Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F50 I2 R1
|
173 |
150.8 |
4954114 |
96.5% |
4780720 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,707,870 |
T→C |
intergenic (‑165/+746) |
dppA ← / ← proK |
dipeptide/heme ABC transporter periplasmic binding protein; dipeptide chemotaxis receptor/tRNA‑Pro |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,707,870 | 0 | T | C | 99.6%
| 998.6
/ ‑4.4
| 276 | intergenic (‑165/+746) | dppA/proK | dipeptide/heme ABC transporter periplasmic binding protein; dipeptide chemotaxis receptor/tRNA‑Pro |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (148/127); total (148/128) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.64e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.88e-01 |
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
GATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACC > NC_000913/3707723‑3708013
|
tgttgtTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACa > 3:508089/1‑150 (MQ=255)
gttTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTg > 3:436682/1‑151 (MQ=255)
ttttAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGt > 4:98701/1‑151 (MQ=255)
ttttAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCAGACATTTTTTGTTTTTTGCCAGGGCGGGTGAACGTTATGCGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCACTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAAttt > 1:1645949/1‑147 (MQ=255)
tttAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTc > 4:307916/1‑151 (MQ=255)
tttAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTc > 4:165877/1‑151 (MQ=255)
tttAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTc > 4:1130266/1‑151 (MQ=255)
ttAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTc > 1:67334/1‑150 (MQ=255)
tAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATACAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCa > 1:1366118/1‑150 (MQ=255)
tAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCa < 1:1847880/150‑1 (MQ=255)
aaCCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCaa > 3:149402/1‑150 (MQ=255)
cccTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAAc > 4:1883088/1‑149 (MQ=255)
ccTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAAc > 4:668658/1‑148 (MQ=255)
cTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGa > 4:647995/1‑150 (MQ=255)
cTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGa > 4:1157481/1‑150 (MQ=255)
ttGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGaa < 1:1144262/149‑1 (MQ=255)
ttGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGaa < 1:47000/149‑1 (MQ=255)
tGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAAtgt > 3:364579/1‑151 (MQ=255)
aGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGa > 3:198274/1‑150 (MQ=255)
ggTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACg > 1:631791/1‑151 (MQ=255)
tGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTc < 1:1256951/150‑1 (MQ=255)
tCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCATGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCa < 1:892565/149‑1 (MQ=255)
cGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAAt > 4:750412/1‑150 (MQ=255)
tGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATAc > 2:277556/1‑149 (MQ=255)
gCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGc > 1:1358082/1‑151 (MQ=255)
ccTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGcc > 4:1463598/1‑151 (MQ=255)
cTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGcc > 4:491845/1‑150 (MQ=255)
gACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCaa < 4:1877019/150‑1 (MQ=255)
gACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCa < 1:1046075/149‑1 (MQ=255)
aCCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAAcc > 1:108404/1‑151 (MQ=255)
ccTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGt < 2:151650/136‑1 (MQ=255)
ccTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCg < 4:1390863/151‑1 (MQ=255)
ccTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCg > 4:1520542/1‑151 (MQ=255)
cTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCgg > 4:982727/1‑151 (MQ=255)
ttttttgttttttgCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCggg > 4:519827/1‑151 (MQ=255)
ttttgttttttgCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGa < 1:1495857/150‑1 (MQ=255)
tttttgCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTacac > 1:449696/1‑151 (MQ=255)
tttttgCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTacac > 4:1148035/1‑151 (MQ=255)
ttttgCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACAcc > 1:523231/1‑151 (MQ=255)
ttgCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCa < 1:1551288/150‑1 (MQ=255)
ttgCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCa > 3:157153/1‑150 (MQ=255)
tgCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAAc > 4:533479/1‑151 (MQ=255)
gCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACg > 1:828166/1‑151 (MQ=255)
ggTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTga < 4:1294028/151‑1 (MQ=255)
ggTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTga < 4:950511/151‑1 (MQ=255)
cGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTgaga > 4:1185021/1‑150 (MQ=255)
cGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTgaga > 4:251842/1‑150 (MQ=255)
gTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACCCCAACGGTGAGAATcc < 1:1392924/151‑1 (MQ=255)
tCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATcc > 2:395344/1‑150 (MQ=255)
aCGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCcacac > 3:333729/1‑151 (MQ=255)
tATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCcacacaca > 1:1340985/1‑150 (MQ=255)
tATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCcacacaca < 4:1054129/150‑1 (MQ=255)
gAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAg < 1:802655/150‑1 (MQ=255)
gAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGa < 4:1324480/151‑1 (MQ=255)
aGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTCACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGAt < 4:325833/151‑1 (MQ=255)
ggTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGAtt < 1:978405/151‑1 (MQ=255)
ggTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGAtt < 3:71587/151‑1 (MQ=255)
ggTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGAt < 1:938835/150‑1 (MQ=255)
gTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTa < 2:122581/151‑1 (MQ=255)
ggATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTaaaaa < 1:987026/151‑1 (MQ=255)
cGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTc < 1:1794387/151‑1 (MQ=255)
cGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTc > 4:1175244/1‑151 (MQ=255)
gTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCa < 4:1626877/151‑1 (MQ=255)
aCTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCaa < 1:921857/150‑1 (MQ=255)
cTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAAc > 1:1773426/1‑151 (MQ=255)
aaTTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAAc < 4:1393019/149‑1 (MQ=255)
aaTTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACa < 2:501507/150‑1 (MQ=255)
aTTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGc < 4:1018695/151‑1 (MQ=255)
aTTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGc < 1:328626/151‑1 (MQ=255)
ttAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCt > 1:1919106/1‑151 (MQ=255)
aaCATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTAt < 1:1434329/151‑1 (MQ=255)
cATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTAttt > 1:1163957/1‑151 (MQ=255)
aTCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTg < 2:230688/151‑1 (MQ=255)
aTCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTg > 1:1199529/1‑151 (MQ=255)
cAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTgca < 4:1835831/151‑1 (MQ=255)
cAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTgc > 4:832381/1‑150 (MQ=255)
aGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTgc > 4:856016/1‑149 (MQ=255)
aaCAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGcagcag > 4:579399/1‑149 (MQ=255)
aaCAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCaga < 2:193746/150‑1 (MQ=255)
aaCAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCaga < 3:260316/150‑1 (MQ=255)
tGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAAtt > 3:486403/1‑151 (MQ=255)
tGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAAtt > 4:736032/1‑151 (MQ=255)
gCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTTCAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAAtt < 4:1830264/150‑1 (MQ=255)
gCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAAttt < 1:745433/151‑1 (MQ=255)
ggATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTtgt > 1:57074/1‑151 (MQ=255)
ggATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTtgt < 4:148886/151‑1 (MQ=255)
ggATCCTCCATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTtgt < 2:67753/151‑1 (MQ=255)
cctccATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGca < 1:1300303/150‑2 (MQ=255)
tccATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACt > 4:1690358/1‑151 (MQ=255)
cATAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTcc < 1:1660860/151‑1 (MQ=255)
aTAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCa < 1:263326/151‑1 (MQ=255)
tAAAATGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCa > 1:1685413/1‑150 (MQ=255)
aaaaTGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCaa < 1:1870524/150‑1 (MQ=255)
aaTGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACAt < 2:325288/151‑1 (MQ=255)
aaTGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACAt < 4:208554/151‑1 (MQ=255)
tGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATg > 4:1226145/1‑150 (MQ=255)
tGCCCCTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATg > 1:1478688/1‑150 (MQ=255)
ccccTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGAcc > 2:449052/1‑151 (MQ=255)
ccTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGAcc > 4:1779061/1‑149 (MQ=255)
ccTCGCGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGAcc > 1:771643/1‑149 (MQ=255)
|
GATGTTTGTTGTTTTAACCCTTTGCAGTGGGTTGTCGCTGCCTGACCTTTTTTGTTTTTTGCCCGGTCGGGTCAACGTTATGAGGTGGGGATGCCGTACTAATTAACATCAGTGTAACAGTGCGGATCCTCCATAAAATGCCCCTCGTGACCTACAATCTGTCAACAGAATGTGAAAACGTCAATACAGCCAACCGGGATTTACACCAACGGTGAGAATCCACACACAAAGATTAAAAAAACTTCAAACAGCTATTTGCAGCAGAGAAATTTGTGCTACTCCAACATGACC > NC_000913/3707723‑3708013
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
