Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
157 |
93.7 |
2947622 |
98.1% |
2891617 |
150.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,460,207 |
T→C |
D53G (GAC→GGC) |
nrdG ← |
anaerobic ribonucleotide reductase activating protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,460,207 | 0 | T | C | 100.0%
| 334.4
/ NA
| 92 | D53G (GAC→GGC) | nrdG | anaerobic ribonucleotide reductase activating protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (51/41); total (51/41) |
CCAGATGTCTTTACCCGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGTCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAGGATAGTACTGAT > NC_000913/4460059‑4460354
|
ccAGATGTCTTTACCCGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCt > 2:881937/1‑151 (MQ=255)
cAGATGTCTTTACCCGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCtt < 2:485235/151‑1 (MQ=255)
aTGTCTTTACCCGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCa < 2:1200442/151‑1 (MQ=255)
gTCTTTACCCGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATGCCCTGGCGTTTGATACGTGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCAt < 1:660364/150‑1 (MQ=255)
tCTTTACCCGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTg > 2:696130/1‑151 (MQ=255)
tCTTTACCCGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCCGGCCTTCCAtt < 2:298996/150‑1 (MQ=255)
ttACCCGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCtt > 2:380769/1‑151 (MQ=255)
ttACCCGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCtt > 2:882456/1‑151 (MQ=255)
tACCCGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCttt > 1:1113655/1‑151 (MQ=255)
aCCCGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCttt < 1:407047/150‑1 (MQ=255)
cccGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTgg < 2:406421/151‑1 (MQ=255)
cGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTa < 1:983222/151‑1 (MQ=255)
ggACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTa > 2:476546/1‑150 (MQ=255)
ggACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTa > 2:28647/1‑150 (MQ=255)
acacTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAAt < 1:791002/151‑1 (MQ=255)
cacTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATg < 1:1204490/151‑1 (MQ=255)
acTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATGTCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATgg < 2:881164/151‑1 (MQ=255)
acTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATgg < 1:473222/151‑1 (MQ=255)
cTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGc > 1:1249932/1‑151 (MQ=255)
cGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCt < 1:109478/150‑1 (MQ=255)
cGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTg > 2:970897/1‑151 (MQ=255)
gcgGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCg < 2:1218095/151‑1 (MQ=255)
cgGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCgg < 1:435074/151‑1 (MQ=255)
aTGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATCCCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAAt < 1:1419347/151‑1 (MQ=255)
aTGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAAt < 2:1147644/151‑1 (MQ=255)
tGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAAtt > 2:594201/1‑151 (MQ=255)
gCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAAttt < 2:1186112/151‑1 (MQ=255)
gCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAAtt < 1:427790/150‑1 (MQ=255)
cGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAAttt > 2:865488/1‑150 (MQ=255)
cGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGA‑GGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTAc < 1:149089/151‑1 (MQ=255)
gTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCg < 2:321161/151‑1 (MQ=255)
gTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGAACGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCg > 2:447207/1‑151 (MQ=255)
aCCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGcc > 2:186256/1‑151 (MQ=255)
ccAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGcc > 2:550936/1‑150 (MQ=255)
gTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGTGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCAtg > 1:1324559/1‑150 (MQ=255)
ttCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGc > 2:41311/1‑151 (MQ=255)
aGAATATCCGGCCCGTTTTGCGGATGCAGCGGAGCGCCGCCGGGGAGGTAAATACCCTGGCGTTGGATACGATTGTCATTCAGATCTTAAAGAATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGAAATTTCCCCGCCAtgtg < 2:847940/147‑1 (MQ=255)
aaTATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATCCCCTGGCGTTTGATACGGGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTg < 2:441105/151‑1 (MQ=255)
aaTATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCtttt < 1:1197007/150‑1 (MQ=255)
atatCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATCCCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGt < 2:206970/151‑1 (MQ=255)
tCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGAAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGtt < 2:1209245/149‑1 (MQ=255)
ccGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATCCCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTta < 1:1261678/149‑1 (MQ=255)
gTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCg > 1:1148027/1‑151 (MQ=255)
ttGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCggg < 1:1036265/150‑1 (MQ=255)
aTGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTc > 1:348365/1‑150 (MQ=255)
tGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTCCCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCa < 1:476601/150‑1 (MQ=255)
aGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTTTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCa < 1:660348/147‑1 (MQ=255)
gATCGCCGCCGGAGAGGGAAATTCCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAaca < 1:285975/149‑1 (MQ=255)
aTCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAacacac > 2:977422/1‑151 (MQ=255)
cgccgGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCgg > 2:235579/1‑150 (MQ=255)
cgccgGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCgg > 1:1052111/1‑150 (MQ=255)
cgccgGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCgg > 1:478958/1‑150 (MQ=255)
cgccgGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCg > 2:386944/1‑149 (MQ=255)
gccgGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCgg > 1:400734/1‑149 (MQ=255)
ccgGAGAGGGAAATCCCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGgaga < 2:1439669/151‑1 (MQ=255)
ccgGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCgg > 1:862499/1‑148 (MQ=255)
cgGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGAc > 2:432283/1‑151 (MQ=255)
aaaTACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGt > 1:623663/1‑151 (MQ=255)
aaTACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTg > 2:1255605/1‑151 (MQ=255)
cccTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTCCCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCa < 2:444133/149‑1 (MQ=255)
cccTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAAc > 2:1334839/1‑151 (MQ=255)
cccTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAAc > 2:1082294/1‑151 (MQ=255)
ccTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACg > 2:352987/1‑151 (MQ=255)
cTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACg > 2:180651/1‑150 (MQ=255)
cTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACg > 2:1293890/1‑150 (MQ=255)
ggCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGt < 1:506611/151‑1 (MQ=255)
cGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGc > 2:221123/1‑151 (MQ=255)
gTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGcc > 1:1141224/1‑151 (MQ=255)
tGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCggg > 1:598218/1‑151 (MQ=255)
aCGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCg > 2:1345045/1‑151 (MQ=255)
gAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGtt < 1:696209/151‑1 (MQ=255)
tgtCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGa < 1:519513/150‑1 (MQ=255)
tgtCATTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGAc > 1:1314874/1‑151 (MQ=255)
aTTCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATg > 1:1386288/1‑151 (MQ=255)
ttCAGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGt > 1:813979/1‑151 (MQ=255)
aGATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGa < 1:380819/151‑1 (MQ=255)
gATCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGa > 2:147613/1‑150 (MQ=255)
tCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGAc > 2:187230/1‑149 (MQ=255)
tCGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACa < 2:1147931/150‑1 (MQ=255)
cGTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAgg > 1:1201728/1‑151 (MQ=255)
gTTAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAgg > 2:482233/1‑150 (MQ=255)
tAATGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAGGAt > 1:120497/1‑150 (MQ=255)
aaTGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAGGATa < 1:778987/150‑1 (MQ=255)
aaTGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAGGATAg < 1:501209/151‑1 (MQ=255)
tGATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAGGATAGt > 2:410548/1‑150 (MQ=255)
gATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAGGATAGTa < 1:28650/150‑1 (MQ=255)
gATCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAGGATAGTAc > 1:539563/1‑151 (MQ=255)
aTCTGGCCTCCCTTTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGAAATTAACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAGGATAGt < 2:1113556/148‑1 (MQ=255)
tCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAGGATAGTACtg > 2:567483/1‑151 (MQ=255)
tCTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAGGATAGTACtg > 1:266108/1‑151 (MQ=255)
cTGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAGGATAGTACtg > 1:1282399/1‑150 (MQ=255)
tGGCCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAGGATAGTACtgat > 1:789667/1‑151 (MQ=255)
|
CCAGATGTCTTTACCCGGACACTCGGCGCGGATGCGTTGTACCAGTTTCAGAATATCCGGCACGTTTTGCGGATGCAGCGGATCGCCGCCGGAGAGGGAAATACCCTGGCGTTTGATACGAGTGTCATTCAGATCGTTAATGATCTGGTCTTCCATTGCTTTGGTAAATGGCTGACCGGAATTTACCCGCCATGTGCTTTTGTTATAGCAACCGGGGCATTCATGAACACACCCGGAGACAAACAGGGTGCAACGAGTGCCGGGGCCGTTGACGATGTCGACAGGATAGTACTGAT > NC_000913/4460059‑4460354
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
