Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I3 R1
|
143 |
109.6 |
3434427 |
98.5% |
3382910 |
150.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,546,863 |
T→C |
V102A (GTA→GCA) |
gntT → |
gluconate transporter, high‑affinity GNT I system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,546,863 | 0 | T | C | 97.2%
| 265.4
/ ‑1.6
| 72 | V102A (GTA→GCA) | gntT | gluconate transporter, high‑affinity GNT I system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base C (39/31); total (39/33) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.07e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.09e-01 |
GTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTACCAATGGCGGCTGCACTGTCT > NC_000913/3546718‑3547002
|
gtCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACtt < 1:1023042/150‑2 (MQ=255)
gtCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTg > 2:394690/1‑150 (MQ=255)
gtCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTg > 1:1433760/1‑150 (MQ=255)
ggcggGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCg > 1:35731/1‑151 (MQ=255)
cggGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGt > 1:517283/1‑151 (MQ=255)
gggACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGtt > 2:799887/1‑151 (MQ=255)
ggACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGttt < 1:308159/151‑1 (MQ=255)
gCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTAcc > 2:857391/1‑151 (MQ=255)
tCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGt > 1:74653/1‑151 (MQ=255)
aGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGt < 2:919683/150‑1 (MQ=255)
aGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGt < 2:1074160/150‑1 (MQ=255)
gCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGttt < 1:537719/151‑1 (MQ=255)
gCCTTGCCCTGATCATGGATTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGttt < 1:846418/151‑1 (MQ=255)
ccTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGtttt < 2:154736/151‑1 (MQ=255)
tGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGc < 1:1193285/150‑1 (MQ=255)
ccTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTg > 2:207625/1‑151 (MQ=255)
gATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTc > 2:1588566/1‑151 (MQ=255)
tCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCt > 2:1380430/1‑150 (MQ=255)
aTGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATg > 1:971193/1‑151 (MQ=255)
tGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATg > 2:1311228/1‑150 (MQ=255)
gggTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGaa < 1:750072/151‑1 (MQ=255)
ggTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGAATGCGGTGTCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAAGTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAg < 2:1486430/151‑1 (MQ=255)
ttttGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTg > 2:1221523/1‑151 (MQ=255)
cgcAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCttt > 1:1305128/1‑151 (MQ=255)
aaTGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTtgtg > 1:187472/1‑151 (MQ=255)
aTGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGc > 1:262709/1‑151 (MQ=255)
gCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCt < 2:156629/150‑1 (MQ=255)
gCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTg > 2:1160930/1‑151 (MQ=255)
gCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTg > 2:953413/1‑151 (MQ=255)
cAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGAtgctg < 2:44669/151‑1 (MQ=255)
ggCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTgg < 2:452339/149‑1 (MQ=255)
ggCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTgg < 1:1311134/149‑1 (MQ=255)
gCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGgtgt > 2:733977/1‑151 (MQ=255)
aaGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGAGtt > 2:1515613/2‑151 (MQ=255)
aGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGttt < 2:1352912/151‑1 (MQ=255)
aCTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTAc < 2:90359/151‑1 (MQ=255)
gCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCa < 2:872496/150‑1 (MQ=255)
cGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATc < 1:459204/151‑1 (MQ=255)
ggCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCgg < 1:445457/151‑1 (MQ=255)
cacaACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTc > 2:1269938/1‑151 (MQ=255)
acaACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCt > 2:1377977/1‑151 (MQ=255)
acaACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCt > 1:1390782/1‑151 (MQ=255)
aaCGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGc < 2:922596/151‑1 (MQ=255)
tATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAat > 2:941648/1‑151 (MQ=255)
aTCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAat < 1:720062/150‑1 (MQ=255)
tCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAatat > 2:793633/1‑151 (MQ=255)
cGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATAtt < 2:93660/151‑1 (MQ=255)
caccacGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTcc > 1:1116331/1‑150 (MQ=255)
ccacGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCAct < 1:530732/151‑1 (MQ=255)
cacGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCActg < 2:48045/151‑1 (MQ=255)
cGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCActgct > 2:616941/1‑151 (MQ=255)
gATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTAt > 2:1500838/1‑151 (MQ=255)
ttGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGt > 1:1106461/1‑151 (MQ=255)
ttGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGt > 1:1172399/1‑151 (MQ=255)
tGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGt < 2:1607119/150‑1 (MQ=255)
ccAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTgg < 2:704439/151‑1 (MQ=255)
cAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGgt < 1:971328/151‑1 (MQ=255)
aaTTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGgtgt < 2:74656/151‑1 (MQ=255)
aTTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGgtgt > 2:1431883/1‑150 (MQ=255)
aTTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTa < 2:42719/151‑1 (MQ=255)
tGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTAcc < 2:122334/150‑1 (MQ=255)
aaaaaCACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTACCAATggc > 1:110206/1‑151 (MQ=255)
aaaaCACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTACCAATggcg > 2:87715/1‑151 (MQ=255)
aaaCACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTACCAATggcgg > 1:817936/1‑151 (MQ=255)
aaaCACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTACCAATggcgg > 2:1147779/1‑151 (MQ=255)
aaCACATCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTACCAATggcggc > 2:1488636/1‑151 (MQ=255)
acaTCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTACCAATGGCGGCTGc > 2:1513276/1‑151 (MQ=255)
caTCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTACCAATGGCGGCTGc > 1:415595/1‑150 (MQ=255)
tCCAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTACCAATGGCGGCTGCAct > 2:1104222/1‑151 (MQ=255)
cAGTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTACCAATGGCGGCTGCActgt < 2:1543121/151‑1 (MQ=255)
gTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTACCAATGGCGGCTGCActgtct < 1:394662/151‑1 (MQ=255)
gTGGGCGGTGGCACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTACCAATGGCGGCTGCActgtct < 2:35732/151‑1 (MQ=255)
|
GTCGGCGGGACGCTCGGTAGCCTTGCCCTGATCATGGGTTTTGGCGCAATGCTGGGCAAAATGCTGGCAGACTGCGGTGGCGCACAACGTATCGCCACCACGCTGATTGCCAAATTTGGTAAAAAACACATCCAGTGGGCGGTGGTACTGACCGGTTTTACCGTTGGTTTTGCCCTGTTCTATGAAGTGGGCTTTGTGCTGATGCTGCCGCTGGTGTTTACCATCGCGGCTTCTGCGAATATTCCACTGCTGTATGTTGGTGTACCAATGGCGGCTGCACTGTCT > NC_000913/3546718‑3547002
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
