Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F50 I1 R1
|
121 |
119.5 |
3777739 |
97.6% |
3687073 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,551,418 |
C→T |
A352A (GCG→GCA) |
malP ← |
maltodextrin phosphorylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,551,418 | 0 | C | T | 99.1%
| 411.3
/ ‑5.4
| 105 | A352A (GCG→GCA) | malP | maltodextrin phosphorylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (54/50); total (54/51) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
TGCACCACCGCCAGTTTGGCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGCGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTATCGTTCAGCTGAAT > NC_000913/3551272‑3551564
|
tGCACCACCGCCAGTTTGGCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATATGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCt < 3:759009/150‑1 (MQ=255)
caccacCGCCAGTTTGGCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCt < 3:952058/151‑1 (MQ=255)
accaccGCCAGTTTGGCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTg > 3:65117/1‑151 (MQ=255)
ccaccGCCAGTTTGGCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTg < 1:467784/150‑1 (MQ=255)
caccGCCAGTTTGGCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTg < 2:1173671/149‑1 (MQ=255)
accGCCAGTTTGGCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGc > 2:41262/1‑150 (MQ=255)
gCCAGTTTGGCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATc > 4:59689/1‑150 (MQ=255)
ccAGTTTGGCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATc > 1:96866/1‑149 (MQ=255)
cAGTTTGGCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAgg > 4:447865/1‑151 (MQ=255)
aGTTTGGCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAggg > 2:1066181/1‑151 (MQ=255)
tGGCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTAt < 1:46941/150‑1 (MQ=255)
ggCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTAtgg > 2:304950/1‑151 (MQ=255)
gCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTAtggt < 2:857949/151‑1 (MQ=255)
ccACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTAtggttg < 3:637686/151‑1 (MQ=255)
cacaCTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTAtggttgg < 2:1188443/151‑1 (MQ=255)
acacTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTAtggttgg > 2:691212/1‑150 (MQ=255)
ttttCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTaa < 2:959922/150‑1 (MQ=255)
tCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCg > 2:339730/1‑150 (MQ=255)
aTCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGaa > 2:1184650/1‑150 (MQ=255)
cGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGt > 3:1360208/1‑151 (MQ=255)
cGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGt < 2:1285360/151‑1 (MQ=255)
gCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGtt > 4:237244/1‑151 (MQ=255)
ccGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTAtggt < 4:27375/132‑1 (MQ=255)
ccGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTAtggt > 1:27375/1‑132 (MQ=255)
ccGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGtttt > 4:307199/1‑151 (MQ=255)
cGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGtttt > 3:972610/1‑150 (MQ=255)
gCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCt > 2:496823/1‑151 (MQ=255)
tctcTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGc > 3:551680/1‑151 (MQ=255)
tctACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGccc > 3:255757/1‑151 (MQ=255)
tctACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGccc > 2:365024/1‑151 (MQ=255)
ctACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGccc > 3:212427/1‑150 (MQ=255)
ctACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGccc > 1:82199/1‑150 (MQ=255)
aCCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCa < 2:958480/149‑1 (MQ=255)
aCCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAgg > 4:283244/1‑151 (MQ=255)
aCCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTGTTGCTGGTAATGGCCCa < 4:263158/149‑1 (MQ=255)
ccAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGc < 3:638615/151‑1 (MQ=255)
ttttAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATc > 3:207142/1‑151 (MQ=255)
ttttAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATc > 3:1260148/1‑151 (MQ=255)
ttAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATcc < 4:209447/150‑1 (MQ=255)
tAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATccc > 3:777324/1‑150 (MQ=255)
tAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATcc > 4:302972/1‑149 (MQ=255)
aaaGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCTCCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAg < 1:1491/151‑1 (MQ=255)
aaaGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATccc > 2:1047687/1‑149 (MQ=255)
aaaGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCa < 4:81280/150‑1 (MQ=255)
aaaGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCa < 2:1056761/150‑1 (MQ=255)
aGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCt < 2:602794/151‑1 (MQ=255)
gCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTc > 2:1206323/1‑151 (MQ=255)
gCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTc < 1:72022/151‑1 (MQ=255)
cGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTc > 4:131030/1‑150 (MQ=255)
gTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCt < 1:126866/151‑1 (MQ=255)
gTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCt < 2:972570/151‑1 (MQ=255)
ttAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTgg > 3:1091036/1‑150 (MQ=255)
tAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTg > 3:1282971/1‑151 (MQ=255)
aTTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCt > 3:1077213/1‑151 (MQ=255)
gTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCg > 2:168912/1‑151 (MQ=255)
gTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCg < 2:661086/151‑1 (MQ=255)
ttAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCg > 2:391266/1‑150 (MQ=255)
taatCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATc > 4:261319/1‑149 (MQ=255)
aatCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCGGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGc > 3:885220/1‑151 (MQ=255)
atCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGc > 1:87188/1‑150 (MQ=255)
atCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGc > 1:322538/1‑150 (MQ=255)
tCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCAc > 3:1293730/1‑151 (MQ=255)
gCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCAcg < 4:477368/149‑1 (MQ=255)
gCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCAc < 1:213000/148‑1 (MQ=255)
gCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCAc < 3:339759/148‑1 (MQ=255)
cATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACgcgc > 4:301221/1‑151 (MQ=255)
aTGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCgca < 3:1184707/151‑1 (MQ=255)
tgtgGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACgcgc > 3:771448/1‑149 (MQ=255)
gtgGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTTGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCgcag < 2:743030/150‑1 (MQ=255)
gtgGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCgcagc > 2:803549/1‑151 (MQ=255)
ggCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCgcagc > 2:223500/1‑149 (MQ=255)
gcgcGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGt < 2:134744/151‑1 (MQ=255)
cgcgGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGtt > 3:961598/1‑151 (MQ=255)
cAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTgg > 3:632968/1‑150 (MQ=255)
gTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAAt < 2:551649/151‑1 (MQ=255)
aaGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATcg > 2:1019639/1‑151 (MQ=255)
aaGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATc < 4:104254/150‑1 (MQ=255)
aGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATcgc > 3:389190/1‑151 (MQ=255)
aGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATcgc < 3:304980/151‑1 (MQ=255)
ttCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATa < 1:269445/150‑1 (MQ=255)
tCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAg < 2:903743/150‑1 (MQ=255)
cACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGtt < 3:747961/151‑1 (MQ=255)
cACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGt < 3:1018609/150‑1 (MQ=255)
ccAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTtg < 4:400/150‑1 (MQ=255)
cAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTtggg < 2:1021521/151‑1 (MQ=255)
aGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTtgggt < 3:1019683/151‑1 (MQ=255)
tCACATCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTtgggtggg > 3:635193/1‑150 (MQ=255)
cacaTCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTgggtgggt > 3:59064/1‑150 (MQ=255)
cacaTCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTa < 4:76116/151‑1 (MQ=255)
caTCCCAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTATc < 2:771413/151‑1 (MQ=255)
cccAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTATCGt < 2:255730/150‑1 (MQ=255)
cccAGCGTTCCAGCGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGAAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTATCGtt < 1:193036/151‑1 (MQ=255)
ccAGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTATCGTTc < 4:70151/151‑1 (MQ=255)
aGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTATCGTTCAg < 4:291176/151‑1 (MQ=255)
aGCGTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTATCGTTCAg < 2:1260083/151‑1 (MQ=255)
gTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTATCGTTCAGCTg < 1:205091/151‑1 (MQ=255)
gTTCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTATCGTTCAGCTg > 1:170047/1‑151 (MQ=255)
ttCCAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTATCGTTCAGCTg > 2:524129/1‑150 (MQ=255)
ccAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTATCGTTCAGCTGAAt < 2:635167/151‑1 (MQ=255)
ccAGTGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTATCGTTCAGCTGAAt > 2:170575/1‑151 (MQ=255)
|
TGCACCACCGCCAGTTTGGCCCACACTTTTTCATCGCCCGGCCAGGTTTTCTCTACCAGCGTTTTAAAGCGAGTATTAATTTCGTTAATAATCTGCATGTGGCGCGGCAGTAAGCCTTTCACCAGTTTCACATCCCAGCGTTCCAGCGCTTCTGGCATCAGGGTATGGTTGGTGTAAGCGAAAGTTTTGCTGGTAATGGCCCAGGCGTCATCCCAGCTCATCTGGTGCTCATCGATCAGCACGCGCAGCAGTTCTGGAATCGCGATAGTTGGGTGGGTATCGTTCAGCTGAAT > NC_000913/3551272‑3551564
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
