Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F32 I1 R1
|
8 |
94.4 |
3089734 |
95.3% |
2944516 |
148.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
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| RA |
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G→C |
A1077P (GCA→CCA) |
rpoC → |
RNA polymerase, beta prime subunit |
|
| |
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reads |
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| * | NC_000913 | 4,188,578 | 0 | G | C | 100.0%
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/ NA
| 105 | A1077P (GCA→CCA) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
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Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
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|
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ccGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTg < 1:537375/149‑1 (MQ=255)
cGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGCACTGACCGCTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTgc > 1:1363115/1‑148 (MQ=255)
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aaGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGaaa > 1:736655/1‑149 (MQ=255)
aaGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGGCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGaaa < 2:1300914/149‑1 (MQ=255)
aaGTAAGCGGTTTTGTACGATTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACTCGTCAGACCGTCGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGaaa < 2:375785/149‑1 (MQ=255)
aGTAAGCGGTTATGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACGGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGaaaa < 2:1302739/149‑1 (MQ=255)
gTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAAt < 1:1260388/149‑1 (MQ=255)
tAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGAGATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACTAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATc < 2:401609/149‑1 (MQ=255)
tAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATc > 1:1081559/1‑149 (MQ=255)
aaGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCg > 1:509268/1‑149 (MQ=255)
aaGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCg > 1:27831/1‑149 (MQ=255)
gCGTTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCTGACCATTACGGGTCAGACCGACGAACTGTCCGGTCTTTCTTAGCTTGTGGTTCTTGATTGCGCATTACGTACCGCAGGTGGTAAAGATTTGCGTCCGCCACTGAAAATCGtt < 2:838730/149‑1 (MQ=255)
gCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGtt > 1:1542526/1‑149 (MQ=255)
gCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGtt < 1:580913/149‑1 (MQ=255)
gCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGtt < 1:394982/149‑1 (MQ=255)
gCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGtt < 2:1463706/149‑1 (MQ=255)
gCGGTTATGTACGCTTTACTGACATGATCGACTGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGtt < 2:1286159/149‑1 (MQ=255)
ttttGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATg > 1:1167110/1‑149 (MQ=255)
ttttGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATg < 2:631979/149‑1 (MQ=255)
ttttGTACGCTTTACTGACAGGTTCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGGCTGTCTTCGCTGGTGGTGCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATg < 2:1389790/149‑1 (MQ=255)
gtaagatttACTGACTTGATCGACGGCCATACCATTACGCGTCAGTCCGTCGAACTGAGCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCa < 2:330462/143‑1 (MQ=255)
tACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAg < 2:45938/149‑1 (MQ=255)
aCGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAgg < 2:1068346/149‑1 (MQ=255)
aCGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAgg < 1:7013/149‑1 (MQ=255)
tttACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTaa > 1:1485747/1‑149 (MQ=255)
cTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAacgac > 2:948155/1‑149 (MQ=255)
cTGACATGATCAACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAacgac < 1:518997/149‑1 (MQ=255)
aCATGATCGCCGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGACCGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGtt > 2:760155/1‑149 (MQ=255)
aCATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCGGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGtt > 2:1264289/1‑149 (MQ=255)
tCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATc > 1:584457/1‑149 (MQ=255)
ccGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCa < 2:716068/148‑1 (MQ=255)
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aCGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGGCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATccac > 2:777768/1‑147 (MQ=255)
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ccAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGCTGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTa > 2:604045/1‑149 (MQ=255)
ccAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTa > 1:1103589/1‑149 (MQ=255)
ccAGACCAATCCGCCTCACACCGACGAACAGACCGGTCTGTCTTGGCTTGTGGTTCTGGATTCGGCTGAACGTATAGAAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCTCCACTGAATATCGTTGTTGCTAAGGGTAACGACGTTCTGATCCTAGGTa < 2:803615/149‑1 (MQ=255)
cAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTAc > 2:660706/1‑149 (MQ=255)
aCCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGAAGAACGTACCGCATGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATAGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGTTACCGa > 2:134717/1‑149 (MQ=255)
