Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F50 I3 R1
|
168 |
141.0 |
4346284 |
99.6% |
4328898 |
150.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
267,378 |
A→G |
W210R (TGG→CGG) |
yafZ ← |
CP4‑6 prophage; conserved protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 267,378 | 0 | A | G | 99.3%
| 501.9
/ NA
| 137 | W210R (TGG→CGG) | yafZ | CP4‑6 prophage; conserved protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (65/71); minor base C (1/0); total (66/71) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CGGTTAAGTTTCACGTCCCCGTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGG > NC_000913/267230‑267523
|
cGGTTAAGTTTCACGTCCCCGTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGgc < 2:1641881/151‑1 (MQ=255)
ggTTAAGTTTCACGTCCCCGTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGgcg < 1:1880995/151‑1 (MQ=255)
ggTTAAGTTTCACGTCCCCGTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGgcg < 1:1173929/151‑1 (MQ=255)
tAAGTTTCACGTCCCCGTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCggcggc < 2:1176050/150‑1 (MQ=255)
tAAGTTTCACGTCCCCGTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGgcggcg > 2:737101/1‑151 (MQ=255)
aaGTTTCACGTCCCCGTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGa < 2:1432085/151‑1 (MQ=255)
aGTTTCACGTCCCCGTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAg < 2:2154522/151‑1 (MQ=255)
gTTTCACGTCCCCGTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAgg > 1:759655/1‑151 (MQ=255)
cACGTCCCCGTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGgag < 1:1816159/151‑1 (MQ=255)
gTCCCCGTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAgg > 1:1710019/1‑151 (MQ=255)
ccGTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCt > 2:147347/1‑151 (MQ=255)
gTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGc < 2:470217/151‑1 (MQ=255)
gTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGc < 2:737539/151‑1 (MQ=255)
gTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGc < 2:1278463/151‑1 (MQ=255)
gTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGc > 2:2029342/1‑151 (MQ=255)
cGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACAGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCg < 1:1196978/150‑1 (MQ=255)
aTACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGAtt < 1:1934120/151‑1 (MQ=255)
aTACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGAtt < 2:1007684/151‑1 (MQ=255)
tACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTc > 2:301661/1‑151 (MQ=255)
aCCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTc < 2:1811391/150‑1 (MQ=255)
ccGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTAAGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTc > 2:818364/1‑149 (MQ=255)
cgAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCa < 2:936210/151‑1 (MQ=255)
aCGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCg > 2:1855048/1‑151 (MQ=255)
tATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTc > 1:1023385/1‑151 (MQ=255)
aTGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATATGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTc < 2:626897/150‑1 (MQ=255)
aTGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCt < 1:1430520/151‑1 (MQ=255)
ccGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCAcc > 1:2153965/1‑150 (MQ=255)
tcctccTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCaa > 1:1016148/1‑149 (MQ=255)
ctcctTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCg > 2:1197100/1‑151 (MQ=255)
cctTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCgg < 2:1975801/150‑1 (MQ=255)
cctTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGt < 2:1439323/151‑1 (MQ=255)
ttGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTAt < 1:1147153/150‑1 (MQ=255)
ggCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTAtgt < 2:1710655/150‑1 (MQ=255)
gCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGa < 1:812422/151‑1 (MQ=255)
gCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGa < 1:1245291/151‑1 (MQ=255)
cATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGTGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAg < 2:1309640/151‑1 (MQ=255)
tACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAggg > 2:167560/1‑150 (MQ=255)
aCGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGggcg < 1:102053/151‑1 (MQ=255)
aCGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGggcg < 2:1984696/151‑1 (MQ=255)
aCGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGggcg > 1:1715972/1‑151 (MQ=255)
aCGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGggc < 1:551853/150‑1 (MQ=255)
aCGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGggc < 1:149576/150‑1 (MQ=255)
cGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGggcgg < 1:884662/151‑1 (MQ=255)
cGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGggcgg < 1:1914137/151‑1 (MQ=255)
cGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGggcgg > 1:2014951/1‑151 (MQ=255)
ggCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGggcggc > 1:865542/1‑151 (MQ=255)
ggCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGggcggc > 2:128919/1‑151 (MQ=255)
ggCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGggcg > 1:1796179/1‑149 (MQ=255)
cACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTGCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCTCCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCttt < 2:143908/151‑1 (MQ=255)
aCTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCtttt < 1:110240/151‑1 (MQ=255)
aCTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCtttt > 2:892441/1‑151 (MQ=255)
aCTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCtttt < 2:299753/151‑1 (MQ=255)
cTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTg > 1:420668/1‑151 (MQ=255)
aGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCa < 1:655318/151‑1 (MQ=255)
gcccgcccTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGcc > 1:1246217/1‑149 (MQ=255)
ccgcccTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTg > 2:163635/1‑151 (MQ=255)
cTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCctgc > 2:1587807/1‑151 (MQ=255)
aaTCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCtgt > 2:1315397/1‑151 (MQ=255)
aaTCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCtgt < 2:578668/151‑1 (MQ=255)
cAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGcc > 1:1604307/1‑151 (MQ=255)
gTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGTTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCggg < 2:495458/151‑1 (MQ=255)
gTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCggg > 1:246131/1‑151 (MQ=255)
tctcCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCggggg > 2:1407091/1‑151 (MQ=255)
tcCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTg > 1:250696/1‑151 (MQ=255)
tcCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTg > 1:2004924/1‑151 (MQ=255)
ccTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGt < 1:1881563/149‑1 (MQ=255)
aTACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAAc > 1:523289/1‑150 (MQ=255)
aCGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGc < 2:901645/151‑1 (MQ=255)
aCGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGc < 1:147347/151‑1 (MQ=255)
aCGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTG‑CTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGc > 1:162740/1‑150 (MQ=255)
gCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCaa < 1:1738323/151‑1 (MQ=255)
gCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCa > 2:1885466/1‑150 (MQ=255)
aCGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTg > 2:101056/1‑151 (MQ=255)
cGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGc < 2:346125/151‑1 (MQ=255)
cGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGc > 2:1882041/1‑151 (MQ=255)
gTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGc > 2:2167993/1‑150 (MQ=255)
gTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGc > 2:2093804/1‑150 (MQ=255)
gTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCa < 1:887586/151‑1 (MQ=255)
ccACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGc < 2:1147456/150‑1 (MQ=255)
cacaGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCAt < 2:2072798/151‑1 (MQ=255)
caGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATcc < 1:126231/151‑1 (MQ=255)
caGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATcc < 1:1166424/151‑1 (MQ=255)
caGGTCATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATcc < 1:1675957/151‑1 (MQ=255)
cATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGttt < 1:562774/151‑1 (MQ=255)
cATTGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGtt < 1:956541/150‑1 (MQ=255)
tGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTtctc > 1:2130590/1‑151 (MQ=255)
tGCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTtctc > 2:1517912/1‑151 (MQ=255)
gCTCTCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTctcc > 2:598980/1‑151 (MQ=255)
ctctCATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTctcct > 1:1332733/1‑151 (MQ=255)
cATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCtcctcc < 1:945396/149‑1 (MQ=255)
cATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCtcctcc < 1:197006/149‑1 (MQ=255)
cATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCa < 2:1099139/150‑1 (MQ=255)
cATCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCa < 2:236620/150‑1 (MQ=255)
aTCCTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCAcc < 1:1108273/151‑1 (MQ=255)
ccTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCAccc < 1:909243/150‑1 (MQ=255)
ccTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCAccc < 2:92446/150‑1 (MQ=255)
cTGCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCgg > 1:49734/1‑151 (MQ=255)
tGCCCGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGCGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCgg > 1:708486/1‑150 (MQ=255)
gCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCgg < 1:993322/149‑1 (MQ=255)
gCCGGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCgg < 2:1084338/149‑1 (MQ=255)
|
CGGTTAAGTTTCACGTCCCCGTCGATACCGCGAACGGCACGGGTATGTGACCGTCCTCCTTTGGCATTACGGCCACTGAGCCCGCCCTTAATCAGGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGG > NC_000913/267230‑267523
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
