Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I3 R1
|
160 |
117.2 |
4331776 |
85.4% |
3699336 |
149.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,616,605 |
G→A |
A142T (GCC→ACC) |
nikC → |
nickel ABC transporter permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,616,605 | 0 | G | A | 100.0%
| 422.6
/ NA
| 112 | A142T (GCC→ACC) | nikC | nickel ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (58/54); total (58/54) |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTT > NC_000913/3616460‑3616752
|
cggcAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCt > 4:1293771/1‑150 (MQ=255)
cggcAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCt > 4:222939/1‑150 (MQ=255)
ggcAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGt < 4:1095142/151‑1 (MQ=255)
gcAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTc < 4:929191/151‑1 (MQ=255)
gcCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCAc < 2:1016272/150‑1 (MQ=255)
gcCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAAAGCAATTATCGCCATCACCCTGTCGCAc > 4:1404079/1‑150 (MQ=255)
cGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTgg > 3:328825/1‑151 (MQ=255)
gggTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTggg > 4:1419840/1‑151 (MQ=255)
ggTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTggg > 4:181744/1‑150 (MQ=255)
tGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTa < 1:143011/150‑1 (MQ=255)
ggcgggcgCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTAt < 2:1521884/150‑1 (MQ=255)
ggcgggcgCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATg > 4:423711/1‑151 (MQ=255)
gggcgCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCAc > 1:55533/1‑151 (MQ=255)
gcgTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGCCCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCa < 4:808361/150‑1 (MQ=255)
gTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATgg < 4:806530/151‑1 (MQ=255)
tgctCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTg > 2:1345015/4‑151 (MQ=255)
tGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTg > 4:285449/1‑151 (MQ=255)
gATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTgc < 2:800368/151‑1 (MQ=255)
gATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTg < 2:82640/150‑1 (MQ=255)
cAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCa < 1:182803/151‑1 (MQ=255)
cAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCa < 2:47524/151‑1 (MQ=255)
gCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGcc > 1:206035/1‑151 (MQ=255)
ccaccaTGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGcca < 1:80043/151‑2 (MQ=255)
caccaTGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTg < 2:68380/151‑1 (MQ=255)
ccaTGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTgg < 2:380320/150‑1 (MQ=255)
aTGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTg > 2:715417/1‑150 (MQ=255)
aTGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTg > 2:1123176/1‑150 (MQ=255)
tGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGAt > 3:118100/1‑151 (MQ=255)
tGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGAt > 2:125813/1‑151 (MQ=255)
cgcgTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGAttt > 2:1396111/1‑151 (MQ=255)
gTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCAc > 4:701318/1‑151 (MQ=255)
tCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACt > 4:43942/1‑151 (MQ=255)
cGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTa < 2:459404/151‑1 (MQ=255)
gCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTa > 4:1669175/1‑150 (MQ=255)
gCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTAc < 2:1508416/151‑1 (MQ=255)
gCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTAc < 2:764912/151‑1 (MQ=255)
ccGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACg < 4:1151857/151‑1 (MQ=255)
ccGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACg < 2:1110254/151‑1 (MQ=255)
cGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGc > 2:326059/1‑151 (MQ=255)
gATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGcc > 4:902307/1‑151 (MQ=255)
atatGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGcc > 2:738145/1‑150 (MQ=255)
gTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAAcgc > 3:229977/1‑151 (MQ=255)
gTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAAcg < 4:1351811/150‑1 (MQ=255)
tttATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAAcgcg > 2:1582492/1‑151 (MQ=255)
aTGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGt < 2:869951/151‑1 (MQ=255)
aTGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGt < 4:519100/151‑1 (MQ=255)
gACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGttt < 4:1312195/151‑1 (MQ=255)
aCCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTtg > 3:176318/1‑151 (MQ=255)
ccTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTtgt > 4:1261454/1‑151 (MQ=255)
cTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTtgtg > 2:433568/1‑151 (MQ=255)
tCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGc < 4:841512/150‑1 (MQ=255)
cccGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTg > 1:167278/1‑151 (MQ=255)
cGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGc > 2:1387370/1‑151 (MQ=255)
gACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCg > 3:411898/1‑151 (MQ=255)
gACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCg < 1:161027/151‑1 (MQ=255)
gACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCg > 2:648928/1‑151 (MQ=255)
aCCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGt < 3:335996/151‑1 (MQ=255)
aCCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGt > 4:941715/1‑151 (MQ=255)
ccTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTc < 4:972060/151‑1 (MQ=255)
cTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTc > 4:303986/1‑150 (MQ=255)
gATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACgg > 2:504406/1‑151 (MQ=255)
tGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTc > 1:177364/1‑151 (MQ=255)
gTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCttta < 2:611228/150‑2 (MQ=255)
gTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTcc > 4:900930/1‑151 (MQ=255)
gTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTcc > 4:1183445/1‑151 (MQ=255)
gTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGt < 2:287426/151‑1 (MQ=255)
tCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTg < 3:173811/150‑1 (MQ=255)
tttATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCgg > 1:66959/1‑151 (MQ=255)
tttATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCgg > 2:1142217/1‑151 (MQ=255)
tATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGc > 4:933318/1‑151 (MQ=255)
aTGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGcc > 4:1304734/1‑151 (MQ=255)
ggTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCAt < 2:854189/151‑1 (MQ=255)
gTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCAtg > 2:834917/1‑151 (MQ=255)
gTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCAtg < 2:432059/151‑1 (MQ=255)
tGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCAtgt < 4:1259003/150‑1 (MQ=255)
gTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCggg > 3:324898/1‑151 (MQ=255)
tCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGtt > 4:1040487/1‑151 (MQ=255)
ggCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCa > 3:440619/1‑137 (MQ=255)
ggCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCa < 1:440600/137‑1 (MQ=255)
gCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGt < 2:424549/151‑1 (MQ=255)
gCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGt > 4:431570/1‑151 (MQ=255)
aCCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCg < 4:346503/151‑1 (MQ=255)
aCCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCg < 1:404626/151‑1 (MQ=255)
ccGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGa < 1:324881/151‑1 (MQ=255)
cGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGat < 1:389340/151‑1 (MQ=255)
gACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCt < 2:585244/150‑1 (MQ=255)
gACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTg < 1:234941/151‑1 (MQ=255)
gACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTg > 3:220220/1‑151 (MQ=255)
gACCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTg > 4:5670/1‑151 (MQ=255)
aCCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTgg < 4:828729/151‑1 (MQ=255)
aCCAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTgg < 2:148077/151‑1 (MQ=255)
ccAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGc > 2:147951/1‑151 (MQ=255)
cAACGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCa < 4:426006/151‑1 (MQ=255)
aaCGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAg < 4:925699/151‑1 (MQ=255)
aaCGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAg < 4:129191/151‑1 (MQ=255)
aCGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAgg < 4:836019/151‑1 (MQ=255)
aCGTAATTATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAgg > 3:74071/1‑151 (MQ=255)
ttATCGCCATCACCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCgg > 2:781004/1‑150 (MQ=255)
gccatcaccCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATcc > 2:670967/1‑151 (MQ=255)
atcaccCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCtt > 4:883807/1‑151 (MQ=255)
|
CGGCAGCGCCGGGTTGATTGGCGGGCGCGTTGATCAGGCCACCATGCGCGTCGCCGATATGTTTATGACCTTCCCGACCTCGATTCTGTCGTTCTTTATGGTTGGCGTGCTCGGCACCGGGCTGACCAACGTAATTATCGCCATCGCCCTGTCGCACTGGGCGTGGTATGCACGCATGGTGCGCAGCCTGGTGATTTCACTACGCCAACGCGAGTTTGTGCTGGCGTCACGGCTTTCCGGTGCGGGCCATGTGCGGGTGTTTGTCGATCATCTGGCAGGCGCGGTGATCCCTT > NC_000913/3616460‑3616752
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
