Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I3 R1
|
160 |
117.2 |
4331776 |
85.4% |
3699336 |
149.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,340,559 |
C→A |
T95T (ACC→ACA) |
yrbG → |
putative calcium/sodium:proton antiporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,340,559 | 0 | C | A | 99.2%
| 520.5
/ ‑4.2
| 134 | T95T (ACC→ACA) | yrbG | putative calcium/sodium:proton antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (68/65); total (69/65) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
GTATTGGTACATCGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTT > NC_000913/3340411‑3340706
|
gTATTGGTACATCGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGt < 4:811152/151‑1 (MQ=255)
aTTGGTACATCGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTcc < 3:24687/151‑1 (MQ=255)
ttGGTACATCGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTcc > 2:265477/1‑150 (MQ=255)
ggTACATCGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCAt < 4:1335968/150‑1 (MQ=255)
aCATCGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCt < 3:63000/150‑1 (MQ=255)
aCATCGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTg < 4:20982/151‑1 (MQ=255)
aTCGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCt < 2:1093089/148‑1 (MQ=255)
cGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATg < 3:150697/150‑1 (MQ=255)
tACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCt > 2:909994/1‑151 (MQ=255)
ccAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTAc > 4:1557828/1‑151 (MQ=255)
cAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACg < 2:1535782/151‑1 (MQ=255)
aGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGc > 3:146958/1‑151 (MQ=255)
aGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGc > 4:358230/1‑151 (MQ=255)
gAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGcc > 2:4972/1‑151 (MQ=255)
gAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGc < 4:1090571/150‑1 (MQ=255)
aTCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAAt > 1:455212/1‑151 (MQ=255)
cGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAAtt > 2:71818/1‑150 (MQ=255)
gTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTAc > 4:1545643/1‑151 (MQ=255)
ctcGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTAccc > 3:100667/1‑151 (MQ=255)
cGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCtt < 4:138894/151‑1 (MQ=255)
cTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTa > 2:1526916/1‑150 (MQ=255)
ttGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAAt > 2:1131452/1‑151 (MQ=255)
tGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAAtg > 4:1333813/1‑151 (MQ=255)
tGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAAt < 2:1002854/150‑1 (MQ=255)
gCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAAtg < 2:432432/150‑1 (MQ=255)
ccGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAAtgtt > 3:453757/1‑151 (MQ=255)
cgcgTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAAtgttg > 1:94474/1‑151 (MQ=255)
gcgTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAAtgttgt > 2:517947/1‑151 (MQ=255)
tctGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTc > 2:40630/1‑151 (MQ=255)
gCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGc < 4:592857/151‑1 (MQ=255)
aacaacGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCgtggt < 2:661991/151‑1 (MQ=255)
acGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGcc < 2:63175/151‑1 (MQ=255)
gcgATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCgg < 1:100653/151‑1 (MQ=255)
cgATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGt < 1:427361/151‑1 (MQ=255)
tttAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTcc > 2:1185598/1‑151 (MQ=255)
tAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGt > 3:205907/1‑151 (MQ=255)
ccGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTAct < 4:750041/151‑1 (MQ=255)
gTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTActct < 2:716758/151‑1 (MQ=255)
gTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTActct > 4:680324/1‑151 (MQ=255)
ggTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGTCGGTTCCGTACTCTATg > 4:1485447/1‑151 (MQ=255)
ggTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTAt < 4:865463/150‑1 (MQ=255)
gTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATg > 4:1249199/1‑150 (MQ=255)
cAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACgg < 3:94488/151‑1 (MQ=255)
gCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGAc > 3:265309/1‑151 (MQ=255)
cTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAAc > 4:346595/1‑151 (MQ=255)
cGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACt < 4:1323536/150‑1 (MQ=255)
ggCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACtt > 4:461627/1‑150 (MQ=255)
ggCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTa < 4:577723/151‑1 (MQ=255)
gCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTAAGACGGACAACTTAg < 4:1280267/151‑1 (MQ=255)
cAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTc < 4:803975/150‑1 (MQ=255)
aaCATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGc > 4:787082/1‑150 (MQ=255)
aaCATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCa < 4:720105/151‑1 (MQ=255)
aCATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGc > 4:328527/1‑149 (MQ=255)
aCATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAg < 4:1401113/151‑1 (MQ=255)
aCATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAg < 2:1092803/151‑1 (MQ=255)
cATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCGGc < 4:1220089/151‑1 (MQ=255)
cATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGc > 2:1044188/1‑151 (MQ=255)
ttATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCg > 4:478430/1‑150 (MQ=255)
ttATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCg > 1:107712/1‑150 (MQ=255)
tATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGAt > 1:72706/1‑151 (MQ=255)
tCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATgg > 1:223831/1‑151 (MQ=255)
tCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATgg > 2:649362/1‑151 (MQ=255)
tCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATg < 2:1035944/150‑1 (MQ=255)
atatatTGCTGATCCTCGGTCGGGCTGCGGGGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGACgg > 1:19070/1‑148 (MQ=255)
tatatTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATc > 4:700228/1‑151 (MQ=255)
tatTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCtt > 2:735053/1‑151 (MQ=255)
tatTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCtt > 2:1258274/1‑151 (MQ=255)
tatTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCt < 2:460978/150‑1 (MQ=255)
atTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCttt > 2:1617423/1‑151 (MQ=255)
tGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTtct > 4:269388/1‑151 (MQ=255)
tGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTtc < 4:40709/150‑1 (MQ=255)
gATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTctcctc > 4:1365903/1‑151 (MQ=255)
gATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTctcctc > 2:437293/1‑151 (MQ=255)
gATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTctcct < 4:1050874/150‑1 (MQ=255)
gATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTctcc < 4:545313/149‑1 (MQ=255)
aTCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCctct > 4:749328/1‑151 (MQ=255)
aTCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCctct < 2:1555903/151‑1 (MQ=255)
tCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCtt > 4:15225/1‑151 (MQ=255)
tCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCtt > 4:1677070/1‑151 (MQ=255)
ccTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCttt < 4:1140254/151‑1 (MQ=255)
ccTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCttt < 2:211656/151‑1 (MQ=255)
ccTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCtt < 2:1644726/150‑1 (MQ=255)
tCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCt > 2:133954/1‑151 (MQ=255)
cGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTg > 1:135502/1‑151 (MQ=255)
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tCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCt > 4:1209129/1‑151 (MQ=255)
tGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCtgt > 2:291306/1‑151 (MQ=255)
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gCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGc < 2:1419346/151‑1 (MQ=255)
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tCCTTTTACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTc > 4:747251/1‑151 (MQ=255)
ttttACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCAtt > 1:60769/1‑151 (MQ=255)
tACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGtt > 1:244937/1‑151 (MQ=255)
tACAGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGt < 2:1188792/150‑1 (MQ=255)
|
GTATTGGTACATCGTTACCAGAAGTCATCGTCTCGCTTGCCGCGTCTCTGCACGAACAACGCGATTTAGCCGTTGGTACAGCCCTCGGCTCAAACATTATCAATATATTGCTGATCCTCGGTCTGGCTGCGCTGGTTCGTCCTTTTACCGTCCATTCTGATGTTCTACGCCGTGAATTACCCTTAATGTTGTTGGTCAGCGTGGTGGCCGGTTCCGTACTCTATGACGGACAACTTAGTCGCAGCGATGGTATCTTTCTCCTCTTTCTGGCTGTGCTATGGCTGCTGTTCATTGTT > NC_000913/3340411‑3340706
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
