Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F50 I2 R1
|
104 |
44.1 |
1376607 |
98.9% |
1361464 |
150.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,196,495 |
T→C |
intergenic (+122/+372) |
icd → / ← ymfD |
isocitrate dehydrogenase; e14 prophage attachment site; tellurite reductase/e14 prophage; putative SAM‑dependent methyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,196,495 | 0 | T | C | 100.0%
| 245.1
/ NA
| 66 | intergenic (+122/+372) | icd/ymfD | isocitrate dehydrogenase; e14 prophage attachment site; tellurite reductase/e14 prophage; putative SAM‑dependent methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (44/22); total (44/22) |
GTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGATTAAGACATCCCCAAAGTTAGTTATGTATTCACTGTTAT > NC_000913/1196348‑1196641
|
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cgATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGcc < 2:249470/151‑1 (MQ=255)
cgATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGcc > 2:144852/1‑151 (MQ=255)
atcatcGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCgg > 2:77494/1‑151 (MQ=255)
tcatcGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGAGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCAGGt > 1:37124/1‑151 (MQ=255)
cGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAgg > 2:96293/1‑151 (MQ=255)
aaaaCATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAggtg > 1:137214/1‑151 (MQ=255)
aaaaCATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAggtg < 1:587664/151‑1 (MQ=255)
aCATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAggtggt > 1:118564/1‑150 (MQ=255)
aaTGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTct > 1:222886/1‑150 (MQ=255)
aaTGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTct < 2:19854/150‑1 (MQ=255)
aaTGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTct > 1:57915/1‑150 (MQ=255)
ttAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTccc > 2:635500/1‑150 (MQ=255)
ttAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTccc > 1:662764/1‑150 (MQ=255)
tAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCcac > 1:85758/1‑151 (MQ=255)
aaaTTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCcac > 2:235679/1‑150 (MQ=255)
aaTTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACAt > 2:322878/1‑151 (MQ=255)
aTTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAGAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACAt > 2:397475/1‑150 (MQ=255)
aTTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATa < 1:136269/151‑1 (MQ=255)
ttattaACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACAt > 1:482342/1‑148 (MQ=255)
ttattaACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACAt > 1:387669/1‑148 (MQ=255)
ttattaACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACAt > 1:64931/1‑148 (MQ=255)
tattaACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACAt > 1:457916/1‑147 (MQ=255)
taACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATAtt > 2:271864/1‑151 (MQ=255)
aaCGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTc < 2:593810/151‑1 (MQ=255)
aaCGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTc > 2:140300/1‑151 (MQ=255)
aCGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTcc > 2:610687/1‑151 (MQ=255)
gggAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCtt < 2:264149/151‑1 (MQ=255)
gCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCt < 2:668353/151‑1 (MQ=255)
cGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCtt > 1:290663/1‑151 (MQ=255)
tAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCtttt > 2:433842/1‑151 (MQ=255)
aaCGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCttttt > 1:661484/1‑151 (MQ=255)
aCGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCttttt > 2:164778/1‑150 (MQ=255)
gCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTttatt > 2:667931/1‑151 (MQ=255)
cGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGTGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTTGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGc < 1:65117/151‑1 (MQ=255)
tgttTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTg < 1:598870/150‑1 (MQ=255)
gttTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGc > 2:321031/1‑151 (MQ=255)
tttGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGa < 2:306046/150‑1 (MQ=255)
aaCGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAatat < 2:293650/149‑1 (MQ=255)
aCGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTa < 2:616943/151‑1 (MQ=255)
cGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTaa < 2:614905/151‑1 (MQ=255)
cGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTa > 1:69761/1‑150 (MQ=255)
cGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTa > 1:27117/1‑150 (MQ=255)
gTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAgg > 2:209224/1‑151 (MQ=255)
tATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTc > 2:188645/1‑151 (MQ=255)
tCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCtt > 1:129944/1‑151 (MQ=255)
cAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTc > 1:140112/1‑151 (MQ=255)
aaaaTTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTc > 1:347513/1‑150 (MQ=255)
aaaaTTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCa < 1:448393/151‑1 (MQ=255)
aTTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCAtt > 1:86525/1‑150 (MQ=255)
aTTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTg > 2:30626/1‑151 (MQ=255)
ttttATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTg > 1:233874/1‑150 (MQ=255)
ttATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGAt < 1:66113/150‑1 (MQ=255)
tCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGATTa > 1:22862/1‑149 (MQ=255)
aaaaGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGATTAAGACATc < 2:358600/151‑1 (MQ=255)
aaaGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGATTAAGACATcc > 1:590151/1‑151 (MQ=255)
gTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGATTAAGACATCCCCa < 1:49265/151‑1 (MQ=255)
tCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATACCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCACGTTAATATTGAAGGTCTTCATTGATTAAGACATCCCCaaaa < 1:196319/150‑2 (MQ=255)
cAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGATTAAGACATCCCCAAagtt < 1:595631/151‑1 (MQ=255)
aaaCCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGATTAAGACATCCCCAAagtt > 1:393328/1‑149 (MQ=255)
aCCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGATTAAGACATCCCCAAagttagtt > 2:673816/1‑151 (MQ=255)
aCCCCTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGCTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGGCTTCATTGATTAAGACATCCCCAAagttagtt > 1:54385/1‑151 (MQ=255)
ccTCGGTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGAGTAAGACATCCCCAAAGTTAGTTATg < 2:350085/151‑1 (MQ=255)
ggTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGATTAAGACATCCCCAAAGTTAGTTATGTAtt < 1:140296/151‑1 (MQ=255)
ggTAGTTTTGGGGCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGATTAAGACATCCCCAAAGTTAGTTATGTAtt < 1:434005/151‑1 (MQ=255)
ggggCAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGATTAAGACATCCCCAAAGTTAGTTATGTATTCACTGttat > 2:627049/1‑151 (MQ=255)
|
GTGACGCGATCATCGAAAACATGTAATGCCGTAGTTTGTTAAATTTATTAACGGGAGCGTAACGCTCCCGTTGTTTTTTGTTAGGCTGCTAACGGTTATCAAAATTTTATCAAAAAAAGTTATCAAAACCCCTCGGTAGTTTTGGGGTAGGCTGGCCGGTCAGGTGGTAGTTCTACTACTAGTCTCCCACATAGATATTCCTTAGCTTTTTATTATTGCTGGCGGACGCTCGTTAATATTTAAGGTCTTCATTGATTAAGACATCCCCAAAGTTAGTTATGTATTCACTGTTAT > NC_000913/1196348‑1196641
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
