Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I3 R1
|
160 |
117.2 |
4331776 |
85.4% |
3699336 |
149.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,655,517 |
A→G |
V129A (GTG→GCG) |
yhiD ← |
putative Mg(2+) transport ATPase, inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,655,517 | 0 | A | G | 99.5%
| 769.4
/ ‑4.3
| 206 | V129A (GTG→GCG) | yhiD | putative Mg(2+) transport ATPase, inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (112/93); total (113/93) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.01e-01 |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
ATTTTCCTGCAACGAAACTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCACCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTACGAACGAGAATGTTACCTGCACCG > NC_000913/3655369‑3655663
|
aTTTTCCTGCAACGAAACTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGcc > 2:674305/1‑151 (MQ=255)
aTTTTCCTGCAACGAAACTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGcc > 4:406339/1‑151 (MQ=255)
ttCCTGCAACGAAACTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCcaac > 3:110087/1‑151 (MQ=255)
ccTGCAACGAAACTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCcaacaa < 1:323171/151‑1 (MQ=255)
ccTGCAACGAAACTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCcaaca > 4:262226/1‑150 (MQ=255)
gCAACGAAACTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGt < 4:1060231/151‑1 (MQ=255)
gCAACGAAACTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGt < 4:494934/151‑1 (MQ=255)
aaCGAAACTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGtca < 4:1214218/151‑1 (MQ=255)
cGAAACTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGtcatc > 4:1550047/1‑151 (MQ=255)
aaCTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGtcatca < 4:431006/149‑1 (MQ=255)
aCTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTg < 1:375347/151‑1 (MQ=255)
aCTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTg < 2:370123/151‑1 (MQ=255)
cTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTg > 2:188841/1‑150 (MQ=255)
tAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGa > 2:1076212/1‑150 (MQ=255)
aaaTCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGaa < 1:472014/150‑1 (MQ=255)
aaTCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAAcc > 4:374770/1‑151 (MQ=255)
aaTCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAAcc > 2:83203/1‑151 (MQ=255)
cAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCAt < 2:751444/150‑1 (MQ=255)
cAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATa < 2:1528140/151‑1 (MQ=255)
aTTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATAccc > 4:537295/1‑150 (MQ=255)
ttttttGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATAccc > 4:606664/1‑149 (MQ=255)
ttttttGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATAccc > 4:457082/1‑149 (MQ=255)
ttttGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGt < 3:140482/150‑1 (MQ=255)
ttGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCg > 2:1506658/1‑151 (MQ=255)
ttGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCg > 2:710890/1‑151 (MQ=255)
gctgctTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGt > 4:1627663/1‑150 (MQ=255)
ctgctTAAACCAGTCGCGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGtt > 4:268919/1‑146 (MQ=255)
ctgctTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGGCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATGCCCAGtt < 2:268488/146‑1 (MQ=255)
tgctTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTAc > 2:63629/1‑150 (MQ=255)
ctTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACAt > 2:1312661/1‑150 (MQ=255)
ctTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGATCGTACa > 4:901860/1‑149 (MQ=255)
aaaCCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCg > 4:1446404/1‑151 (MQ=255)
aaaCCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCg < 4:1033710/151‑1 (MQ=255)
aaaCCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCg > 1:121496/1‑151 (MQ=255)
aaaCCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCg < 2:1438163/151‑1 (MQ=255)
aaCCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGc > 4:131167/1‑151 (MQ=255)
aaCCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGc > 4:1235069/1‑151 (MQ=255)
aCCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCt > 3:472002/1‑151 (MQ=255)
aCCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCt > 1:264469/1‑151 (MQ=255)
ccAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTg < 4:1389116/151‑1 (MQ=255)
cAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGc < 2:456435/151‑1 (MQ=255)
cAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGc > 4:347537/1‑151 (MQ=255)
cGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCaa < 3:42792/150‑1 (MQ=255)
cGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAAt > 2:774565/1‑151 (MQ=255)
cATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAAcc < 4:1660650/151‑1 (MQ=255)
cATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAAcc > 2:969197/1‑151 (MQ=255)
aTTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAAcc > 3:220662/1‑150 (MQ=255)
aTTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCa < 2:1623199/151‑1 (MQ=255)
ttGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCAt > 1:310815/1‑151 (MQ=255)
cGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATg < 2:39578/151‑1 (MQ=255)
gTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATgg > 2:572080/1‑151 (MQ=255)
aTTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATggcg < 2:55332/151‑1 (MQ=255)
aTTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATggcg > 4:1471158/1‑151 (MQ=255)
tACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATggcggc > 4:1413010/1‑151 (MQ=255)
tACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATggcggc > 4:737158/1‑151 (MQ=255)
tACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATggcgg < 4:1653619/150‑1 (MQ=255)
cGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGt > 2:436409/1‑151 (MQ=255)
gTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTc < 4:641228/151‑1 (MQ=255)
tAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCAccc > 4:51213/1‑149 (MQ=255)
aTGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGat < 1:414579/151‑1 (MQ=255)
tGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGat > 1:142187/1‑150 (MQ=255)
gTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGatat < 4:189152/151‑1 (MQ=255)
tCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATc > 1:36289/1‑151 (MQ=255)
cAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATcc < 2:1401180/151‑1 (MQ=255)
cAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATc < 2:1594933/150‑1 (MQ=255)
cAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATc < 3:310832/150‑1 (MQ=255)
cTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCt > 4:572361/1‑151 (MQ=255)
cTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCt > 4:812774/1‑151 (MQ=255)
tGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTg > 3:94424/1‑151 (MQ=255)
gTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTg < 3:250523/150‑1 (MQ=255)
aaTGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCcgt > 1:199220/1‑151 (MQ=255)
ggTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCcgtcg < 2:845720/150‑1 (MQ=255)
ggTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCcgtcg < 2:907494/150‑1 (MQ=255)
ggTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCcgtca < 2:1284755/150‑2 (MQ=255)
aTTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCgtcgtc > 2:1203270/1‑148 (MQ=255)
aTTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGa < 1:52558/151‑1 (MQ=255)
tcatcaGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCTAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATACGCTGCCGTCATCTGCGCTACaa > 2:475188/1‑150 (MQ=255)
tcatcaGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACaa < 2:1555291/150‑1 (MQ=255)
tcatcaGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAat > 3:452248/1‑151 (MQ=255)
catcaGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAat < 3:106138/150‑1 (MQ=255)
gCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTgg < 2:1167106/151‑1 (MQ=255)
cGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGt > 2:106891/1‑151 (MQ=255)
cGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGt < 2:265231/151‑1 (MQ=255)
cGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGt < 4:1117799/151‑1 (MQ=255)
ggAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGtt > 3:357462/1‑151 (MQ=255)
ggAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGtt > 4:1177938/1‑151 (MQ=255)
aaGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTac < 4:93144/151‑1 (MQ=255)
gTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTacgaa < 4:956722/151‑1 (MQ=255)
gTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTacga > 2:310041/1‑150 (MQ=255)
aaTTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTacgaacg > 2:1651775/1‑150 (MQ=255)
aTTGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTacgaacg > 4:240780/1‑149 (MQ=255)
tGATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTACGAACgaga < 4:661790/150‑1 (MQ=255)
gATGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTACGAACGAGAAt < 4:1508542/151‑1 (MQ=255)
aTGGAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTACGAACGAGAATg > 3:414330/1‑151 (MQ=255)
ggAAGACTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTACGAACGAGAATGt < 4:873028/150‑1 (MQ=255)
aCTTCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTACGAACGAGAATGTTACCTg < 2:805331/151‑1 (MQ=255)
ttCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTACGAACGAGAATGTTACCTGc > 3:381554/1‑150 (MQ=255)
tCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTACGAACGAGAATGTTACCTGCa < 2:405753/150‑1 (MQ=255)
tCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTACGAACGAGAATGTTACCTGCa < 4:1602247/150‑1 (MQ=255)
tCCAGCGCCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTACGAACGAGAATGTTACCTGCa < 3:23280/150‑1 (MQ=255)
|
ATTTTCCTGCAACGAAACTAAATCAGTTTTTATTTTTTGCTGCTTAAACCAGTCGAGCATTGATACCGTATTACCGTTCACTAATGTCAGCTGTAAATGGTAATTTTTGTTCATCAGGCGGAAGGTTAATTGATGGAAGACTTCCAGCACCAACAAGGTCATCACTGAACCATAAATACCCAGTTCGTACATACCGCTGCCAATAACCATACCTATGGCGGCGGTCACCCAGATATCCGCTGCCGTCGTCAGACCTACAATATTTTGGTTACGAACGAGAATGTTACCTGCACCG > NC_000913/3655369‑3655663
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
