Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F50 I3 R1
|
168 |
141.0 |
4346284 |
99.6% |
4328898 |
150.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,794,796 |
G→A |
E182K (GAA→AAA) |
gabP → |
gamma‑aminobutyrate transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,794,796 | 0 | G | A | 99.2%
| 467.0
/ NA
| 117 | E182K (GAA→AAA) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (60/56); minor base C (0/1); total (60/57) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.87e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ACCCTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCGAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCGGAATCCGACACGCCGG > NC_000913/2794652‑2794943
|
aCCCTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTg < 1:482763/150‑1 (MQ=255)
aCCCTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTg < 1:395428/150‑1 (MQ=255)
cccTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTg > 2:918683/1‑149 (MQ=255)
cccTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTg > 2:616890/1‑149 (MQ=255)
ccTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGc < 2:306424/151‑1 (MQ=255)
cGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGACTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCg < 1:7650/149‑1 (MQ=255)
ccTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGAt > 2:67281/1‑151 (MQ=255)
cTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGAtc > 1:1137168/1‑151 (MQ=255)
cTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGAtc > 2:146059/1‑151 (MQ=255)
cTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGAtc > 2:2155335/1‑151 (MQ=255)
ttAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGAtct > 2:1549166/1‑151 (MQ=255)
gCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGAtt < 2:806883/151‑1 (MQ=255)
aGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATtgt < 2:1391700/151‑1 (MQ=255)
aGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATtgt < 1:311702/151‑1 (MQ=255)
aGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATtgt > 2:1565688/1‑151 (MQ=255)
aGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATtgt > 1:1246751/1‑151 (MQ=255)
aaCTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTggg < 2:744294/151‑1 (MQ=255)
ttattaAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGAt > 2:1112039/1‑150 (MQ=255)
ttattaAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGAt > 2:1114832/1‑150 (MQ=255)
tattaAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTTGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATa < 1:1284344/150‑1 (MQ=255)
tattaAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGAt > 2:1360229/1‑149 (MQ=255)
tattaAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGAt > 1:1430113/1‑149 (MQ=255)
tattaAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATa < 2:593857/150‑1 (MQ=255)
ttaAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAgcg > 2:1709026/1‑151 (MQ=255)
taAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAgcgg > 1:966965/1‑151 (MQ=255)
taAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAgcg < 1:1390681/150‑1 (MQ=255)
aaGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAgcgg > 2:652428/1‑150 (MQ=255)
aaaaaCTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCttt < 1:471127/150‑1 (MQ=255)
cTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGccc > 2:1167964/1‑151 (MQ=255)
aCGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCa > 1:1766958/1‑150 (MQ=255)
aCGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATACCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGcac < 1:66996/149‑3 (MQ=255)
gAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGtt < 2:1260359/151‑1 (MQ=255)
tttGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCg > 2:201884/1‑151 (MQ=255)
ttGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCgg > 2:2095952/1‑151 (MQ=255)
gAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGt < 2:356959/150‑1 (MQ=255)
gAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGt < 2:580632/150‑1 (MQ=255)
gAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGt < 1:1558769/150‑1 (MQ=255)
gAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTg > 1:1726239/1‑151 (MQ=255)
gTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTggg > 2:333908/1‑149 (MQ=255)
gTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCg < 1:713178/151‑1 (MQ=255)
gTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCg > 1:50895/1‑151 (MQ=255)
tCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCgg > 2:610344/1‑150 (MQ=255)
gctggcGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTAtt > 1:699884/1‑150 (MQ=255)
ctggcGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTa > 1:206007/1‑150 (MQ=255)
ggcGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAgc < 2:389376/151‑1 (MQ=255)
ggcGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAgc < 1:1356218/151‑1 (MQ=255)
ggcGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAg < 1:1297264/150‑1 (MQ=255)
gcTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGcgcg > 2:69570/1‑151 (MQ=255)
cTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGcgcg > 1:1051210/1‑150 (MQ=255)
tgtgCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGAt > 1:1164691/1‑151 (MQ=255)
aaaGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGa < 2:920629/151‑1 (MQ=255)
aaGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGAt > 1:1559916/1‑151 (MQ=255)
tCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCAc > 2:1871747/1‑151 (MQ=255)
gCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGt < 1:1407454/151‑1 (MQ=255)
ggCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGttt > 1:251900/1‑151 (MQ=255)
ggCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGtt < 2:1821882/150‑1 (MQ=255)
gCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTa < 2:699952/151‑1 (MQ=255)
gCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGCTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGGTCACCATGTTCTTGtt > 1:242360/1‑149 (MQ=255)
ccTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTAt < 1:1015887/151‑1 (MQ=255)
ccTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTAt < 2:313028/151‑1 (MQ=255)
tttATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATgg > 2:864032/1‑151 (MQ=255)
ttATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATggg > 2:2138318/1‑151 (MQ=255)
ttATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATg < 2:1308838/149‑1 (MQ=255)
tATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATggg < 2:1297472/150‑1 (MQ=255)
tttCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGgcgc > 1:452114/1‑150 (MQ=255)
tttCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGgcgc < 1:1477827/150‑1 (MQ=255)
ttCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGgcgc > 1:980206/1‑149 (MQ=255)
ccTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGaa < 1:11107/151‑1 (MQ=255)
ccTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGaa < 2:1269208/151‑1 (MQ=255)
cTTGGTGCAGTCGCAATTTGCGGTTTTTTCCCGTATGCCCAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTTGGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGaa < 2:1878123/150‑1 (MQ=255)
cTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGaa > 1:135/1‑150 (MQ=255)
cAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCAc > 2:133059/1‑151 (MQ=255)
cAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCAc < 1:1136443/151‑1 (MQ=255)
cGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCAtt > 2:2096899/1‑151 (MQ=255)
gCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTg < 2:1507088/151‑1 (MQ=255)
cAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTgc > 2:1401721/1‑151 (MQ=255)
aTTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTgccg < 1:959562/151‑1 (MQ=255)
tAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTgccgcc > 2:1374580/1‑151 (MQ=255)
tAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTgccgc < 2:369192/150‑1 (MQ=255)
tAGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTgccgc < 2:562648/150‑1 (MQ=255)
aGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTgccgcc < 1:1456606/150‑1 (MQ=255)
aGCGGTTTTTACCCGTATGCCAAAATGAGCGGGATCTCTAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTGTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAattgtcgccattgtcgcc < 2:2043444/150‑1 (MQ=255)
ggTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCgg < 1:164738/151‑1 (MQ=255)
ggTTTTTACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCgg > 2:941283/1‑151 (MQ=255)
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tttACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCGGAAt < 2:1680303/150‑1 (MQ=255)
ttACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCGGAATcc > 1:1326639/1‑151 (MQ=255)
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tACCCGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCGGAATCCg > 2:1597356/1‑151 (MQ=255)
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cccGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCGGAATCCGac < 2:772320/151‑1 (MQ=255)
cccGTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGGTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCGGAATCCGac > 2:2126885/1‑151 (MQ=255)
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gTATGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCGGAATCCGACACg < 1:1951686/151‑1 (MQ=255)
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aTGCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCGGAATCCGACACGcc > 1:1272608/1‑151 (MQ=255)
gCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCGGAATCCGACACGCCgg < 1:2095997/151‑1 (MQ=255)
gCCAAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGGTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCGGAATCCGACACGCCgg > 2:2071926/1‑151 (MQ=255)
|
ACCCTCGCCTTAACTGGCAGTAACTTATTAAGCGTTAAAAACTACGGCGAATTTGAGTTCTGGCTGGCGCTGTGCAAAGTCATCGCTATCCTGGCCTTTATTTTCCTTGGTGCAGTCGCAATTAGCGGTTTTTACCCGTATGCCGAAGTGAGCGGGATCTCAAGATTGTGGGATAGCGGCGGCTTTATGCCCAACGGTTTCGGTGCGGTATTAAGCGCGATGTTGATCACCATGTTCTCGTTTATGGGCGCAGAAATTGTCACCATTGCCGCCGCGGAATCCGACACGCCGG > NC_000913/2794652‑2794943
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
