Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F50 I2 R1
|
150 |
68.2 |
2132745 |
98.7% |
2105019 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,337,788 |
A→G |
S48P (TCC→CCC) |
adiY ← |
adi system transcriptional activator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,337,788 | 0 | A | G | 100.0%
| 265.7
/ NA
| 72 | S48P (TCC→CCC) | adiY | adi system transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (32/40); total (32/40) |
CGTCTGGCGTCAGGCATGGCAGGGTGAGTATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGAGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCTGCAAATCCTCATACATG > NC_000913/4337641‑4337934
|
cGTCTGGCGTCAGGCATGGCAGGGTGAGTATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGAc < 1:605914/151‑1 (MQ=255)
tGGCGTCAGGCATGGCAGGGTGAGTATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCg > 2:673482/1‑151 (MQ=255)
ggCGTCAGGCATGGCAGGGTGAGTATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTc < 1:476529/149‑1 (MQ=255)
cAGGCATGGCAGGGTGAGTATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGataata < 1:239542/151‑1 (MQ=255)
cAGGGTGAGTATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTca < 1:117434/151‑1 (MQ=255)
gggTGAGTATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTcaca < 1:962565/151‑1 (MQ=255)
gggTGAGGATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGGGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTca > 2:117345/1‑149 (MQ=255)
ggTGAGTATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTcaca > 1:832519/1‑150 (MQ=255)
gAGTATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAAttt > 2:323062/1‑151 (MQ=255)
gTATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTtaa < 1:795434/151‑1 (MQ=255)
gTATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTtaa < 1:523335/151‑1 (MQ=255)
gcgcTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCatat < 2:393964/151‑1 (MQ=255)
cgcTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATg > 2:979115/1‑151 (MQ=255)
cTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGt > 2:16540/1‑151 (MQ=255)
tACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGtt > 1:348269/1‑151 (MQ=255)
aCGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGtt > 1:857728/1‑150 (MQ=255)
aCGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGt < 2:375409/149‑1 (MQ=255)
aCGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTa < 1:13166/151‑1 (MQ=255)
ttGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCt > 1:586904/1‑151 (MQ=255)
gCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCttt < 1:424147/151‑1 (MQ=255)
gCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCttt > 1:177019/1‑151 (MQ=255)
gCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCtt < 2:466675/150‑1 (MQ=255)
gCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTAAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCttt > 1:291028/1‑151 (MQ=255)
cATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTaa < 2:700577/151‑1 (MQ=255)
aTACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAg < 2:857876/151‑1 (MQ=255)
aTACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAACAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAg < 2:833793/151‑1 (MQ=255)
aCTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAgg < 2:385504/150‑1 (MQ=255)
ggTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCt < 2:860788/149‑1 (MQ=255)
gTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAAt < 2:458722/151‑1 (MQ=255)
aTTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGCGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAAt > 1:51925/1‑149 (MQ=255)
aTTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAg < 2:567143/151‑1 (MQ=255)
tttGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAgg > 2:110542/1‑151 (MQ=255)
ttGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGt > 1:687509/1‑151 (MQ=255)
tGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGtt > 2:706732/1‑151 (MQ=255)
tGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGtt > 1:111874/1‑151 (MQ=255)
gCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGtt < 1:860799/150‑1 (MQ=255)
aTCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTccc > 2:980336/1‑150 (MQ=255)
aTCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTccc > 1:378074/1‑150 (MQ=255)
tCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCAt > 2:280961/1‑151 (MQ=255)
ttATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCa < 1:620675/147‑1 (MQ=255)
ttATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTc < 2:978593/150‑1 (MQ=255)
ttATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTc < 2:626767/150‑1 (MQ=255)
aTTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCAcc < 2:965548/151‑1 (MQ=255)
tCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCt > 1:294211/1‑151 (MQ=255)
cAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCtt < 2:962885/151‑1 (MQ=255)
cAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCt < 1:712554/150‑1 (MQ=255)
gAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGAACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCCCCCttt < 2:1026875/150‑2 (MQ=255)
aaaCCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATc < 1:252177/151‑1 (MQ=255)
aCCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCa < 2:934415/151‑1 (MQ=255)
gTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCt > 2:479681/1‑151 (MQ=255)
cTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTc > 2:768445/1‑151 (MQ=255)
ttGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCttttt < 1:895926/148‑1 (MQ=255)
ttGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCttttt < 2:706080/148‑1 (MQ=255)
gatgatGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTc > 2:716791/1‑151 (MQ=255)
gTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATaaa < 2:581632/151‑1 (MQ=255)
gTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATaa < 2:223931/150‑1 (MQ=255)
cGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATaaaa < 2:1034896/150‑1 (MQ=255)
cGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATaaaa < 2:750407/150‑1 (MQ=255)
aaTATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACaa < 2:581810/151‑1 (MQ=255)
tatGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAgg > 1:855715/1‑151 (MQ=255)
gAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTg > 2:89720/1‑151 (MQ=255)
aaCCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCg > 1:630031/1‑151 (MQ=255)
aCCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGc > 1:665640/1‑151 (MQ=255)
ccAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCt < 1:1017977/151‑1 (MQ=255)
cAAAGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCTg < 1:728645/151‑1 (MQ=255)
aaGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCTGCa < 2:393344/151‑1 (MQ=255)
aGTGTTGTTAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCTGCa > 1:654566/1‑150 (MQ=255)
ttgttAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCTGCAAATcc > 2:578781/1‑151 (MQ=255)
gttAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCTGCAAATCCTc < 2:494984/151‑1 (MQ=255)
tAAGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCTGCAAATCCTCAt > 2:149547/1‑151 (MQ=255)
aaGAGAGGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCTGCAAATCCTCAt > 1:874312/1‑150 (MQ=255)
agagGGGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCTGCAAATCCTCATACAt > 1:739306/1‑151 (MQ=255)
gaggggACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCTGCAAATCCTCATACATg < 2:591693/151‑1 (MQ=255)
gaggggACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCTGCAAATCCTCATACATg > 1:271623/1‑151 (MQ=255)
|
CGTCTGGCGTCAGGCATGGCAGGGTGAGTATGGGCGTAGCGCTACGTTGCCATACTGGTATTTGCGAGAGATCTTTATTCAGAAACCGGAGGTAATCTTTGATGATGTCGTGACTAATATGAGCAACCAAAGTGTTGTTAAGAGAGGAGACGTCGATAATATTATTTTCACAATTTAATAACGCCATATGGTTAGCTTTAAGGCTAATAGGTTCTTTCCCATTCACCCTTATCCAGACATCTTTTTCAGTCAATAAAACAATACAAGGTTGGTCGCTGCAAATCCTCATACATG > NC_000913/4337641‑4337934
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
