQ=255)
ttCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCTATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAat > 3:389470/1‑149 (MQ=255)
ttCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTaa > 2:39836/1‑148 (MQ=255)
ttCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTaa > 1:381752/1‑148 (MQ=255)
ttCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTaa < 1:866694/148‑1 (MQ=255)
ttCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTaa > 1:71499/1‑148 (MQ=255)
tCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCTATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAata < 4:389470/149‑1 (MQ=255)
cGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGAAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAatat < 4:836755/149‑1 (MQ=255)
gCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTaaa < 4:40112/149‑1 (MQ=255)
aCCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACtt > 4:205001/1‑149 (MQ=255)
aCCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACtt > 3:665126/1‑149 (MQ=255)
cGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGGTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTaa > 4:790491/1‑149 (MQ=255)
ggAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTaa > 1:90962/1‑148 (MQ=255)
tttGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCtat < 3:110472/149‑1 (MQ=255)
tttGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCta > 1:432522/1‑148 (MQ=255)
tttGCTTATTTGAACCGTTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATAA‑TTTTTTTTTGTATAGAGCTCGTAACATAATAACGTATTGCAAAGATTCATTATATTAACATTTAAACTTAAGCtat < 4:32123/149‑1 (MQ=255)
ttGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCGATCCAGACTTGGTTGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATTTTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCtat > 2:394997/1‑148 (MQ=255)
ttATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGa > 3:498163/1‑149 (MQ=255)
ttATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGa > 3:373156/1‑149 (MQ=255)
tATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGaa < 3:310497/149‑1 (MQ=255)
tATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGa > 2:400874/1‑148 (MQ=255)
tATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGa < 2:648993/148‑1 (MQ=255)
aaGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAataata > 1:876832/1‑148 (MQ=255)
gCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAatata < 1:400874/148‑1 (MQ=255)
agctGCGCTGGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATg > 3:373658/4‑149 (MQ=255)
cgcCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACAtt < 4:279438/149‑2 (MQ=255)
gcgcAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAAt < 2:914820/148‑1 (MQ=255)
gcAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTTTTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATcc > 2:516915/1‑148 (MQ=255)
aGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGtt < 4:248037/149‑1 (MQ=255)
ttCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTa < 3:753670/149‑1 (MQ=255)
tcAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGc < 1:198996/148‑1 (MQ=255)
tcAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCg > 3:85300/1‑149 (MQ=255)
gAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACg > 4:555994/1‑149 (MQ=255)
ttATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGgc < 2:146006/148‑1 (MQ=255)
aTGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCt > 3:843031/1‑149 (MQ=255)
gAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATg < 4:429522/120‑1 (MQ=255)
gAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATg > 3:429522/1‑120 (MQ=255)
aaaaCCATCCAAATCTGGATGGCTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCa > 4:337035/1‑149 (MQ=255)
aGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAAc < 4:174513/149‑1 (MQ=255)
gCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCATTGGCGCTAGCGTCGGCGCTGCAAACt > 4:617302/1‑149 (MQ=255)
ccATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTg > 3:126331/1‑149 (MQ=255)
cATCCAAATCTGGATGGTTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATAtt > 2:509374/1‑65 (MQ=255)
cATCCAAATCTGGATGGTTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATAtt < 1:509374/65‑1 (MQ=255)
aTCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTgca > 4:541350/1‑147 (MQ=255)
aTCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTa > 3:760389/1‑149 (MQ=255)
tCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGtt > 4:484435/1‑120 (MQ=255)
tCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGtt < 3:484435/120‑1 (MQ=255)
ccctgATTTGGATGG‑TTTATTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGAAATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAGACTGTAc < 4:535761/145‑1 (MQ=255)
cAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCt > 3:672860/1‑149 (MQ=255)
aTTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGaa < 4:666542/149‑1 (MQ=255)
ttGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCTGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAATTGTACCTGAAc > 1:704846/1‑148 (MQ=255)
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ACTCGTGAACATTGCGATGAGTTGATCAGCATCCCGATGGCTGGAAGCGTTTCTTCCCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATGGAATCCGTTGGCGCTAGCGACGGCGCTGCAAACTGTACCTGAAC > NC_000913/4409890‑4410184
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
