Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I3 R1
|
160 |
117.2 |
4331776 |
85.4% |
3699336 |
149.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,727,916 |
T→C |
intergenic (‑168/+1) |
yiaB ← / ← xylB |
YiaAB family inner membrane protein/xylulokinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,727,916 | 0 | T | C | 100.0%
| 659.8
/ NA
| 170 | intergenic (‑168/+1) | yiaB/xylB | YiaAB family inner membrane protein/xylulokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (88/82); total (88/82) |
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
GCGATACATTACGAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATT > NC_000913/3727769‑3728063
|
cGATACATTACGAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTAc > 4:642843/1‑151 (MQ=255)
gATACATTACGAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACg > 4:150340/1‑151 (MQ=255)
aCATTACGAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGcc > 2:1093861/1‑150 (MQ=255)
aCATTACGAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGcc > 4:1492021/1‑150 (MQ=255)
aCATTACGAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGca < 2:498927/150‑2 (MQ=255)
aTTACGAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCAtt < 4:1275061/151‑1 (MQ=255)
aTTACGAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCAta < 2:886598/151‑2 (MQ=255)
cGAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATg < 4:902090/151‑1 (MQ=255)
cGAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATg < 4:1345839/151‑1 (MQ=255)
gAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATgg > 2:190561/1‑151 (MQ=255)
gTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGc > 4:167157/1‑150 (MQ=255)
aaaGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTg < 4:805500/151‑1 (MQ=255)
gACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATa < 2:856129/151‑1 (MQ=255)
aaaaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATagag < 2:205393/151‑1 (MQ=255)
aaaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAgg > 4:768180/1‑151 (MQ=255)
aaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGc < 4:7277/151‑1 (MQ=255)
aaCTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGc < 4:794121/151‑1 (MQ=255)
gAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGa < 1:3410/149‑1 (MQ=255)
gAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGa < 2:1299386/149‑1 (MQ=255)
gAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACg > 1:316161/1‑151 (MQ=255)
aaaaaTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACgg < 2:1347404/151‑1 (MQ=255)
aaaaaTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACgg > 4:226805/1‑151 (MQ=255)
aaaaTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACgg > 4:1452085/1‑150 (MQ=255)
aaaaTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGa < 4:758991/151‑1 (MQ=255)
aTGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTAATGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACg > 2:1387408/1‑151 (MQ=255)
cATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTtc < 2:720502/151‑1 (MQ=255)
aTTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTtct < 2:880779/151‑1 (MQ=255)
aaaTGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTcgtcgt > 4:461966/1‑151 (MQ=255)
aaaTGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTcgtcgt < 2:1045193/151‑1 (MQ=255)
aaaTGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTcgtcgt < 2:1643048/151‑1 (MQ=255)
aaTGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTg < 4:5633/151‑1 (MQ=255)
aaTGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTg < 4:261761/151‑1 (MQ=255)
aTGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTgg > 4:652093/1‑151 (MQ=255)
aTTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTg < 1:453721/151‑1 (MQ=255)
tttCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGa < 4:158706/150‑1 (MQ=255)
ttCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGAt < 4:1081286/150‑1 (MQ=255)
gAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCg > 4:865327/1‑151 (MQ=255)
aaaTTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCAt > 1:68324/1‑151 (MQ=255)
aaaTTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCAt < 4:531075/151‑1 (MQ=255)
aaTTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCAt > 2:1573637/1‑150 (MQ=255)
aaTTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATa < 2:871001/151‑1 (MQ=255)
gttCATACTAAATATTAATTAATTACTGGGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATa > 2:1613457/2‑150 (MQ=255)
tCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACg > 1:445984/1‑151 (MQ=255)
tCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACg > 1:244045/1‑151 (MQ=255)
tCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCATCGTGGCTGATAAGCGGCATAACg > 2:441463/1‑151 (MQ=255)
cATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAAc < 2:795900/149‑1 (MQ=255)
aTACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCt > 2:1458398/1‑151 (MQ=255)
tACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTg > 2:5543/1‑151 (MQ=255)
aCTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTg < 2:969082/150‑1 (MQ=255)
tAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTgcgc > 2:1682517/1‑151 (MQ=255)
aaaTATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTgcgc > 2:271726/1‑150 (MQ=255)
aaaTATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTgcgc < 2:1489819/150‑1 (MQ=255)
attaattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTg < 2:483764/151‑1 (MQ=255)
ttaattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTgg > 1:387150/1‑151 (MQ=255)
taattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGt > 4:1050485/1‑151 (MQ=255)
aattaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGt > 1:16841/1‑150 (MQ=255)
attaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGt > 1:241114/1‑149 (MQ=255)
ttaattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGt > 2:109830/1‑148 (MQ=255)
aattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATg > 2:1461406/1‑151 (MQ=255)
aattaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCCGGTAGATg < 4:1544269/151‑1 (MQ=255)
ttaCTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCg > 2:772562/1‑151 (MQ=255)
tGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTg > 3:56981/1‑151 (MQ=255)
gagaTATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACt < 2:1289855/149‑1 (MQ=255)
gagaTATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGt > 2:340074/1‑151 (MQ=255)
gagaTATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGt < 2:551921/151‑1 (MQ=255)
agaTATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGtt < 2:142011/151‑1 (MQ=255)
atatatAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTc < 2:1158322/150‑1 (MQ=255)
atataGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTaa < 4:1069703/151‑1 (MQ=255)
atataGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTa > 1:33243/1‑150 (MQ=255)
aGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGt < 2:1020708/151‑1 (MQ=255)
aGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGt > 1:219408/1‑151 (MQ=255)
gATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGt > 3:380692/1‑150 (MQ=255)
gATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTa < 3:244061/151‑1 (MQ=255)
gATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTa < 2:842740/151‑1 (MQ=255)
aTGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGt > 4:1145908/1‑149 (MQ=255)
gtgAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGtt > 2:1311830/1‑151 (MQ=255)
aaTTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCg > 2:721874/1‑151 (MQ=255)
tATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGc > 1:19272/1‑150 (MQ=255)
aTCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGca < 4:1568064/150‑1 (MQ=255)
cccccACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGcaaca < 4:782714/151‑1 (MQ=255)
ccccACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGcaaca > 2:16847/1‑150 (MQ=255)
ccACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAAtt > 3:108776/1‑151 (MQ=255)
cACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTc > 2:1540044/1‑151 (MQ=255)
cACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTc > 2:683785/1‑151 (MQ=255)
cGGTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATg > 4:657852/1‑151 (MQ=255)
gTCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATg > 4:1405776/1‑149 (MQ=255)
tCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGc > 2:1500748/1‑151 (MQ=255)
tCAGGCAGGGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGc > 4:303240/1‑151 (MQ=255)
caggcaggGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCg < 2:1218324/151‑1 (MQ=255)
caggcaggGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCg < 4:1128509/151‑1 (MQ=255)
caggcaggGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCg > 4:215607/1‑151 (MQ=255)
aggcaggGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCg > 2:1026646/1‑150 (MQ=255)
aggcaggGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCg > 4:509363/1‑150 (MQ=255)
aggGGATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTtc > 2:80036/1‑151 (MQ=255)
ggggATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTtct < 3:178160/151‑1 (MQ=255)
ggggATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTtct < 2:767158/151‑1 (MQ=255)
ggATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTctct < 3:68328/151‑1 (MQ=255)
ggATAACGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTctct > 1:57583/1‑151 (MQ=255)
gaaCGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTCGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTgg > 4:108862/2‑150 (MQ=255)
aCGCTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGAtt > 2:82535/1‑151 (MQ=255)
|
GCGATACATTACGAGTAACCAACGAAAGACAAAACTGAAAAATGCCATTAACAAATGATTTTCAGAATAAATTCATACTAAATATTAATTAATTACTGAGATATATAGATGTGAATTATCCCCCACCCGGTCAGGCAGGGGATAACGTTTACGCCATTAATGGCAGAAGTTGCTGATAGAGGCGACGGAACGTTTCTCGTCGTGGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATT > NC_000913/3727769‑3728063
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
