Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I3 R1
|
160 |
117.2 |
4331776 |
85.4% |
3699336 |
149.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,111,899 |
A→G |
D346G (GAT→GGT) |
opgH → |
OPG biosynthetic ACP‑dependent transmembrane UDP‑glucose beta‑1,2 glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,111,899 | 0 | A | G | 100.0%
| 427.2
/ NA
| 113 | D346G (GAT→GGT) | opgH | OPG biosynthetic ACP‑dependent transmembrane UDP‑glucose beta‑1,2 glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (56/57); total (56/57) |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
AAGCCTGGATGGAGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGC > NC_000913/1111752‑1112044
|
aaGCCTGGATGGCGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGCAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTg > 2:426249/1‑150 (MQ=255)
aGCCTGGATGGAGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCt > 4:240550/1‑151 (MQ=255)
aGCCTGGATGGAGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCt < 2:715144/151‑1 (MQ=255)
gCCTGGATGGAGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCta < 2:442826/151‑2 (MQ=255)
gCCTGGATGGAGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGCCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGTTGGGTGCTg > 2:713563/1‑151 (MQ=255)
ccTGGATGGAGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTggtgctgggtgctg > 2:1267130/1‑150 (MQ=255)
ggatggaGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGAc < 4:819828/149‑1 (MQ=255)
ggatggaGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTc < 2:618881/151‑1 (MQ=255)
ggatggaGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTc < 2:1303083/151‑1 (MQ=255)
gatggaGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCg > 4:491404/1‑151 (MQ=255)
ggaGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGt < 2:43774/150‑1 (MQ=255)
aGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAAt < 2:1513922/151‑1 (MQ=255)
aGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAAt < 3:212460/151‑1 (MQ=255)
cTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATg > 2:379101/1‑150 (MQ=255)
tGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGAt > 1:81006/1‑151 (MQ=255)
aaGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGAttg > 4:739278/1‑151 (MQ=255)
ggTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGAttgtttgt < 4:1371475/151‑1 (MQ=255)
cGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCggg < 4:282050/151‑1 (MQ=255)
aaGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCt < 4:1633191/151‑1 (MQ=255)
aGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTg > 3:443420/1‑151 (MQ=255)
aGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTg > 1:290962/1‑151 (MQ=255)
ggTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTgg > 4:1466345/1‑151 (MQ=255)
gTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGt < 2:354754/151‑1 (MQ=255)
tCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTg > 2:764984/1‑151 (MQ=255)
tCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTg > 4:345299/1‑151 (MQ=255)
aGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTgcg < 1:406473/151‑1 (MQ=255)
gATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTgcgc > 3:190711/1‑151 (MQ=255)
tttCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTTGGTGCTGACTCGGTAATGTCCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCt < 4:66213/150‑1 (MQ=255)
tttCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCt < 4:905746/150‑1 (MQ=255)
ttCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTg > 4:291818/1‑150 (MQ=255)
tCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGa < 2:306314/150‑1 (MQ=255)
tATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCGGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATgg > 2:1453161/1‑151 (MQ=255)
tATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATgg > 2:1278426/1‑151 (MQ=255)
aTCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATgg > 4:1207448/1‑150 (MQ=255)
aTCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATgg < 4:344514/150‑1 (MQ=255)
aTCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATg < 4:941891/149‑1 (MQ=255)
aTCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATg < 2:239079/149‑1 (MQ=255)
tCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGa > 4:1490645/1‑150 (MQ=255)
gccgccgccGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGc > 1:115497/1‑151 (MQ=255)
ccgccgccgTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGcc < 2:1176649/151‑1 (MQ=255)
gccgccgTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCa > 2:14635/1‑150 (MQ=255)
ccgccgTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAAc > 4:1206362/1‑151 (MQ=255)
ccgccgTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAAc < 4:1065627/151‑1 (MQ=255)
cgccgcGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAAc < 2:994569/150‑1 (MQ=255)
cgccgcGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAAc < 2:1673603/150‑1 (MQ=255)
gccgcGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACg < 2:240167/150‑1 (MQ=255)
ccgcGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGcc > 4:1031567/1‑151 (MQ=255)
cgcgTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCg < 3:374129/151‑1 (MQ=255)
cgTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCggg < 2:1562918/151‑1 (MQ=255)
tGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGAt > 2:583539/1‑151 (MQ=255)
tGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGAt > 4:1666429/1‑151 (MQ=255)
gAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGAt < 3:476078/150‑1 (MQ=255)
aaGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCa < 4:593924/151‑1 (MQ=255)
cGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTc > 4:1086540/1‑151 (MQ=255)
cGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTc > 2:27607/1‑151 (MQ=255)
gTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGAttgtt > 3:218609/1‑99 (MQ=255)
gTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGAttgtt < 1:218594/99‑1 (MQ=255)
aaaaGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAgt > 4:940149/1‑151 (MQ=255)
aaGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAgtcg > 2:36335/1‑151 (MQ=255)
gCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAgtcgtc < 4:1078378/151‑1 (MQ=255)
cGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGtcgtcg < 2:105974/151‑1 (MQ=255)
atatCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGaa < 4:584348/151‑1 (MQ=255)
tatCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGATCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGaa > 4:1448075/1‑150 (MQ=255)
tatCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGaa > 1:106915/1‑150 (MQ=255)
tatCGATGACTTCTGCCGTCGCGGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGaa > 2:1296573/1‑150 (MQ=255)
atCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAg < 2:662671/151‑1 (MQ=255)
atCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAg < 4:541498/151‑1 (MQ=255)
cGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGc < 4:1656831/150‑1 (MQ=255)
cGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCg < 1:462979/151‑1 (MQ=255)
cGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCg > 4:574766/1‑151 (MQ=255)
tGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTcc > 4:1316428/1‑151 (MQ=255)
gACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCg < 4:6208/151‑1 (MQ=255)
cTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGt > 3:165858/1‑151 (MQ=255)
ttCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGt > 4:1554884/1‑150 (MQ=255)
cTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATg > 4:1559138/1‑151 (MQ=255)
gCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATgg > 4:341035/1‑150 (MQ=255)
gCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATg < 4:844348/149‑1 (MQ=255)
gTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATAc > 4:108144/1‑151 (MQ=255)
tCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACg > 3:209033/1‑151 (MQ=255)
cGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACg < 3:427611/150‑1 (MQ=255)
tGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGt > 4:103830/1‑151 (MQ=255)
tGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGt > 4:1120396/1‑151 (MQ=255)
tGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGt > 2:1652157/1‑151 (MQ=255)
ggggCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGt < 4:165838/150‑1 (MQ=255)
ggggCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTa < 1:390666/151‑1 (MQ=255)
ggggCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTa < 2:564791/151‑1 (MQ=255)
aGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATgcgc > 4:858223/1‑151 (MQ=255)
aGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATgcgc > 3:116464/1‑151 (MQ=255)
cAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCt < 2:738289/151‑1 (MQ=255)
aGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTg > 3:441416/1‑151 (MQ=255)
aGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTg < 2:127007/151‑1 (MQ=255)
gTACAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGt > 2:893683/1‑151 (MQ=255)
cAGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTcag < 3:149592/151‑1 (MQ=255)
aGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTcagc < 3:88971/151‑1 (MQ=255)
aGCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGCATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTcagc > 2:1529424/1‑151 (MQ=255)
gCTACATGGTGGTGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTcagca < 3:81010/151‑1 (MQ=255)
ggtggtGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTcgcg < 2:616072/151‑1 (MQ=255)
ggtggtGCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTcgc < 3:409751/150‑1 (MQ=255)
gtgCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGAccc > 4:1636175/1‑151 (MQ=255)
gCTGGGTGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCcgc < 4:205197/151‑1 (MQ=255)
|
AAGCCTGGATGGAGCTTATCGCTGAAGTCGGTGGCGAAGGTCAGATTTTCTATCGCCGCCGCCGTCGCCGCGTGAAGCGTAAAAGCGGTAATATCGATGACTTCTGCCGTCGCTGGGGCAGCCAGTACAGCTACATGGTGGTGCTGGATGCTGACTCGGTAATGACCGGTGATTGTTTGTGCGGGCTGGTGCGCCTGATGGAAGCCAACCCGAACGCCGGGATCATTCAGTCGTCGCCGAAAGCGTCCGGTATGGATACGCTGTATGCGCGCTGTCAGCAGTTCGCGACCCGC > NC_000913/1111752‑1112044
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
