Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F50 I1 R1
|
121 |
119.5 |
3777739 |
97.6% |
3687073 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
277,333 |
A→G |
T207A (ACG→GCG) |
mmuM → |
CP4‑6 prophage; S‑methylmethionine:homocysteine methyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 277,333 | 0 | A | G | 100.0%
| 475.3
/ NA
| 124 | T207A (ACG→GCG) | mmuM | CP4‑6 prophage; S‑methylmethionine:homocysteine methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (68/56); total (68/56) |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GCTGGATGCCGGGGCCGATCTGCTGGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTACGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCTGGTGGTGTATCCGAAC > NC_000913/277185‑277479
|
gCTGGATGCCGGGGCCGATCTGCTGGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGcg > 1:44536/1‑151 (MQ=255)
tGGATGCCGGGGCCGATCTGCTGGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGcgcc > 2:832312/1‑151 (MQ=255)
ggATGCCGGGGCCGATCTGCTGGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGcgccg < 4:162930/151‑1 (MQ=255)
ggATGCCGGGGCCGATCTGCTGGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGcgcc < 4:57315/150‑1 (MQ=255)
gATGCCGGGGCCGATCTGCTGGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTGCCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGcgcc < 2:1167427/149‑1 (MQ=255)
cGGGGCCGATCTGCTGGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGt > 3:25454/1‑151 (MQ=255)
ggggCCGATCTGCTGGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGt > 3:120629/1‑150 (MQ=255)
gggCCGATCTGCTGGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGa < 1:167601/151‑1 (MQ=255)
ggCCGATCTGCTGGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGAc > 4:18798/1‑151 (MQ=255)
gctgGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGt < 4:183292/144‑1 (MQ=255)
gctgGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTg < 1:137375/145‑1 (MQ=255)
gctgGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGgttgcg < 4:272508/151‑1 (MQ=255)
gctgGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGgtt < 3:352076/148‑1 (MQ=255)
ggCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGgttgcgttg < 1:254209/151‑1 (MQ=255)
ggCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACAACTGAGCGACGGCGCGCCGCTGCGTGACGTGgttgcgtt < 3:1093566/150‑1 (MQ=255)
ccTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCt > 3:88837/1‑151 (MQ=255)
ccTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCt < 1:25877/151‑1 (MQ=255)
tGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTgg > 2:686604/1‑151 (MQ=255)
cGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCg > 2:455448/1‑151 (MQ=255)
gAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCgg > 4:435753/1‑151 (MQ=255)
gAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCgg > 3:1093355/1‑151 (MQ=255)
gAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCgg < 2:1039191/151‑1 (MQ=255)
aaaCCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCggg > 3:424123/1‑151 (MQ=255)
aaaCCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCggg > 3:282044/1‑151 (MQ=255)
aaCCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCggg > 2:221831/1‑150 (MQ=255)
tGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATcc > 3:111577/1‑151 (MQ=255)
gCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATcc > 2:73916/1‑150 (MQ=255)
ccGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGc < 1:92299/151‑1 (MQ=255)
cGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGc > 2:604994/1‑150 (MQ=255)
gAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAg < 3:397368/151‑1 (MQ=255)
gAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGGTATCCGc > 3:437298/1‑149 (MQ=255)
aaTTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAgg > 2:1046869/1‑151 (MQ=255)
ttttCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAggtg < 3:187735/150‑1 (MQ=255)
ttCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACCCCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAggtggt < 2:509317/150‑1 (MQ=255)
tCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGgtggtg < 4:365134/150‑1 (MQ=255)
ccGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGtggtgg > 3:535579/1‑150 (MQ=255)
cGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAggggg > 3:367164/1‑146 (MQ=255)
agaTTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGgcgc > 3:392979/1‑150 (MQ=255)
gaTTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTa < 3:450546/151‑1 (MQ=255)
gaTTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGGGGTGGCGCt > 1:320985/1‑150 (MQ=255)
ttGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGGGGCGCTa > 3:1361880/1‑149 (MQ=255)
aGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCAt < 3:721179/151‑1 (MQ=255)
cGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGGTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTa > 2:1008307/1‑150 (MQ=255)
tGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGGGGGGGCGCTAGGCATTAACt > 2:361691/1‑150 (MQ=255)
gCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTa < 2:481042/151‑1 (MQ=255)
gCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGGGGTGGCGCTAGGCATTAACTGt > 1:206784/1‑150 (MQ=255)
ccGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGCGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTAt < 2:34379/151‑1 (MQ=255)
gAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCCGGTGGTGGCGCTATGAATTAACTGGAtt > 2:504645/1‑150 (MQ=255)
gAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGATCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGCTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTg > 2:1201213/1‑146 (MQ=255)
gCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTgcg < 2:1259165/151‑1 (MQ=255)
tGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTgcgc > 3:640900/1‑150 (MQ=255)
gTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCt < 1:219401/150‑1 (MQ=255)
gTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGGGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTg > 2:1251326/1‑151 (MQ=255)
gCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAaca < 2:1072252/151‑1 (MQ=255)
atatCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAAcacc > 4:101827/1‑151 (MQ=255)
atCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGGGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAAcaccac > 3:965434/1‑151 (MQ=255)
tCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACaccacc > 2:1187531/1‑151 (MQ=255)
tCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGGGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAAAaccacc > 1:258910/1‑151 (MQ=255)
cgcgTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGc > 4:30878/1‑151 (MQ=255)
gcgTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCt < 3:1042760/151‑1 (MQ=255)
gcgcGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGt < 4:270663/151‑1 (MQ=255)
gcgGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGtt > 2:1272126/1‑150 (MQ=255)
gggCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTgc > 2:823119/1‑150 (MQ=255)
gCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGGGGGGCTAGGCATTAAATGTATTGCGCTGGAAAACACCCCCGGTGCGTTgca > 3:985242/1‑149 (MQ=255)
gTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCAt > 3:662036/1‑151 (MQ=255)
tGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCAtt > 2:249415/1‑151 (MQ=255)
ggTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCAttt < 3:750545/151‑1 (MQ=255)
ggTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCAttt < 1:129673/151‑1 (MQ=255)
ggTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCAttt < 2:55056/151‑1 (MQ=255)
tctcATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTac < 2:282017/150‑1 (MQ=255)
tctcATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGGATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTac > 1:89433/1‑150 (MQ=255)
cATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACg < 2:167061/150‑1 (MQ=255)
aTTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACgg > 2:186089/1‑150 (MQ=255)
tACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGttt > 2:377711/1‑150 (MQ=255)
aCCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGttt < 2:809207/149‑1 (MQ=255)
aCCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTa < 3:815056/150‑1 (MQ=255)
cccTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTaa < 3:686628/150‑1 (MQ=255)
ccTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACg < 3:221856/151‑1 (MQ=255)
tGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACgg > 2:954521/1‑150 (MQ=255)
tGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACgg > 3:589668/1‑150 (MQ=255)
gcgcGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGt < 3:507562/150‑1 (MQ=255)
gcgACAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGtgct < 2:783139/151‑1 (MQ=255)
cAGCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGcc > 3:301737/1‑150 (MQ=255)
gCGAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCt < 4:269047/151‑1 (MQ=255)
gAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCtgg < 4:184441/151‑1 (MQ=255)
gAACACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCtgg > 3:968884/1‑151 (MQ=255)
aaCACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCtggt < 3:926229/151‑1 (MQ=255)
aaCACCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCtggt < 3:361722/151‑1 (MQ=255)
cacCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCtggtgg < 2:88825/151‑1 (MQ=255)
cacCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCtggtgg < 3:515530/151‑1 (MQ=255)
acCTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAAATGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGGTTAACGGTGCTGCCGCtggtgg > 3:1348407/1‑150 (MQ=255)
ccTGAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCTGgtggtg > 2:1199618/1‑151 (MQ=255)
gAGCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCTGGTGGTGTa < 2:648334/150‑1 (MQ=255)
gCGACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCTGGTGGTGTATcc < 4:324622/151‑1 (MQ=255)
gACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCTGGTGGTGTATCCGa < 2:1361811/151‑1 (MQ=255)
gACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCTGGTGGTGTATCCGa < 2:111561/151‑1 (MQ=255)
gACGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGGGGGGGCGCCAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGGAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCTGGTGGTGTATcc > 3:107714/1‑149 (MQ=255)
aCGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCTGGTGGTGTATCCGaa < 2:800211/151‑1 (MQ=255)
aCGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCCAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGGTTAACGGTGCTGCCGCTGGGGGTGTATcc > 3:913733/1‑148 (MQ=255)
cGGTGCGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCTGGTGGTGTATCCGAAc > 2:356099/1‑151 (MQ=255)
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GCTGGATGCCGGGGCCGATCTGCTGGCCTGCGAAACCCTGCCGAATTTTTCCGAGATTGAGGCGTTGGCCGAGCTGTTGACCGCATATCCGCGTGCGCGGGCGTGGTTCTCATTTACCCTGCGCGACAGCGAACACCTGAGCGACGGTACGCCGCTGCGTGACGTGGTTGCGTTGCTGGCGGGTTATCCGCAGGTGGTGGCGCTAGGCATTAACTGTATTGCGCTGGAAAACACCACCGCTGCGTTGCAGCATTTACACGGTTTAACGGTGCTGCCGCTGGTGGTGTATCCGAAC > NC_000913/277185‑277479
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