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gACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGt > 2:1299408/1‑149 (MQ=255)
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cTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGTAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAATATCGTTGATGCTCAGGGTATCGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGcc < 2:633275/149‑1 (MQ=255)
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cGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGCTCCCAGGTACCGATATGCCAGCGAAGTACTTCCTGCCGGGTa > 2:681114/1‑149 (MQ=255)
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tctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGAt < 1:1366539/149‑1 (MQ=255)
tctTCGCTGGTGGGTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGAt < 1:961880/149‑1 (MQ=255)
ctTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGAtt < 1:1225983/149‑1 (MQ=255)
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gCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTc < 2:509268/149‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTc < 2:27831/149‑1 (MQ=255)
gCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATAGTTGATGCTCAGTGTAACGACGTTCTGATGCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTc < 2:83084/149‑1 (MQ=255)
tggtggTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAg < 1:604045/149‑1 (MQ=255)
tggtggTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAg > 2:251329/1‑149 (MQ=255)
ggtggtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGc < 1:1053955/149‑1 (MQ=255)
gtTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGa > 1:1303507/1‑149 (MQ=255)
ttCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGaa > 2:82739/1‑149 (MQ=255)
ttCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCg > 1:188389/1‑149 (MQ=255)
ttCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCg < 2:660265/149‑1 (MQ=255)
ttCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCg > 1:641348/1‑149 (MQ=255)
ttCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCg > 1:1194570/1‑149 (MQ=255)
tCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATCGCGt > 2:1443060/1‑149 (MQ=255)
ccGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTa < 2:889690/149‑1 (MQ=255)
gCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACa > 1:793449/1‑149 (MQ=255)
gCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACa > 2:1105265/1‑149 (MQ=255)
cAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCGGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCGGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAg > 1:4209/1‑149 (MQ=255)
cAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAg < 2:863963/149‑1 (MQ=255)
aCGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCa > 1:357272/1‑149 (MQ=255)
aCCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGctc < 1:1299408/149‑1 (MQ=255)
aCCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGctc > 2:474096/1‑149 (MQ=255)
ccGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGctct > 2:789820/1‑149 (MQ=255)
cagCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCAAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACCTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGctct > 2:723879/3‑149 (MQ=255)
cgaaGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACACATATGCCAGCGCAGTACTTCCAGCCGGGTAAAGAGATTGTTCATCTGGATGATGGCGTACAGAAGAGCTCTg > 2:1163541/4‑149 (MQ=255)
cGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTACCGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTg > 2:1098499/1‑149 (MQ=255)
gCAGGTGGTAAAGATCTGCGTACGCCAATGAAAATCGTTGATGCTCAGTGTAACGAAGTTCTTATACCAGGTACAGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTgg < 1:134717/149‑1 (MQ=255)
cAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGt < 2:540644/149‑1 (MQ=255)
cAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGt < 1:760155/149‑1 (MQ=255)
cAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGt < 1:948155/149‑1 (MQ=255)
cAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGt < 1:1146039/149‑1 (MQ=255)
aGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCCGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTg > 1:193709/1‑149 (MQ=255)
aGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTg > 1:240064/1‑149 (MQ=255)
ggtAAACATCTTCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGAAGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGacac < 2:962120/149‑1 (MQ=255)
aaaGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCt > 1:1079388/1‑149 (MQ=255)
aaGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTg > 2:78999/1‑149 (MQ=255)
aGATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGAACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGCTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTCCAGATCAGCTCTGGTGACAACCTgg > 2:197057/1‑149 (MQ=255)
gATCTGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGgc < 2:188389/149‑1 (MQ=255)
tGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGt > 2:1242791/1‑149 (MQ=255)
tGCGTCCGCCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGt > 1:327139/1‑149 (MQ=255)
|
TCACCGAAGTAAGCGGTTTTGTACGCTTTACTGACATGATCGACGGCCAGACCATTACGCGTCAGACCGACGAACTGACCGGTCTGTCTTCGCTGGTGGTTCTGGATTCCGCAGAACGTACCGCAGGTGGTAAAGATCTGCGTCCGGCACTGAAAATCGTTGATGCTCAGGGTAACGACGTTCTGATCCCAGGTACCGATATGCCAGCGCAGTACTTCCTGCCGGGTAAAGCGATTGTTCAGCTGGAAGATGGCGTACAGATCAGCTCTGGTGACACCCTGGCGCGT > NC_000913/4188432‑4188718
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
