Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F50 I1 R1
|
144 |
141.8 |
4677362 |
93.6% |
4378010 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
264,465 |
C→A |
E90* (GAG→TAG) |
ykfG ← |
CP4‑6 prophage; RadC‑like JAB domain protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 264,465 | 0 | C | A | 100.0%
| 484.1
/ NA
| 125 | E90* (GAG→TAG) | ykfG | CP4‑6 prophage; RadC‑like JAB domain protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (57/68); total (57/68) |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CGGATATCCACCAGCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTCCCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGCCATTCACGTACGGCGTG > NC_000913/264323‑264612
|
cGGATATCCACCAGCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGa < 1:177250/150‑1 (MQ=255)
atatCCACCATCTGAAGCACCTGACCCAGACGCTGCGTGTGGGATTTGTCGGCCTGGCTAGCTGTCCACTCCCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGGAACACCGACTCCGCGTTGCAGGGCCGAGCACGTTTGATCCCCTACCgggg > 1:947412/1‑146 (MQ=255)
atatCCACCAGCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCa < 2:697822/151‑1 (MQ=255)
tatCCACCAGCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCAc > 3:397633/1‑151 (MQ=255)
atCCACCAGCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCAc < 3:255160/150‑1 (MQ=255)
ccaccaGCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTc < 1:2992/151‑1 (MQ=255)
accaGCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCgg < 4:29514/151‑1 (MQ=255)
accaGCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCgg > 2:392518/1‑151 (MQ=255)
accaGCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCgg > 2:214545/1‑151 (MQ=255)
ccaGCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGt < 2:607052/151‑1 (MQ=255)
ccaGCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGt < 1:655267/151‑1 (MQ=255)
caGCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTg < 2:1089060/151‑1 (MQ=255)
gCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCg < 1:42472/151‑1 (MQ=255)
aaGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTa < 2:1230702/151‑1 (MQ=255)
aGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTaa < 2:1243147/151‑1 (MQ=255)
aGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTaa < 1:182685/151‑1 (MQ=255)
cACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAAt < 2:162083/150‑1 (MQ=255)
aaCCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCg < 1:1616636/151‑1 (MQ=255)
aCCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCgg > 1:1190693/1‑151 (MQ=255)
ccAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCgg > 4:506745/1‑150 (MQ=255)
cAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTg > 3:446206/1‑151 (MQ=255)
aGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTg > 1:1664208/1‑150 (MQ=255)
cGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAaga < 1:318492/151‑1 (MQ=255)
tGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCg > 1:232413/1‑151 (MQ=255)
gCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGc < 3:162760/149‑1 (MQ=255)
gTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGttt < 1:1528828/151‑1 (MQ=255)
gTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATggg < 2:766247/151‑1 (MQ=255)
tttGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGc > 4:108857/1‑150 (MQ=255)
gTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATc < 3:86033/151‑1 (MQ=255)
cGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCa > 1:1658332/1‑150 (MQ=255)
cGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCa > 4:190856/1‑150 (MQ=255)
cTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTg > 4:211922/1‑150 (MQ=255)
ggCTTGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGAtt < 1:1671707/151‑1 (MQ=255)
ggCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGa < 4:171534/149‑1 (MQ=255)
ggCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGAtt < 2:1492189/151‑1 (MQ=255)
ggCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGAtt < 2:404709/151‑1 (MQ=255)
ggCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGAtt < 4:202140/151‑1 (MQ=255)
ggCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGAtt < 1:987349/151‑1 (MQ=255)
gCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTc < 3:547327/151‑1 (MQ=255)
acTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTc > 2:174368/2‑151 (MQ=255)
cTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCt > 2:406261/1‑151 (MQ=255)
aGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTgg > 2:1264402/1‑151 (MQ=255)
gtcgtcTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGt < 1:74355/151‑1 (MQ=255)
cgtcTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTcc > 2:562585/1‑151 (MQ=255)
cgtcTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTc < 4:150163/150‑1 (MQ=255)
cGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGa < 1:394432/149‑1 (MQ=255)
ccGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATa < 1:800714/149‑1 (MQ=255)
ggAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATacaac > 4:281598/1‑151 (MQ=255)
gAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATacaaca < 1:1541640/151‑1 (MQ=255)
aGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACAcc > 1:348885/1‑151 (MQ=255)
aTGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTTCTGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCTTGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAGTCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCgg < 2:1683891/151‑1 (MQ=255)
ggTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGa > 1:365039/1‑150 (MQ=255)
gTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAAc < 2:649346/151‑1 (MQ=255)
tATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAAct < 1:490363/150‑1 (MQ=255)
aTGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAActct > 2:32703/1‑151 (MQ=255)
tccgcgAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGAGAAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCtt > 1:516855/3‑151 (MQ=255)
gcgcGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCtt < 1:1244634/150‑1 (MQ=255)
gcgcGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTc > 1:1032925/1‑151 (MQ=255)
gcgcGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTc > 2:76618/1‑151 (MQ=255)
gcgcGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTc > 2:911053/1‑151 (MQ=255)
cgcgAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTcc < 2:401548/151‑1 (MQ=255)
cgcgAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTcc > 2:1013346/1‑151 (MQ=255)
cgAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCg < 2:1192202/151‑1 (MQ=255)
gAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGc < 2:1662635/151‑1 (MQ=255)
aTCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCaa < 2:574218/151‑1 (MQ=255)
aTCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCaa < 2:1471638/151‑1 (MQ=255)
tCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCGCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTcc < 1:1047902/143‑1 (MQ=255)
cACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAg < 3:435864/150‑1 (MQ=255)
gccgccgcGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGa < 3:366800/130‑1 (MQ=255)
gccgccgcGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGa > 4:366781/1‑130 (MQ=255)
gccgccgcGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGAGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCgg > 3:145136/1‑151 (MQ=255)
agccgcGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGcc > 1:1116777/2‑151 (MQ=255)
gccgcGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGCTTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGcc > 1:151272/1‑150 (MQ=255)
ccgcGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCa < 1:1025976/150‑1 (MQ=255)
gcgTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCatat > 2:693771/1‑151 (MQ=255)
cgTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCatat < 2:240871/150‑1 (MQ=255)
tGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGc > 1:1224500/1‑149 (MQ=255)
gAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGt > 3:465/1‑151 (MQ=255)
aaGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCCCCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTTAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTTTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTc < 2:263185/151‑1 (MQ=255)
aaGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTc < 1:563937/151‑1 (MQ=255)
aaGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTc < 1:508277/151‑1 (MQ=255)
aGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCg > 2:927458/1‑151 (MQ=255)
aGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCg < 3:270317/151‑1 (MQ=255)
tGCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGc > 1:1436117/1‑150 (MQ=255)
gCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCa < 1:716718/150‑1 (MQ=255)
gCAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAg < 2:1439147/151‑1 (MQ=255)
cAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAg < 1:636678/150‑1 (MQ=255)
cAGAGCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGc > 1:520592/1‑151 (MQ=255)
agagCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGcc > 1:1036934/1‑151 (MQ=255)
agagCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGcc > 4:31080/1‑151 (MQ=255)
gCACGTTTGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGCCAtt > 1:191890/1‑151 (MQ=255)
tttGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGCCATTCACGt > 1:647228/1‑151 (MQ=255)
tttGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGCCATTCACGt > 4:441186/1‑151 (MQ=255)
tGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGCCATTCACGTAc > 3:98811/1‑151 (MQ=255)
tGACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGCCATTCACGTAc > 4:592644/1‑151 (MQ=255)
gACCACCTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGCCATTCACGTAc < 2:1501819/150‑1 (MQ=255)
caccTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGCCATTCACGTACGGCg > 1:788257/1‑151 (MQ=255)
accTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGCCATTCACGTACGGCGt > 4:555281/1‑151 (MQ=255)
ccTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGCCATTCACGTACGGCGt < 1:562503/150‑1 (MQ=255)
ccTACCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGCCATTCACGTACGGCGTg < 1:743873/151‑1 (MQ=255)
|
CGGATATCCACCAGCTGAAGCACCTGAACCAGTCGCTGCGTGAGGGTTTTGTCGGCCTGGCTAGGTGTCGTCTCGCCGGAAGGATGGTTATGCGCGAGTATCACCGCCGCCGCGTTGAAGTGCAGAGCACGTTTGACCACCTCCCGGGGATGCACCTCGGTGCGGTTAATCGTGCCGGTGAAGAGCGTTTCATGGGCAATCAACTGATTCTGGTTGTCCAGATACAACACCCGGAACTCTTCCCGCTCAAGCGCGGCCATATGCAGTCGCAGCCATTCACGTACGGCGTG > NC_000913/264323‑264612
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
